Informations

C13. Liens et références - Biologie

C13. Liens et références - Biologie


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

  1. Vacic, V. et al. Caractérisation des caractéristiques de reconnaissance moléculaire, des MoRF et de leurs partenaires de liaison. Journal of Proteome Research 6, 2351 (2007) DOI : 10.1021/pr0701411
  2. Mohan, A. et al. Analyse des caractéristiques de reconnaissance moléculaire (MoRF). J Mol Biol. 362, 1043 (2006)
  3. Junker, J et al. Sciences 323, p. 633-637 (2009)
  4. Lee, J. Surface Sites pour l'ingénierie du contrôle allostérique dans les protéines. Sciences 322, 438 (2008)
  5. Rea, A. Mécanisme de pliage induit par le ligand d'une variante sans hélice déployée de manière native du lapin I-BABP. Biochimie, 48, 7556 (2009)
  6. Boehr, D. et Wright, P. Comment les protéines interagissent. Sciences 320, 1429 (2008)
  7. Lange, O. . Sciences 320 : 1471 (2008)
  8. Greuninger, D. Conçu Association Protéine-Protéine. Science. 319, page 206 (2008)
  9. Chen, B. Structure d'un noyau gp120 du virus de l'immunodéficience simienne non lié. La nature. 433, page 834 (2005)
  10. Koshland, D. et Hamadani, K. Protéomique et modèles de coopérativité enzymatique. J. Biol. Chem. 277, page 46841 (2002)
  11. Schotte, F. Regarder une protéine pendant qu'elle fonctionne avec une cristallographie aux rayons X résolue en temps 50 ps. Science, 300, page 1944 (2003)
  12. James, L. Anticorps multispécificité médiée par la diversité conformationnelle. 299, page 1362 (2003)
  13. Chueh, P. Clonage Moléculaire Et Caractérisation D'une Hydroquinone Oxydase (tNOX) Associée Aux Tumeurs, Liée À La Croissance Et Conservant Le Temps (NADH) De La Surface Cellulaire HeLa. Biochimie. 41, page 3732 (2002)
  14. Morre et al. Base biochimique de l'horloge biologique. Biochimie, 41, page 11941 (2002)
  15. Lipton et al. Oxyde nitrique et respiration. (à propos du rôle de l'Hb dans le transport du NO). 413, pages 118, 171 (2001)
  16. Volkman et al. Comportement allostérique à deux états dans une protéine de signalisation à domaine unique. 291, pages 2329, 2429 (2001)

Résumé : Famille Peptidase C13

Pfam inclut des annotations et des informations supplémentaires sur la famille provenant de différentes sources. Ces sources sont accessibles via les onglets ci-dessous.

Le groupe Pfam coordonne l'annotation des familles Pfam dans Wikipédia, mais nous n'avons pas encore attribué d'article Wikipédia à cette famille. Si vous pensez qu'un article Wikipédia en particulier fournit une bonne annotation, veuillez nous le faire savoir.

Cet onglet contient les informations d'annotation qui sont stockées dans la base de données Pfam. Au fur et à mesure que nous utiliserons Wikipedia comme source principale d'annotation, le contenu de cet onglet sera progressivement remplacé par l'onglet Wikipedia.


Introduction

Le cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) est le principal cancer menaçant le pronostic vital dans le monde [1, 2]. Avec les progrès de la chirurgie, de la radiothérapie, de la chimiothérapie et de l'immunothérapie, le pronostic du CPNPC s'est considérablement amélioré [3], mais les résultats cliniques du CPNPC à un stade avancé restent insatisfaits. Des études récentes ont rapporté que la réactivité de l'immunothérapie est fortement déterminée par les caractéristiques du microenvironnement tumoral (TME), dont les variations se sont manifestées par différentes abondances et fonctions des lymphocytes infiltrant la tumeur (TIL), myéloïdes et autres cellules stromales. Une caractérisation systématique du paysage de la TME et de la diaphonie entre différents types cellulaires pose les bases biologiques pour l'optimisation des immunothérapies personnalisées du CBNPC.

Les lymphocytes T et les lymphocytes B sont les populations lymphocytaires les plus abondantes et jouent un rôle central dans le TME des tumeurs solides. Alors que les cellules T ont été largement étudiées et thérapeutiquement ciblées en immunothérapie, malheureusement, les inhibiteurs de point de contrôle immunitaire actuellement approuvés n'ont atteint qu'un taux de réponse de 20 à 25 % dans le CBNPC non dépisté [4,5,6,7,8]. Les cellules B infiltrant la tumeur sont un élément clé de l'immunité adaptative avec diverses fonctions. Des effets antitumoraux incohérents des cellules B dans le NSCLC ont été rapportés [9]. Les sous-types et les mécanismes des cellules B dans le TME du NSCLC et leur interaction avec les cellules cancéreuses et d'autres types de cellules stromales restent largement inconnus. Par conséquent, une caractérisation complète du paysage immunologique du NSCLC, y compris la distribution et le rôle des sous-types de cellules immunitaires, en particulier les lymphocytes B, est nécessaire pour comprendre les mécanismes de non-réactivité et découvrir de nouveaux biomarqueurs et stratégies thérapeutiques.

Les lymphocytes B régulent les réponses immunitaires et l'inflammation par la production d'anticorps et l'activation et la prolifération des lymphocytes T via la présentation de l'antigène [10, 11]. Des études récentes ont révélé que la déplétion des cellules B à l'aide d'anticorps anti-IgM réduisait la charge tumorale chez la souris, indiquant un rôle possible des cellules B dans la régulation de la progression des cellules cancéreuses [12]. En effet, plusieurs études ont identifié que les cellules B activaient les récepteurs FcRγ sur les cellules myéloïdes et induisaient en outre la carcinogenèse des cellules squameuses [13]. Une autre étude a révélé que les cellules B peuvent favoriser la métastase du cancer du sein via la sécrétion d'immunoglobines (IgG) ciblant HSPA4 via l'activation de l'axe CXCR4/SDF1α dans les cellules tumorales [14]. Au contraire, plusieurs études ont dévoilé des fonctions anti-tumorales potentielles des cellules B. L'épuisement des cellules B à l'aide d'anticorps contre CD20 a amélioré la progression du mélanome chez la souris [15]. L'activation des cellules B peut également augmenter les effets antitumoraux médiés par les lymphocytes T et a été directement utilisée dans la lyse des cellules tumorales médiée par le complément via la production d'IgM, d'IgG et d'IgG2b [16]. Notant que les différents sous-types de cellules B et leurs interactions avec d'autres types de cellules peuvent provoquer des effets à double tranchant si variés, il est nécessaire de caractériser les cellules B et d'autres types de cellules immunitaires dans le TME à une résolution unicellulaire.

Le transcriptome unicellulaire et l'analyse des données permettent une caractérisation complète des types cellulaires en TME avec une haute résolution [17, 18]. Jusqu'en 2020, une caractérisation monocellulaire du paysage immunitaire, de la signature du transcriptome et des fonctions variées des cellules immunitaires a été menée pour le cancer du sein [17], le cancer du poumon [19], le cancer du foie [20], le cancer colorectal [21], le mélanome [22], et le cancer de la tête et du cou [23]. Cependant, ces études se sont principalement concentrées sur les cellules T [17,18,19,20] ou les cellules stromales [24, 25], mais les sous-types distincts de cellules B, ainsi que leurs fonctions, ont été largement ignorés.

Dans cette étude, nous avons mené une analyse ARN-seq à cellule unique de 115 545 cellules chez 11 patients atteints de NSCLC, pour examiner systématiquement la relation entre les profils de cellules B infiltrant la tumeur et les résultats cliniques des patients NSCLC. Notre analyse a identifié la coexistence de deux classes de cellules B dans le TME du NSCLC. Nous avons en outre validé l'existence et déterminé l'impact clinique de ces deux sous-types de cellules B en utilisant l'immunohistochimie et la cytométrie en flux dans deux cohortes. De plus, nous avons effectué des analyses fonctionnelles pour identifier les mécanismes des deux classes de cellules B dans la progression du NSCLC. Collectivement, notre étude a non seulement inclus une carte de référence transcriptomique unicellulaire de haute qualité du TME du CPNPC de stade I-III, mais a également fourni des explications mécanistiques sur le rôle des cellules B dans le CPNPC et impliquait des potentiels thérapeutiques prometteurs.


Contenu

L'acide palmitique a été découvert par Edmond Frémy en 1840, dans l'huile de palme saponifiée. [12] Cela reste la principale voie industrielle pour sa production, les triglycérides (graisses) de l'huile de palme étant hydrolysés par de l'eau à haute température (au-dessus de 200 °C ou 390 °F), et le mélange résultant distillé de manière fractionnée pour donner le produit pur. . [13]

L'acide palmitique est produit naturellement par un large éventail d'autres plantes et organismes, généralement à de faibles niveaux. Il est naturellement présent dans le beurre, le fromage, le lait et la viande, ainsi que dans le beurre de cacao, l'huile de soja et l'huile de tournesol. Les Karukas contiennent 44,90 % d'acide palmitique. [14] L'ester cétylique de l'acide palmitique (palmitate cétylique) se produit dans le spermaceti.

L'excès de glucides dans le corps est converti en acide palmitique. L'acide palmitique est le premier acide gras produit lors de la synthèse des acides gras et est le précurseur des acides gras plus longs. En conséquence, l'acide palmitique est un composant majeur du corps des animaux. Chez l'homme, une analyse a révélé qu'il représentait 21 à 30% (molaire) de la graisse de dépôt humaine [15] et qu'il s'agit d'un composant lipidique majeur, mais très variable, du lait maternel humain. [16] Le palmitate réagit négativement sur l'acétyl-CoA carboxylase (ACC), qui est responsable de la conversion de l'acétyl-CoA en malonyl-CoA, qui à son tour est utilisé pour s'ajouter à la chaîne acyle en croissance, empêchant ainsi une nouvelle génération de palmitate. [17] En biologie, certaines protéines sont modifiées par l'ajout d'un groupe palmitoyl dans un processus connu sous le nom de palmitoylation. La palmitoylation est importante pour la localisation membranaire de nombreuses protéines.

Tensioactif Modifier

L'acide palmitique est utilisé pour produire des savons, des cosmétiques et des agents de démoulage industriels. Ces applications utilisent palmitate de sodium, qui est couramment obtenu par saponification de l'huile de palme. A cette fin, l'huile de palme, extraite du palmier (espèce Elaeis guineensis), est traité avec de l'hydroxyde de sodium (sous forme de soude caustique ou de lessive), qui provoque l'hydrolyse des groupes esters, donnant du glycérol et du palmitate de sodium.

L'hydrogénation de l'acide palmitique donne de l'alcool cétylique, qui est utilisé pour produire des détergents et des cosmétiques. [ citation requise ]

Aliments Modifier

Parce qu'il est peu coûteux et qu'il ajoute de la texture et de la « sensation en bouche » aux aliments transformés (plats préparés), l'acide palmitique et son sel de sodium trouvent une large utilisation dans les produits alimentaires. Le palmitate de sodium est autorisé comme additif naturel dans les produits biologiques. [18]

Militaire Modifier

Le sel d'aluminium est utilisé comme agent épaississant du napalm utilisé dans les actions militaires.

Schizophrénie Modifier

Récemment, un médicament antipsychotique à action prolongée, le palmitate de palipéridone (commercialisé sous le nom d'INVEGA Sustenna), utilisé dans le traitement de la schizophrénie, a été synthétisé en utilisant l'ester de palmitate huileux comme support à libération prolongée lorsqu'il est injecté par voie intramusculaire. La méthode sous-jacente d'administration du médicament est similaire à celle utilisée avec l'acide décanoïque pour administrer un médicament retard à action prolongée, en particulier des neuroleptiques tels que le décanoate d'halopéridol.

Selon l'Organisation mondiale de la santé, les preuves sont « convainquantes » que la consommation à long terme d'acide palmitique augmente le risque de développer une maladie cardiovasculaire. [19]


NOUVELLES TAILLES

Les Base de données CGSC de E. coli l'information génétique comprend génotypes et des informations de référence pour le souches dans la collection CGSC, les noms, synonymes, propriétés et position sur la carte pour gènes, produit du gène des informations et des informations sur des mutation et références à la littérature primaire. La version publique de la base de données comprend ces informations et peut être interrogée directement via ce serveur Web de base de données CGSC. Pour obtenir de l'aide, utilisez les liens d'aide situés au-dessus et sur chaque formulaire de requête, ou contactez-nous directement.


CRA, Centro di Ricerca per la Viticoltura, Conegliano (TV), Italie

CNR, Istituto di Scienze e Tecnologie Molecolari, Padoue, Italie

CRA, Centro di Ricerca per la Viticoltura, Conegliano (TV), Italie

CNR, Istituto di Scienze e Tecnologie Molecolari, Padoue, Italie

Départements de neurologie et de biochimie, University of Tennessee Health Science Center, États-Unis

Vrije Universiteit Amsterdam, Pays-Bas

Sommaire

La SPE-GC/MS des terpènes, norisoprénoïdes et benzénoïdes

Le SPME-GC/MS des méthoxypyrazines dans les jus et les vins


Introduction

Le classement des éléments individuels au sein des réseaux, y compris les nœuds et les liens, permet d'identifier des sous-ensembles importants d'éléments pour la hiérarchisation des ressources, comme la recherche des pages Web les plus fiables liées à un sujet de recherche sur Internet, la découverte des personnes les plus influentes dans un réseau social , évaluer les articles scientifiques les plus cités dans un réseau de citations, ou identifier les composants les plus vulnérables dans les systèmes d'infrastructure (par exemple, les réseaux de transport, les réseaux électriques et les systèmes d'approvisionnement en eau). La quantification de la criticité des composants du réseau aide les décideurs à éclairer leurs stratégies de gestion. Par exemple, les concepteurs d'infrastructures peuvent fixer des objectifs de sécurité obligatoires ou des niveaux de fiabilité pour les composants (par exemple, les autoroutes et les ponts) d'un réseau de transport, malgré des ressources généralement limitées. Par conséquent, des mesures efficaces en termes de calcul qui peuvent identifier ou éliminer l'importance des nœuds du réseau et des liens sont nécessaires, car les méthodes standard sont trop exigeantes en termes de calcul.

Le classement des nœuds ou des liens du réseau répond à la question « Les nœuds ou liens importants d'un réseau peuvent-ils être identifiés de manière significative tout en maintenant les données d'entrée et les ressources de calcul à un faible niveau ? » Pour répondre à cette question, plusieurs mesures de classement fermées ont été proposées pour capturer les caractéristiques particulières des réseaux, principalement en fonction de leur topologie 1,2,3,4,5. Par exemple, l'une des mesures d'importance des nœuds les plus simples dans un réseau est le degré d'un nœud kje, désignant le nombre de liens qui lui sont connectés. Traditionnellement, la matrice d'adjacence UNE est utilisé pour décrire les modèles de connectivité des nœuds et des liens d'un réseau. La matrice d'adjacence a également été utilisée comme entrée pour des analyses avancées de valeurs propres et de vecteurs propres, qui continuent à être adoptées dans la pratique 6 . Les classements de composants de réseau spectral sont des extensions sophistiquées des méthodologies de classement fondamentales, telles que la centralité du degré de nœud kje 7,8. L'un des développements les plus réussis dans le classement spectral des composants du réseau a été l'algorithme PageRank 3 , qui constitue la base du classement des pages Web de Google, où les sites Web sont des nœuds et les hyperliens sont les connexions entre eux. PageRank prend en compte la normalisation du poids des liens hypertexte et les principes de navigation sur le Web basés sur des modèles de marche aléatoire 9 . Un autre algorithme de classement populaire est l'algorithme HITS (Hypertext Induced Topic Selection) développé par Kleinberg 4 . L'algorithme HITS définit deux types de nœuds dans un réseau, hubs et les autorités et calcule leur score de classement de manière à se renforcer mutuellement. Cependant, le PageRank et HITS sont limités au classement des nœuds d'un réseau et ils ne tiennent pas compte de l'importance des liens. Très peu d'algorithmes efficaces pour le classement des liens existent dans la littérature.

Les études de classement des réseaux de pages Web et des réseaux de citations se sont principalement concentrées sur le classement des nœuds, car le classement des liens dans de tels réseaux n'a pas d'intérêt pratique. Cela contraste fortement avec certains types de réseaux, tels que les réseaux de transport, dont les liens sont au moins aussi importants que les nœuds, ainsi que les réseaux de chaînes d'approvisionnement, dont les liens sont importants pour trouver le mouvement d'un produit ou d'un service jusqu'au client final. . Cependant, des recherches relativement limitées ont été effectuées jusqu'à présent pour étudier le classement des liens d'un réseau. La centralité intermédiaire d'un bord a été utilisée comme indicateur approximatif du rôle critique du lien dans le passage du flux du réseau 10,11. Plusieurs autres études classent les liens des réseaux sur la base d'algorithmes dont la prémisse est que les liens les plus vitaux dans un réseau sont ceux dont la suppression un par un entraîne le plus grand changement d'une métrique de performance au niveau du système, telle qu'une diminution de l'efficacité , perte de connectivité ou augmentation du temps de trajet 12,13 . Les NLe critère -1 dans les systèmes électriques est un exemple pratique de cette approche 14 . Même si la mesure de la performance du réseau peut varier, l'idée de base pour hiérarchiser les composants du réseau en fonction de la suppression de ses composants est essentiellement la même dans les études disponibles 15,16. Cependant, ces mesures basées sur les liens dépendent généralement du calcul des performances du réseau (par exemple, la fiabilité de la connectivité et le flux du réseau) après la suppression des liens, ce qui prend du temps et dépend du choix des mesures de performance. Par exemple, pour l'ensemble du réseau de transport des États-Unis, il existe des dizaines de milliers de nœuds. Par conséquent, la stratégie d'élimination traditionnelle (par exemple, basée sur N-1 critères) prend trop de temps pour des applications pratiques.

Par conséquent, de nouveaux outils informatiques efficaces, en particulier basés sur l'analyse spectrale des réseaux pour le classement joint nœud-lien, sont nécessaires. Cette stratégie de classement sensible aux liens doit rester réalisable sur le plan informatique, même pour les grands systèmes, ce qui constitue aujourd'hui un défi persistant dans l'ingénierie des infrastructures 16 . Cet article développe de nouveaux indices de classement en s'appuyant sur les propriétés spectrales prometteuses des réseaux. Premièrement, cette étude explore la formulation d'un indice de classement appelé Wide Rank (WRank) qui peut classer les nœuds et liens d'un réseau simultanément. S'appuyant sur ce formalisme WRank, un algorithme WRank normalisé (NWRank) est proposé dans ce manuscrit. Cet indice NWRank combine l'idée de renforcement mutuel et de normalisation du poids dans un cadre unifié. Ensuite, les approches WRank et NWRank sont appliquées à un large ensemble de modèles de réseaux synthétisés et comparées aux algorithmes PageRank, HITS, de centralité des vecteurs propres et d'interdépendance, ainsi qu'au benchmark N-1 critère basé sur une métrique d'efficacité du réseau, qui est largement utilisée dans les domaines de la science et de l'ingénierie des réseaux pour étudier les performances de divers types de réseaux.


C13. Liens et références - Biologie

Tous les articles publiés par MDPI sont rendus immédiatement disponibles dans le monde entier sous une licence en libre accès. Aucune autorisation particulière n'est requise pour réutiliser tout ou partie de l'article publié par MDPI, y compris les figures et les tableaux. Pour les articles publiés sous licence Creative Common CC BY en libre accès, toute partie de l'article peut être réutilisée sans autorisation à condition que l'article original soit clairement cité.

Les articles de fond représentent la recherche la plus avancée avec un potentiel important d'impact élevé dans le domaine. Les articles de fond sont soumis sur invitation individuelle ou sur recommandation des éditeurs scientifiques et font l'objet d'un examen par les pairs avant leur publication.

L'article de fond peut être soit un article de recherche original, une nouvelle étude de recherche substantielle qui implique souvent plusieurs techniques ou approches, ou un article de synthèse complet avec des mises à jour concises et précises sur les derniers progrès dans le domaine qui passe systématiquement en revue les avancées les plus passionnantes dans le domaine scientifique. Littérature. Ce type d'article donne un aperçu des orientations futures de la recherche ou des applications possibles.

Les articles du Choix de l'éditeur sont basés sur les recommandations des éditeurs scientifiques des revues MDPI du monde entier. Les rédacteurs en chef sélectionnent un petit nombre d'articles récemment publiés dans la revue qui, selon eux, seront particulièrement intéressants pour les auteurs ou importants dans ce domaine. L'objectif est de fournir un aperçu de certains des travaux les plus passionnants publiés dans les différents domaines de recherche de la revue.


C13. Liens et références - Biologie

Tous les articles publiés par MDPI sont rendus immédiatement disponibles dans le monde entier sous une licence en libre accès. Aucune autorisation particulière n'est requise pour réutiliser tout ou partie de l'article publié par MDPI, y compris les figures et les tableaux. Pour les articles publiés sous licence Creative Common CC BY en libre accès, toute partie de l'article peut être réutilisée sans autorisation à condition que l'article original soit clairement cité.

Les articles de fond représentent la recherche la plus avancée avec un potentiel important d'impact élevé dans le domaine. Les articles de fond sont soumis sur invitation individuelle ou sur recommandation des éditeurs scientifiques et font l'objet d'un examen par les pairs avant leur publication.

L'article de fond peut être soit un article de recherche original, une nouvelle étude de recherche substantielle qui implique souvent plusieurs techniques ou approches, ou un article de synthèse complet avec des mises à jour concises et précises sur les derniers progrès dans le domaine qui passe systématiquement en revue les avancées les plus passionnantes dans le domaine scientifique. Littérature. Ce type d'article donne un aperçu des orientations futures de la recherche ou des applications possibles.

Les articles du Choix de l'éditeur sont basés sur les recommandations des éditeurs scientifiques des revues MDPI du monde entier. Les rédacteurs en chef sélectionnent un petit nombre d'articles récemment publiés dans la revue qui, selon eux, seront particulièrement intéressants pour les auteurs ou importants dans ce domaine. L'objectif est de fournir un aperçu de certains des travaux les plus passionnants publiés dans les différents domaines de recherche de la revue.


C13. Liens et références - Biologie

Tous les articles publiés par MDPI sont rendus immédiatement disponibles dans le monde entier sous une licence en libre accès. Aucune autorisation particulière n'est requise pour réutiliser tout ou partie de l'article publié par MDPI, y compris les figures et les tableaux. Pour les articles publiés sous licence Creative Common CC BY en libre accès, toute partie de l'article peut être réutilisée sans autorisation à condition que l'article original soit clairement cité.

Les articles de fond représentent la recherche la plus avancée avec un potentiel important d'impact élevé dans le domaine. Les articles de fond sont soumis sur invitation individuelle ou sur recommandation des éditeurs scientifiques et font l'objet d'un examen par les pairs avant leur publication.

L'article de fond peut être soit un article de recherche original, une nouvelle étude de recherche substantielle qui implique souvent plusieurs techniques ou approches, ou un article de synthèse complet avec des mises à jour concises et précises sur les derniers progrès dans le domaine qui passe systématiquement en revue les avancées les plus passionnantes dans le domaine scientifique. Littérature. Ce type d'article donne un aperçu des orientations futures de la recherche ou des applications possibles.

Les articles du Choix de l'éditeur sont basés sur les recommandations des éditeurs scientifiques des revues MDPI du monde entier. Les rédacteurs en chef sélectionnent un petit nombre d'articles récemment publiés dans la revue qui, selon eux, seront particulièrement intéressants pour les auteurs ou importants dans ce domaine. L'objectif est de fournir un aperçu de certains des travaux les plus passionnants publiés dans les différents domaines de recherche de la revue.


Voir la vidéo: Ergot des céréales: symptômes et biologie du champignon - (Février 2023).