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Comment calculer la quantification de la qPCR à l'équivalent du nombre de noyaux chez les champignons ?

Comment calculer la quantification de la qPCR à l'équivalent du nombre de noyaux chez les champignons ?


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J'ai une question sur la quantification par qPCR. Ma question est : si je fais la qPCR d'un gène fonctionnel fongique, comment est-il possible d'obtenir à partir du nombre de quantification (en nanogramme) le nombre équivalent en nombre de noyaux ?


De votre commentaire :

« Aussi peu que 148 fg d'ADN de Verticillium dahliae ont été détectés et quantifiés (par qPCR), ce qui équivaut à cinq noyaux ». Comment est-il possible de faire cette conversion ?

Les Verticillium dahliae Le génome JR2 est de 36,2 Mb. En supposant que cet organisme est haploïde et que l'ADNdb a une masse moyenne de 660 g/mol par paire de bases, cela signifie que la masse molaire du génome est de 2,40 × 1010 g/mol. Par conséquent, 5 noyaux contiendront 8,30 × 10-24 mol de votre génome. En multipliant la masse molaire par le nombre de moles, on obtient une masse de 1,99 × 10-13 g, ou 199 fg, ce qui est proche de votre valeur citée.


Voir la vidéo: 3 Polymerase Chain Reaction PCR - Quantitative PCR qPCR (Décembre 2022).