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Qu'est-ce que le superenroulement positif et négatif?

Qu'est-ce que le superenroulement positif et négatif?


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Est-ce que ce qui suit est correct ?

Superenroulement positif = l'enroulement de l'hélice d'ADN (ADN-B) sur elle-même lors de l'enroulement intensifié des deux supports d'ADN droit direction de la main

superenroulement négatif = l'enroulement de l'hélice d'ADN (ADN-B) sur elle-même lors du déroulement des deux brins d'ADN effectué dans la gauche direction de la main ?

Je suis un peu confus.


Selon ce powerpoint de la SIU School of Medicine :

Superenroulement droitier = superenroulement négatif (sous-enroulement)

Superbobinage gaucher = superenroulement positif

Et à partir de cette page Web de l'Université de Boston :

Si l'ADN se présente sous la forme d'une molécule circulaire ou si les extrémités sont maintenues de manière rigide de manière à former une boucle, une torsion excessive ou insuffisante conduit à l'état superenroulé. Le superenroulement se produit lorsque la molécule soulage la contrainte hélicoïdale en se tordant sur elle-même. Une torsion excessive conduit à super-enroulement positif, tandis que la sous-torsion conduit à surenroulement négatif.

Et enfin de wikibooks :

Superenroulements positifs et négatifs

  1. Superenroulement positif est la forme droitière à double hélice de l'ADN. Il est tordu fermement dans le sens de la main droite jusqu'à ce que l'hélice crée un nœud.

  2. Superenroulement négatif est la forme de l'ADN en double hélice pour gaucher.

Bien que l'hélice soit sous-enroulée et ait une faible contrainte de torsion, le nœud de supercoil négatif a une contrainte de torsion élevée. Les procaryotes et les eucaryotes ont généralement un ADN superenroulé négatif. Le superenroulement négatif est naturellement répandu car le superenroulement négatif prépare la molécule pour les processus qui nécessitent la séparation des brins d'ADN. Par exemple, le surenroulement négatif serait avantageux dans la réplication car il est plus facile à dérouler alors que le superenroulement positif est plus condensé et rendrait la séparation difficile.

Les topoisomérases déroulent l'hélice pour effectuer la transcription et la réplication de l'ADN. Une fois les protéines fabriquées, la matrice d'ADN s'enroule par la force pour produire de la chromatine. L'ARN polymérase influence également le brin d'ADN pour avoir deux directions superenroulées différentes. La région ARN polymérase qui a passé forme une supercoil négative tandis que la région ARN polymérase qui n'a pas passé forme une supercoil positive. Par ces processus, des superbobines sont générées.

Dans l'image suivante de livres Web :

(une) Superbobines positives (le segment avant d'une molécule d'ADN traverse le segment arrière de gauche à droite). (b) Superbobines négatives.

Cette vidéo, intitulée "formation de super bobine (positive et négative) d'ADN" devrait vous aider à visualiser cela.


Superenroulement de l'ADN optiquement

Le stress de torsion joue un rôle vital dans de nombreuses transactions génomiques, y compris la réplication et la transcription, et entraîne souvent un ADN sous-enroulé (surenroulé négativement). Ici, nous présentons une méthode à molécule unique, appelée Optical DNA Supercoiling (ODS), qui améliore notre capacité à étudier l'ADN surenroulé négativement. L'ODS étant basé sur des pincettes optiques à double piège, il est compatible avec un large éventail de fonctionnalités difficiles à combiner avec les méthodes traditionnelles de contrôle de la torsion de l'ADN. Cela inclut la possibilité d'imager l'ADN superenroulé avec la microscopie à fluorescence et de déplacer rapidement le substrat superenroulé entre différentes solutions tampons/protéines. Nous démontrons que l'ODS fournit des informations uniques et importantes à la fois sur les propriétés biomécaniques de l'ADN surenroulé négativement et sur la dynamique des interactions ADN-protéine sur l'ADN sous-enroulé.


Chapitre 10 Guide d'étude

• La plupart des espèces bactériennes contiennent un seul type de chromosome, mais il peut être présent en plusieurs exemplaires.

• Un chromosome typique a une longueur de quelques millions de paires de bases.

• Plusieurs milliers de gènes différents sont dispersés dans le chromosome. Les régions courtes entre les gènes adjacents sont appelées régions intergéniques.

• Une origine de réplication est nécessaire pour initier la réplication de l'ADN.

• Les chromosomes eucaryotes se présentent en ensembles. De nombreuses espèces sont diploïdes, ce qui signifie que les cellules somatiques contiennent 2 jeux de chromosomes.

• Un chromosome typique a une longueur de dizaines de millions à des centaines de millions de paires de bases.

• Les gènes sont dispersés dans tout le chromosome. Un chromosome typique contient entre quelques centaines et plusieurs milliers de gènes différents.

• Chaque chromosome contient de nombreuses origines de réplication qui sont entrecoupées toutes les 100 000 paires de bases environ.

• Chaque chromosome contient un centromère qui forme un site de reconnaissance pour les protéines kinétochores.

• Les télomères contiennent des séquences spécialisées situées aux deux extrémités du chromosome linéaire.

Fonction : Le superenroulement aide à réduire considérablement la taille du chromosome bactérien.
-Le superenroulement négatif affecte également la fonction de l'ADN en créant une tension sur les brins d'ADN qui peuvent être libérés par leur séparation. Cela favorise la séparation des brins d'ADN dans de petites régions, ce qui améliore les activités génétiques telles que la réplication et la transcription qui nécessitent la séparation des brins d'ADN.

Le sous-enroulement de l'ADN B provoque une superbobine négative (ou moins de tours) et le surenroulement de l'ADN B provoque une superbobine positive (ou plus de tours).
- Les conformations d'ADN montrées sur les figures 10.4b et d ne sont pas structurellement stables et n'apparaissent pas dans les cellules vivantes.

Topoisomères- Des conformations d'ADN qui diffèrent en ce qui concerne le superenroulement.
-Exemple : pas de superenroulement, superenroulement négatif et superenroulement positif.

Par conséquent, le superenroulement aide à réduire considérablement la taille du chromosome bactérien.

ADN-gyrase (Topoisomérase II) : la cassure double brin détend le superenroulement positif.

Topoisomérase I- la cassure simple brin détend le superenroulement négatif.

télomères- Régions spécialisées aux extrémités des chromosomes, importantes pour la réplication et la stabilité.
-Mesure de protection (chaque fois que l'ADN se divise/se réplique, ils raccourcissent et s'il devient trop court, il peut entrer dans une séquence génétique)

Trois types de séquences répétitives :
(1) Séquences uniques ou non répétitives
(2) Modérément répétitif
(3) Très répétitif

Séquences uniques ou non répétitives- Trouvé une ou plusieurs fois dans le génome.
- Comprend les gènes de structure ainsi que les zones intergéniques.
-Chez l'homme, ils représentent environ 41 % du génome (régions codant pour les protéines des gènes [2 %], introns [24 %] et régions uniques qui ne se trouvent pas dans les gènes [15 %]).

Modérément répétitif-Trouvé quelques centaines à plusieurs milliers de fois. Dans quelques cas, les séquences modérément répétitives sont des copies multiples du même gène.
-Comprend les gènes pour l'ARNr et les histones, les séquences qui régulent l'expression et la traduction des gènes et les éléments transposables.


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Évolution, adaptation et superenroulement ▿

Les propriétés géométriques et, dans une certaine mesure, physiques et informationnelles des molécules d'ADN fermées de manière covalente (ou des molécules qui peuvent être idéalement considérées comme fermées) sont déterminées par leur connectivité, c'est-à-dire le nombre de fois qu'un brin d'ADN est topologiquement lié à un autre. Tout lien qui ne peut pas être supprimé en faisant simplement glisser un brin sur un autre mais qui ne peut être supprimé qu'en cassant un brin ou deux est un lien topologique. Toutes les formes vivantes ont évolué pour maintenir le nombre de liens, par unité de longueur d'ADN, les plus adaptés à leurs environnements et conditions de croissance respectifs. L'étude de Champion et Higgins (4) offre un aperçu fascinant de la façon dont deux espèces bactériennes très proches contrôlent les états topologiques de leur ADN.

Au fil des ans, les propriétés de l'ADN circulaire fermé ont été systématiquement étudiées et modélisées avec succès (5), et certaines caractéristiques pertinentes de ces molécules sont présentées de manière descriptive ci-dessous. L'incision d'ADN double brin fermé de manière covalente produira une molécule relâchée dans laquelle, dans des conditions standard, un brin s'enroulera autour d'un autre avec une fréquence d'environ un tour pour 10,5 paires de bases. La longueur de la molécule (en paires de bases) divisée par le nombre de paires de bases par tour donne le nombre de liaison attendu d'ADN topologiquement relaxé. Resceller un tel ADN incisé entraîne la formation d'une distribution discrète de molécules avec différents nombres de liaison, centrée autour de la forme relâchée (Fig. ​ (Fig.1). 1). Les molécules dont les nombres de liaison sont supérieurs à celui de la forme relâchée sont appelées surenroulées, et celles dont les nombres de liaison sont inférieurs à celui de la forme relâchée sont appelées sous-enroulées. Dans une telle distribution, qui peut être approchée par une courbe en cloche, la probabilité d'occurrence de molécules avec des degrés croissants de sous- et de sur-enroulement chute de façon exponentielle. Les formes des deux types de molécules ne peuvent être décrites en trois dimensions que par un enroulement caractéristique de l'axe de la double hélice (Fig. ​ (Fig.1). 1 ). Étant donné que l'axe de la double hélice d'une molécule d'ADN double brin relâchée et fermée de manière covalente a la forme d'une bobine, suffisamment représentée en deux dimensions, un enroulement supplémentaire de cette bobine est appelé super-enroulement. Plus la différence entre le nombre de liaisons d'une espèce topologique donnée de molécules d'ADN et celui de sa forme relâchée respective est grande, plus l'espèce est surenroulée. Il est intéressant de noter que les molécules d'ADN double brin circulaires fermées de manière covalente isolées sous forme d'ADN plasmidique ou viral de presque tous les organismes étudiés sont plus enroulées que leurs formes respectives relâchées et refermées (voir, par exemple, référence 1). En d'autres termes, les distributions des nombres de liaison dans les populations de plasmides isolés à partir de cellules vivantes sont différentes des distributions correspondantes pour les molécules d'ADN relaxées. Compte tenu de cette observation, le superenroulement est considéré comme une propriété omniprésente des molécules d'ADN double brin fermées de manière covalente in vivo.

Représentation de bande dessinée des états de conformation de l'ADN circulaire fermé de manière covalente. Resceller une rupture dans l'ADN circulaire (a) entraînera une distribution de molécules d'ADN avec différentes propriétés topologiques (b): surenroulé (en haut), relâché (au centre) et sous-enroulé (en bas). Les doubles hélices des espèces d'ADN surenroulées et sous-enroulées se conforment à un état superhélicoïdal entrelacé (c). Un brin de la double hélice est représenté par une ligne de contour d'un ovale plan (gris) et un autre par une courbe ondulée topologiquement liée à la ligne de contour (noir).

La différence de superenroulement est au moins double. Premièrement, le nombre moyen de liaisons dans une population de molécules d'ADN isolées de cellules vivantes est généralement inférieur à celui d'une population d'ADN préparés en les cassant/refermant in vitro, ce qui suggère que l'ADN in vivo est sous-enroulé ou surenroulé négativement. Deuxièmement, les distributions des nombres de liaison dans les populations d'ADN isolés sont généralement plus larges que prévu sur la base des propriétés statistiques d'une distribution d'ADN relaxés, parfois avec des queues lourdes ou même deux modes. Ces propriétés ont été largement utilisées par de nombreux chercheurs pour déduire l'état du surenroulement de l'ADN à l'intérieur de la cellule et imputer des informations sur les facteurs contribuant au maintien et à la dynamique du superenroulement. L'étude présentée dans ce numéro (4) illustre un intérêt continu pour ce sujet, mais avec une torsion. Contrôle et régulation du surenroulement dans les organismes au plus près Escherichia coli et Salmonella enterica le sérovar Typhimurium devrait être très similaire, voire identique. En effet, les deux espèces possèdent l'ensemble des gènes impliqués dans l'établissement du superenroulement à l'état d'équilibre et/ou dans l'atténuation des conséquences des fluctuations des niveaux de superenroulement (2, 14). De plus, toutes les paires d'orthologues sont très similaires, avec seqA les gènes étant les plus éloignés, à 87,9% identité, et fis étant absolument conservé gyrA, rnhA, mukB, hautB, hns, parC, hautA, gyrB, rogner, mukF, hupA, hupB, infB, infA, et mukE sont entre seqA et fis et répertoriés ici par ordre croissant de pourcentage d'identité. Cependant, comme il se trouve, l'attente n'est pas remplie. On sait depuis un certain temps que la perte de fonction de hautA (le gène codant pour une activité topoisomérase qui réduit le superenroulement négatif [23]) est toléré par S. enterica sérovar Typhimurium mieux que par E. coli (20). Spécifiquement, hautA KO dans Salmonelle peut être construit en une seule étape et propagé sur plusieurs générations sans aucune mutation compensatoire. Alors qu'il a été rapporté que hautA KO dans E. coli soit ne peuvent pas être construits et/ou propagés sans mutations compensatoires (19) soit ne peuvent être générés qu'en plusieurs étapes (21). Les natures génétiques et biochimiques de certaines mutations compensatoires (6, 9, 18) indiquent que le principal mécanisme d'adaptation à la perte de hautA la fonction implique une réduction de l'activité de la gyrase (la gyrase est codée par gyrA et gyrB gènes et convertit l'ADN circulaire fermé détendu en ADN surenroulé négativement en utilisant l'énergie de l'ATP [8]).

Il a également été établi qu'en l'absence de hautA gène, la distribution des nombres de liaison dans une population de certaines molécules d'ADN plasmidique devient fortement biaisée vers des espèces extrêmement sous-enroulées et hyper-négatives (par exemple, référence 17). Ainsi, le lien entre le superenroulement à l'état stationnaire observable et les effets opposés de TopA et de la gyrase a été établi. L'intolérance à la hautA perte en E. coli est généralement attribuée à un sous-enroulement excessif de la matrice d'ADN atteint en présence de gyrase pleinement active, dont l'activité est déséquilibrée dans hautA-mutants déficients. Étant donné que chez les mutants des deux espèces, le hautA gène est manquant, Champion et Higgins ont estimé que la différence doit être du côté de la gyrase de l'équation. (Bien sûr, la tolérance est un phénomène à l'échelle de l'organisme et peut s'expliquer par des différences encore mal comprises dans la façon dont deux espèces gèrent les conséquences d'un sous-enroulement excessif de l'ADN.) Dans l'étude, les auteurs se sont concentrés sur la sous-unité GyrB de la gyrase comme une suite à un travail antérieur du même groupe. Salmonelle GyrB est 96,6% identique à son E. coli homologue cependant, leurs résultats ont démontré que Salmonelle GyrB, ainsi qu'un mutant à un seul résidu catalytiquement défectueux qui peut être raisonnablement bien toléré par Salmonelle, a compromis la capacité de E. coli grandir. L'explication la plus simple de cette observation est que E. coli est sensible aux niveaux d'activité de superenroulement de la gyrase et que lorsque l'activité tombe en dessous d'un certain seuil, une croissance efficace ne peut pas être soutenue. Ceci est probablement dû au fait que l'ADN devient insuffisamment surenroulé négativement. Mais ce qui est insuffisant pour E. coli peut être bien dans la plage acceptable pour Salmonelle après tout, les chemins évolutifs des insectes ont divergé il y a plusieurs millions d'années. En effet, les plasmides isolés de Salmonelle sont moins sous-placées que celles isolées de E. coli (4, 20), suggérant que l'équilibre entre la relaxation et le superenroulement dans Salmonelle est décalé par rapport à celui de E. coli, à un état un peu plus détendu.

Qualitativement, l'existence d'états d'équilibre spécifiques à l'espèce peut être rationalisée comme résultant de E. coli ayant une relaxation plus faible ou une activité de superenroulement plus élevée que Salmonelle. Bien que la non-viabilité de E. coli portant un allèle mutant déficient en superenroulement de gyrB plaide en faveur de E. coli sensibilité à l'activité de superenroulement en soi, la question de l'équilibrage ne peut être résolue que par un échange réciproque d'orthologues entre les espèces.

Le superenroulement à l'état d'équilibre de l'ADN plasmidique, qui est couramment analysé par la méthode de comptage de bandes avec un gel après électrophorèse en présence d'un intercalateur d'ADN dans une (10) ou deux (12) dimensions, est observé in vitro après élimination de tous protéines. In vivo, cependant, les supercoils de l'ADN sous-enroulé peuvent être liés par des protéines qui enroulent l'ADN autour d'eux-mêmes, contraignant efficacement les boucles d'ADN superenroulé, tout comme les histones chez les eucaryotes, ou les supercoils peuvent être libérés par des protéines, participant librement à diverses transactions d'ADN et stress. -réactions induites. Une de ces réactions est une transition de la forme B droitière de la double hélice à la forme Z gauche de l'ADN dans des séquences contenant des pistes GC. La transition se produit à un certain niveau de seuil de contrainte de torsion dans l'ADN sous-enroulé avec un certain déficit du nombre de liaisons, toutes les molécules d'ADN avec des degrés égaux ou supérieurs de sous-enroulement extruderont la piste dans la forme Z (15). Une telle extrusion, à son tour, consommera des superbobines libres, déplaçant efficacement la distribution des nombres de liaison vers des espèces d'ADN moins sous-enroulées. Lorsque la gyrase agit sur ce substrat “relaxed”, elle introduira des superbobines négatives supplémentaires dont la présence peut être visualisée sur un gel bidimensionnel ainsi que la rupture de distribution associée à la transition B-to-Z. Ceci est en comparaison avec la distribution des nombres de liaison dans la population du même plasmide sans le segment GC. Champion et Higgins ont constaté que le surplus de superbobines négatives, pompé dans l'ADN contenant le GC par la gyrase, était significativement moindre dans Salmonelle que dans E. coli, à tel point que le Salmonelle distribution ne semble pas avoir d'espèces à ADN suffisamment stressées pour subir la transition conformationnelle. Ainsi, non seulement le niveau de surenroulement en régime permanent dans Salmonelle moins que cela dans E. coli, mais l'étendue du superenroulement libre sans contrainte est également moindre : le superenroulement libre semble représenter plus de la moitié du superenroulement apparent dans E. coli et pour moins de la moitié de cela en Salmonelle. Il s'ensuit que la majorité des superbobines négatives dans Salmonelle, contrairement à celui de E. coli, sont limités par les protéines, et on pourrait s'attendre à ce que se passer des protéines qui le font aura un effet plus néfaste sur Salmonelle que sur E. coli. Les résultats de l'étude et d'autres preuves sont en accord avec cette hypothèse. Salmonelle était beaucoup plus sensible que E. coli à la présence de MukB et H-NS, qui sont connus pour contraindre l'ADN sous-enroulé in vivo et in vitro (16, 22). Dans le même temps, l'absence de SeqA, qui peut séquestrer également des superbobines positives (11), entre autres, n'a eu aucun effet perceptible sur Salmonelle croissance.

Bien sûr, ni les histones ni aucune autre protéine capable de contraindre les superenroulements négatifs ne peuvent à elles seules modifier les caractéristiques topologiques de l'ADN, telles que mesurées par les changements de distribution des nombres de liaison. Ces protéines ne peuvent envelopper l'ADN que de manière à générer une contrainte de torsion positive dans une partie sans protéine de l'ADN fermé de manière covalente, ce qui équivaut à un surenroulement. Lorsque le stress est éliminé par les topoisomérases, qui peuvent réagir sur l'ADN surenroulé positivement, l'ADN se relâche alors qu'il est lié par les protéines, et lorsque les protéines sont éliminées, l'ADN prend sa conformation sous-enroulée. Étant donné que les potentiels d'élimination des superbobines positives sont indiscernables entre E. coli et Salmonelle (17), il est tout à fait plausible que les variations dans la séquence des Salmonelle La gyrase n'affecte que son activité de superenroulement, pas sa capacité à détendre l'ADN surenroulé et positivement superenroulé.

Il est également plausible, bien que moins facilement falsifiable, que Salmonelle le recours au superenroulement contraint représente un choix évolutif conforme à la Salmonelle environnement. La principale différence écologique entre le pathogène intracellulaire Salmonelle et la bactérie commensale E. coli est-ce Salmonelle doit survivre dans les phagolysosomes des macrophages (3), où il est soumis à un stress oxydatif important (7). Il a été démontré que l'enveloppement de l'ADN dans des nucléosomes protège l'ADN des dommages oxydatifs (13). Il reste à voir si la ou les méthodes de contrainte de supercoil “pratique” par Salmonelle a un effet protecteur similaire.


Biologie des types de milieux à contraste positif et négatif

Après un an que les rayons X ont été découverts, l'air divin est devenu le premier agent de contraste reconnu dans les examens radiographiques du thorax. Les premiers relevés de contraste ont été effectués sur la partie supérieure de la terre à IG en utilisant des sels de Bi sur un être animé.

Les solutions de sulfate de baryum et de bismuth étaient utilisées en conjonction avec le radiomètre, le sulfate de Ba ayant été utilisé avec différents additifs de tous les temps depuis pour l'imagination du terrain GI. Le premier contraste à base de I utilisé était un dérivé du cycle chimique de la pyridine, auquel l'atome I individuel pouvait être lié afin de le rendre radio-opaque.

Les produits de contraste à base d'iode ont été utilisés depuis toujours. Le contraste radiographique est utilisé depuis plus d'un siècle pour augmenter le contraste des images radiographiques.

Les produits de contraste (également connus sous le nom d'agents de contraste) sont des substances utilisées pour mettre au premier plan les pays de la structure organique en contraste radiographique avec leur tissu englobant. Les supports de contraste améliorent l'opacité sans fil et la densité optique du pays sous la sonde de sorte que le tissu ou la construction absorbant les fonctions dérivées soit suffisant pour produire un contraste égal avec la construction suivante.

Il améliore les informations contenues dans l'image produite par l'équipement de diagnostic médical comme la radiologie traditionnelle et numérique, la spécialité médicale atomique, les ultrasons, la résonance magnétique. Lorsqu'ils sont utilisés à des fins d'imagerie, les produits de contraste peuvent être administrés par injection, interpolation ou consommation.

Le produit de contraste est divisé en positif et négatif. Les types négatifs sont ceux qui s'imprègnent moins et seront affichés en noir ou en gris. Les produits de contraste négatifs sont radiotransparents et leur figure atomique est faible. Les gaz sont normalement utilisés pour produire un contraste négatif sur les images radiographiques. Pour les illustrations, l'air ou le dioxyde de carbone.

L'air est introduit par le patient lors de l'examen radiographique, illustration lorsque le patient respire lors de la radiographie pulmonaire. Le dioxyde de carbone est introduit dans le terrain GI en conjonction avec le sulfate de Ba pour visualiser la forme muqueuse, illustration du repas Ba à double contraste. ou Gris. Ceux-ci sont opaques sans fil et ont une figure atomique élevée.

Les solutions à base de baryum et d'iode sont utilisées dans l'imagination médicale pour produire un contraste positif. Les contrastes positifs et négatifs peuvent être utilisés ensemble en double contraste pour produire une image radiographique. Pour les illustrations, il s'agit de composés iodés. Solutions de sulfate de baryum utilisées dans l'imagination gastro-intestinale.

Les caractéristiques des solutions de Ba les rendent adaptées à l'imagination du terrain gastro-intestinal (GI), les caractéristiques telles que la figure atomique élevée produisent un bon contrat radiographique, des propriétés de surface stables, indissolubles et de première classe de la membrane muqueuse GI et en plus relativement bon marché . Suspension de baryum composée d'additifs de sulfate de Ba pur assortis et d'agents diffusants, elle est maintenue en suspension dans H2O. . Les solutions doivent être administrées à la température de la structure organique pour une meilleure tolérance du patient et en plus de réduire la crampe du côlon.

Les solutions de sulfate de baryum sont contre-indiquées dans les pathologies, suspicion de garrot ou recherche de site d'inoculation, mégacôlon toxique, occlusion intestinale paralytique, suspicion de sténose partielle ou complète, avant chirurgie ou endoscopie. Produits de contraste à base d'iode utilisés en imagination médicale. La plupart des produits de contraste d'imagerie utilisés dans la section d'imagerie sont des préparations organiques solubles dans l'H2O dans lesquelles les molécules I sont l'élément opaque. Il contient, I atomes, bord à une molécule porteuse.

Il sert à maintenir le I dans le composé stable et à le porter à l'organe lors de l'examen. Les composés à base d'iode sont divisés en quatre types et dépendent de leur construction moléculaire, le groupe est constitué de monomères ioniques, de gradateurs ioniques, de monomères non ioniques et de gradateurs non ioniques. Les milieux de contraste sont nécessaires dans l'examen radiologique parce que la figure de la sonde au la radiologie nécessitera l'élimination du contraste dans la structure organique du patient par la veine ou l'artère. Une illustration est semblable à l'urogramme endoveineux (IVU).

Au niveau des produits de contraste ont un deux types de I, il existe des ioniques ou non aa‚ ” ioniques ses respects à la construction chimique. Fondamentalement, seuls les castagnettes et l'air peuvent voir au rayon X du film. Si besoin de définir la transition pisse ou le flux sanguin au niveau des vassaux, les produits de contraste qui ont contenu le I sont utilisés pour augmenter la densité de la pisse ou du sang. Les conséquences sont que le flux d'urine ou de sang aura l'air blanc sur la radiographie du film, c'est simplement comme l'os sur la radiographie du film.

Si vous souhaitez utiliser les produits de contraste, le patient doit suivre quelques préparatifs pour effectuer le processus. Normalement, le patient sera invité à jeûner, cela signifie que le patient ne peut prendre aucun nutriment ou s'imbiber d'environ 4 à 6 heures avant le début de l'examen. Mais avoir un certain statut que le patient ne peut pas suivre la préparation, le patient doit prendre des précautions particulières et doit faire attention à certains risques. Le certain statut que le patient ne peut pas suivre la préparation parce que le patient a des antécédents précis de réaction allergique, ancienne réaction aux produits de contraste, la vieille réaction au médicament, l'asthme, les affections mammaires sont anormales, le diabète terrible et les produits de contraste en plus ne favorisent pas les personnes âgées d'environ 65 ans et plus et les enfants de moins de 6 mois.

Le cas échéant, pour le patient diabétique et sous glucophage, le patient doit arrêter le médicament 48 heures avant de faire l'examen nécessitant une endoveineuse ou d'acquérir l'injection de produit de contraste. Le radiologue doit en outre fixer un certain statut avant de faire l'examen, le radiologue doit associer l'anatomie, la physiologie et en plus la pathologie. En plus de la bonne sélection et de l'élimination de tout équipement à utiliser. Doit connaître les normes pour prendre la veine et connaître les emplois possibles si cela se produit.

En outre, à partir des produits de contraste, le patient peut toujours acquérir un certain risque, mais la réaction du risque est très faible. Dans un premier temps, le médecin doit informer le patient sur les avantages des produits de contraste et outre le danger. Les produits de contraste sont comme la drogue que tout le monde connaît et avec laquelle tout le monde est familier. Mais, le nouveau de I qui incorporant des produits de contraste sont vraiment sûrs.

Cependant, le contraste, comme tous les médicaments, en plus d'inclure l'acétaminophène, il existe toujours une réaction de danger possible aux produits de contraste. Son classé en trois types, qui est léger, modéré et sévère. Si le produit de contraste n'est pas utilisé dans le grenier, les réactions seront réduites. La plupart des réactions ne nécessiteront aucune intervention, légères et transitoires, elles se produiront dans les 20 premières procédures après l'injection.

Une réaction légère nécessite simplement une observation attentive du patient. Les symptômes d'une réaction légère sont des nausées, une sensation de chaleur pouvant être associée à des bouffées de chaleur, de la lividité, une sensation gustative métallique dans la cavité buccale, des éternuements, une rhinorrhée, des frottements et des sueurs. Le traitement des réactions bénignes implique normalement simplement l'observation du patient et le réconfort. Chez les modérés, il s'agit d'une réaction plus terrible dans laquelle une intervention médicale est nécessaire.

Les symptômes inclus sont le prurit, les douleurs thoraciques, l'érythème, les douleurs abdominales, les évanouissements vasogaux, les douleurs abdominales. L'intervention d'une réaction modérée peut changer. La compression et le vêtement serré doivent être relâchés et le patient rassuré. Une réaction sévère est nécessaire pour obtenir l'avis médical instantanément.


Qu'est-ce que le superenroulement positif et négatif? - La biologie

Le surenroulement de l'ADN est important pour l'emballage de l'ADN dans toutes les cellules. Parce que la longueur de l'ADN peut être des milliers de fois celle d'une cellule, l'emballage de ce matériel génétique dans la cellule ou le noyau (chez les eucaryotes) est un exploit difficile. Le superenroulement de l'ADN réduit l'espace et permet d'emballer beaucoup plus d'ADN. Chez les procaryotes, les superbobines plétonémiques sont prédominantes, en raison du chromosome circulaire et de la quantité relativement faible de matériel génétique. Chez les eucaryotes, le superenroulement de l'ADN existe à de nombreux niveaux de superenroulements plétonémiques et solénoïdes, le superenroulement solénoïde s'avérant le plus efficace pour compacter l'ADN. Le superenroulement solénoïdal est réalisé avec des histones pour former une fibre de 10 nm. Cette fibre est ensuite enroulée en une fibre de 30 nm, et encore enroulée sur elle-même plusieurs fois plus.

L'encapsidation de l'ADN est considérablement augmentée lors d'événements de division nucléaire tels que la mitose ou la méiose, où l'ADN doit être compacté et séparé en cellules filles. Les condensines et les cohésines sont Maintenance structurelle du chromosome protéines qui aident à la condensation des chromatides sœurs et à la liaison du centromère dans les chromatides sœurs. Ces protéines SMC induisent des superbobines positives.

Le superenroulement est également requis pour la synthèse d'ADN/ARN. Parce que l'ADN doit être déroulé pour l'action de l'ADN/ARN polymérase, des superbobines en résulteront. La région en avant du complexe de polymérase sera déroulée, cette contrainte est compensée par des superbobines positives en avant du complexe. Derrière le complexe, l'ADN est rembobiné et il y aura compensatoire superbobines négatives. Il est important de noter que les topoisomérases telles que l'ADN gyrase (topoisomérase de type II) jouent un rôle dans le soulagement d'une partie du stress lors de la synthèse d'ADN/ARN.


Résistance aux agents ciblant la topoisomérase

John L. Nitiss , Karin C. Nitiss , dans Encyclopedia of Cancer (deuxième édition) , 2002

Introduction

Les topoisomérases d'ADN sont les cibles principales de nombreux agents antitumoraux cliniquement importants. Il existe deux grandes familles de topoisomérases : les enzymes de type I qui introduisent des coupures simple brin transitoires dans l'ADN et les enzymes de type II, qui chez les eucaryotes sont des enzymes dimères qui font des coupures double brin dans l'ADN. Les enzymes de type I et de type II sont les cibles d'agents anticancéreux importants. Les principaux médicaments agissant contre les topoisomérases de type I sont les camptothécines, dont le topotécan et l'irinotécan. Une gamme plus large d'agents agissent contre la topoisomérase II eucaryote, y compris les anthracyclines doxorubicine et daunomycine, les épipodophyllotoxines étoposide et téniposide, et d'autres agents, y compris l'amsacrine et la mitoxantrone. Le puissant agent intercalant dactinomycine a montré une activité contre la topoisomérase I et la topoisomérase II, tout comme d'autres agents expérimentaux qui n'ont pas encore été introduits en clinique.

Les topoisomérases d'ADN participent à une grande variété de fonctions cellulaires. La découverte des topoisomérases d'ADN a été motivée par le problème de la séparation des brins d'ADN après une réplication semi-conservatrice de l'ADN, et il est clair que les topoisomérases jouent un rôle essentiel au cours de ce processus. Subsequent work has indicated that topoisomerases also play key roles in transcription, chromosome structure, and recombination. The central role of topoisomerases in DNA metabolism, particularly in proliferating cells, might suggest that these enzymes would be potential targets for anticancer agents. While some agents have been identified that act mainly by inhibiting the catalytic activity of topoisomerases, the main action of topoisomerase-targeting drugs in clinical use is to convert the enzyme into a unique form of DNA damage. This unique mechanism of action of topoisomerase-targeting agents dictates many of the potential resistance mechanisms.


Contenu

Paul Rozin and Edward Royzman proposed four elements of the negativity bias in order to explain its manifestation: negative potency, steeper negative gradients, negativity dominance, and negative differentiation. [4]

Negative potency refers to the notion that, while possibly of equal magnitude or emotionality, negative and positive items/events/etc. are not equally salient. Rozin and Royzman note that this characteristic of the negativity bias is only empirically demonstrable in situations with inherent measurability, such as comparing how positively or negatively a change in temperature is interpreted.

With respect to positive and negative gradients, it appears to be the case that negative events are thought to be perceived as increasingly more negative than positive events are increasingly positive the closer one gets (spatially or temporally) to the affective event itself. In other words, there is a steeper negative gradient than positive gradient. For example, the negative experience of an impending dental surgery is perceived as increasingly more negative the closer one gets to the date of surgery than the positive experience of an impending party is perceived as increasingly more positive the closer one gets to the date of celebration (assuming for the sake of this example that these events are equally positive and negative). Rozin and Royzman argue that this characteristic is distinct from that of negative potency because there appears to be evidence of steeper negative slopes relative to positive slopes even when potency itself is low.

Negativity dominance describes the tendency for the combination of positive and negative items/events/etc. to skew towards an overall more negative interpretation than would be suggested by the summation of the individual positive and negative components. Phrasing in more Gestalt-friendly terms, the whole is more negative than the sum of its parts.

Negative differentiation is consistent with evidence suggesting that the conceptualization of negativity is more elaborate and complex than that of positivity. For instance, research indicates that negative vocabulary is more richly descriptive of the affective experience than that of positive vocabulary. [5] Furthermore, there appear to be more terms employed to indicate negative emotions than positive emotions. [6] [7] The notion of negative differentiation is consistent with the mobilization-minimization hypothesis, [8] which posits that negative events, as a consequence of this complexity, require a greater mobilization of cognitive resources to deal with the affective experience and a greater effort to minimize the consequences.

Social judgments and impression formation Edit

Most of the early evidence suggesting a negativity bias stems from research on social judgments and impression formation, in which it became clear that negative information was typically more heavily weighted when participants were tasked with forming comprehensive evaluations and impressions of other target individuals. [9] [10] Generally speaking, when people are presented with a range of trait information about a target individual, the traits are neither "averaged" nor "summed" to reach a final impression. [11] When these traits differ in terms of their positivity and negativity, negative traits disproportionately impact the final impression. [12] [13] [14] [15] [16] This is specifically in line with the notion of negativity dominance [4] (see "Explanations" above).

As an example, a famous study by Leon Festinger and colleagues investigated critical factors in predicting friendship formation the researchers concluded that whether or not people became friends was most strongly predicted by their proximity to one another. [17] Ebbesen, Kjos, and Konecni, however, demonstrated that proximity itself does not predict friendship formation rather, proximity serves to amplify the information that is relevant to the decision of either forming or not forming a friendship. [18] Negative information is just as amplified as positive information by proximity. As negative information tends to outweigh positive information, proximity may predict a failure to form friendships even more so than successful friendship formation. [2]

One explanation that has been put forth as to why such a negativity bias is demonstrated in social judgments is that people may generally consider negative information to be more diagnostic of an individual's character than positive information, that it is more useful than positive information in forming an overall impression. [19] This is supported by indications of higher confidence in the accuracy of one's formed impression when it was formed more on the basis of negative traits than positive traits. [2] [14] People consider negative information to be more important to impression formation and, when it is available to them, they are subsequently more confident.

An oft-cited paradox, [20] [21] a dishonest person can sometimes act honestly while still being considered to be predominantly dishonest on the other hand, an honest person who sometimes does dishonest things will likely be reclassified as a dishonest person. It is expected that a dishonest person will occasionally be honest, but this honesty will not counteract the prior demonstrations of dishonesty. Honesty is considered more easily tarnished by acts of dishonesty. Honesty itself would then be not diagnostic of an honest nature, only the absence of dishonesty.

The presumption that negative information has greater diagnostic accuracy is also evident in voting patterns. Voting behaviors have been shown to be more affected or motivated by negative information than positive: people tend to be more motivated to vote against a candidate because of negative information than they are to vote for a candidate because of positive information. [22] [23] As noted by researcher Jill Klein, "character weaknesses were more important than strengths in determining. the ultimate vote". [23]

This diagnostic preference for negative traits over positive traits is thought to be a consequence of behavioral expectations: there is a general expectation that, owing to social requirements and regulations, people will generally behave positively and exhibit positive traits. Contrastingly, negative behaviors/traits are more unexpected and, thus, more salient when they are exhibited. [1] [2] [10] [19] [24] The relatively greater salience of negative events or information means they ultimately play a greater role in the judgment process.

Attribution of Intentions Edit

Studies reported in a paper in the Journal of Experimental Psychology: General by Carey Morewedge (2009) found that people exhibit a negativity bias in attribution of external agency, such that they are more likely to attribute negative outcomes to the intentions of another person than similar neutral and positive outcomes. [25] In laboratory experiments, Morewedge found that participants were more likely to believe that a partner had influenced the outcome of a gamble in when the participants lost money than won money, even when the probability of winning and losing money was held even. This bias is not limited to adults. Children also appear to be more likely to attribute negative events to intentional causes than similarly positive events. [26]

Cognition Edit

As addressed by negative differentiation, [4] negative information seems to require greater information processing resources and activity than does positive information people tend to think and reason more about negative events than positive events. [8] [27] Neurological differences also point to greater processing of negative information: participants exhibit greater event-related potentials when reading about, or viewing photographs of, people performing negative acts that were incongruent with their traits than when reading about incongruent positive acts. [28] [29] [30] This additional processing leads to differences between positive and negative information in attention, learning, and memory.

Attention Modifier

A number of studies have suggested that negativity is essentially an attention magnet. For example, when tasked with forming an impression of presented target individuals, participants spent longer looking at negative photographs than they did looking at positive photographs. [10] Similarly, participants registered more eye blinks when studying negative words than positive words [31] (blinking rate has been positively linked to cognitive activity [32] [33] ). Also, people were found to show greater orienting responses following negative than positive outcomes, including larger increases in pupil diameter, heart rate, and peripheral arterial tone [34] [35]

Importantly, this preferential attendance to negative information is evident even when the affective nature of the stimuli is irrelevant to the task itself. The automatic vigilance hypothesis has been investigated using a modified Stroop task. [36] Participants were presented with a series of positive and negative personality traits in several different colors as each trait appeared on the screen, participants were to name the color as quickly as possible. Even though the positive and negative elements of the words were immaterial to the color-naming task, participants were slower to name the color of negative traits than they were positive traits. This difference in response latencies indicates that greater attention was devoted to processing the trait itself when it was negative.

Aside from studies of eye blinks and color naming, Baumeister and colleagues noted in their review of bad events versus good events [2] that there is also easily accessible, real-world evidence for this attentional bias: bad news sells more papers and the bulk of successful novels are full of negative events and turmoil. When taken in conjunction with the laboratory-based experiments, there is strong support for the notion that negative information generally has a stronger pull on attention than does positive information.

Learning and memory Edit

Learning and memory are direct consequences of attentional processing: the more attention is directed or devoted toward something, the more likely it is that it will be later learned and remembered. Research concerning the effects of punishment and reward on learning suggests that punishment for incorrect responses is more effective in enhancing learning than are rewards for correct responses—learning occurs more quickly following bad events than good events. [37] [38]

Drs. Pratto and John addressed the effects of affective information on incidental memory as well as attention using their modified Stroop paradigm (see section concerning "Attention"). Not only were participants slower to name the colors of negative traits, they also exhibited better incidental memory for the presented negative traits than they did for the positive traits, regardless of the proportion of negative to positive traits in the stimuli set. [36]

Intentional memory is also impacted by the stimuli's negative or positive quality. When studying both positive and negative behaviors, participants tend to recall more negative behaviors during a later memory test than they do positive behaviors, even after controlling for serial position effects. [39] [40] There is also evidence that people exhibit better recognition memory and source memory for negative information. [31] [41]

When asked to recall a recent emotional event, people tend to report negative events more often than they report positive events, [42] and this is thought to be because these negative memories are more salient than are the positive memories. People also tend to underestimate how frequently they experience positive affect, in that they more often forget the positively emotional experiences than they forget negatively emotional experiences. [43]

Decision-making Edit

Studies of the negativity bias have also been related to research within the domain of decision-making, specifically as it relates to risk aversion or loss aversion. When presented with a situation in which a person stands to either gain something or lose something depending on the outcome, potential costs were argued to be more heavily considered than potential gains. [44] [1] [37] [45] The greater consideration of losses (i.e. negative outcomes) is in line with the principle of negative potency as proposed by Rozin and Royzman. [4] This issue of negativity and loss aversion as it relates to decision-making is most notably addressed by Drs. Daniel Kahneman's and Amos Tversky's prospect theory.

However, it is worth noting that Rozin and Royzman were never able to find loss aversion in decision making. [4] They wrote, "in particular, strict gain and loss of money does not reliably demonstrate loss aversion". This is consistent with the findings of a recent review of more than 40 studies of loss aversion focusing on decision problems with equal sized gains and losses. [46] In their review, Yechiam and Hochman (2013) did find a positive effect of losses on performance, autonomic arousal, and response time in decision tasks, which they suggested is due to the effect of losses on attention. This was labeled by them as loss attention. [46]

Politics Edit

Research points to a correlation between political affiliation and negativity bias, [47] [48] where conservatives are more sensitive to negative stimuli and therefore tend to lean towards right-leaning ideology which considers threat reduction and social-order to be its main focus. [49] Individuals with lower negativity bias tend to lean towards liberal political policies such as pluralism and are accepting of diverse social groups which by proxy could threaten social structure and cause greater risk of unrest. [50]

Infancy Edit

Although most of the research concerning the negativity bias has been conducted with adults (particularly undergraduate students), there have been a small number of infant studies also suggesting negativity biases.

Infants are thought to interpret ambiguous situations on the basis of how others around them react. When an adult (e.g. experimenter, mother) displays reactions of happiness, fear, or neutrality towards target toys, infants tend to approach the toy associated with the negative reaction significantly less than the neutral and positive toys. [51] [52] [53] [54] Furthermore, there was greater evidence of neural activity when the infants were shown pictures of the "negative" toy than when shown the "positive" and "neutral" toys. [55] Although recent work with 3-month-olds suggests a negativity bias in social evaluations, as well, [56] there is also work suggesting a potential positivity bias in attention to emotional expressions in infants younger than 7 months. [57] [58] [59] A review of the literature conducted by Drs. Amrisha Vaish, Tobias Grossman, and Amanda Woodward suggests the negativity bias may emerge during the second half of an infant's first year, although the authors also note that research on the negativity bias and affective information has been woefully neglected within the developmental literature. [54]

Aging and older adults Edit

Some research indicates that older adults may display, at least in certain situations, a positivity bias or positivity effect. [60] [61] [62] Proposed by Dr. Laura Carstensen and colleagues, the socioemotional selectivity theory outlines a shift in goals and emotion regulation tendencies with advancing age, resulting in a preference for positive information over negative information. Aside from the evidence in favor of a positivity bias, though, there have still been many documented cases of older adults displaying a negativity bias. [63] [64]


What is positive and negative supercoiling? - La biologie

Some scientists (particularly scientists involved in biological sciences) talk of “positive controls” (other scientists may call these a “reference” or a “standard”) and “negative controls”. The terms don’t make a lot of sense, until you understand what they mean and then it’s quite easy.

Examples from everyday life.

Positive controls. Have you ever bought a new car? Did you have a test drive first to get an idea of how the car performs? The test drive tells you the standard that you can expect. When you get your new car, it might not be the actual car you took on a test drive, but it should be the same model and so perform similarly. Now suppose you take delivery of your new car, and it doesn’t match up to the car you took on a test drive. Maybe it doesn’t accelerate as well, or some accessories are missing. You could reasonably go back to the showroom, point out the deficiencies and get your new car repaired, replaced or maybe even ask for your money back.

The test drive was your “positive control” – it set the standard, it showed you what should happen. If you hadn’t taken the test drive, you might not have realised that your new car was defective. That’s why positive controls are so useful – they tell you what to expect if things go well.

Negative controls. A negative control is the opposite of a positive control. It tells you what should happen if your experimental intervention does nothing. Suppose you have heard that adding grated beetroot to chocolate cake mix makes it tastes even better. So you head to the kitchen and bake a chocolate cake with beetroot in it and it tastes great! Mais attendez! How do you know it’s any better than your normal chocolate cake? The only way to test this is to bake a chocolate cake using your normal recipe – instead of adding beetroot you just use the regular ingredients. This is your “negative control” – it sets the standard if you do nothing to alter the recipe. So now you can compare the beetroot-enhanced cake with the normal one and see whether there really is a difference.

Scientific examples.

For scientists, positive controls are very helpful because it allows us to be sure that our experimental set-up is working properly. For example, suppose we want to test how well a new drug works and we have designed a laboratory test to do this. We test the drug and it works, but has it worked as well as well as it should? The only way to be sure is to compare it to another drug (the positive control) which we know works well. The positive control drug is also useful because it tells us our experimental equipment is working properly. If the new drug doesn’t work, we can rule out a problem with our equipment by showing that the positive control drug works.

The “negative-control” sets what we sometimes call the “baseline”. Suppose we are testing a new drug to kill bacteria (an antibiotic) and to do this we are going to count the number of bacteria that are still alive in a test tube after we add the drug. We could set up an experiment with three tubes.

  1. One tube could contain the drug we want to test.
  2. The second tube would contain our positive control (a different drug which we know will kill the bacteria)
  3. The last tube is our negative control – it contains a drug which we know has no effect on the bacteria. This tells us how many bacteria would be alive if we didn’t kill any of them.

If the new drug is working, there should be fewer cells left alive in the first tube compared to the last tube and ideally then number of cells still alive (if any) should be the same in the first and second tube.

So “controls” are important to scientists because it helps us validate the performance of our experimental set-up and tells us what effects we can reasonably expect to observe.

If you would like anymore information on why scientists do what they do then please contact


Voir la vidéo: Superenroulement de lADN: 2ème partie (Octobre 2022).