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Existe-t-il une possibilité que la médecine affecte l'efficacité de la sélection naturelle ?


Je veux dire, sauver des personnes malades signifie qu'elles peuvent éventuellement propager quelque chose que la nature ne permet pas. Je sais qu'il y a déjà quelque chose qui opère au niveau génétique produisant une altération, c'est-à-dire une mutation génétique. Et je suis bien conscient que la sélection naturelle et les mutations génétiques se font très lentement.

p.s. je veux vraiment que la médecine fonctionne !!


Résumé : Oui, c'est possible, mais pas comme vous le pensez.

Les humains ne subissent pas beaucoup de pression sélective à grande échelle en ce moment. Nous avons beaucoup de contrôle sur notre environnement, et vous avez raison de dire que les maladies (ou j'ajouterais les catastrophes naturelles massives et mortelles) sont les plus grandes façons dont nous verrions un grand changement génétique. (Ou génocide, qui est une sélection artificielle extrêmement contre nature, mais certaines de nos espèces ont historiquement été suffisamment horribles pour essayer de le faire.)

Une petite sélection naturelle locale s'est produite dans les zones où le paludisme est endémique : de nombreuses personnes meurent du paludisme. certaines personnes meurent prématurément d'anémie falciforme homozygote, mais celles qui sont hétérozygotes ont un « trait drépanocytaire » (en raison d'une dominance incomplète) et ont suffisamment déformé les globules rouges pour que le paludisme ne soit pas en mesure de bien les infecter. L'avantage de survie est donc suffisant pour que la prévalence des allèles drépanocytaires dans ces zones soit plus élevée. Il y a une histoire similaire avec le déficit en glucose-6-phosphate déshydrogénase.

Mais à une échelle à laquelle vous pourriez penser, le mécanisme principal serait une infection pandémique mondiale qui cible les personnes présentant un trait spécifique. Par exemple, si soudainement un virus/bactérie incurable, contagieux, virulent, hautement pathogène et mortel qui n'était mortel que pour les personnes ayant un allèle du groupe sanguin A devait émerger. Théoriquement, cela entraînerait un changement génétique pour éliminer le sang de type A du pool génétique et réduire la prévalence du type B (en éliminant AB en raison de l'A). Ou s'il n'a attaqué qu'un seul endroit du monde, mais c'est très peu probable en raison des voyages mondiaux.

La médecine pourrait théoriquement l'attraper à temps - atténuer l'impact et empêcher un changement important en créant un vaccin ou un remède efficace et facilement produit en série. Le plus susceptible de réussir serait un vaccin (oui pour la santé publique !).

Des variations à ce sujet ont permis de réduire ou d'éliminer les agents pathogènes (tels que la polio et la variole à cause du vaccin) et leurs effets sur l'humanité, mais ceux-ci ont peu à voir avec la sélection de traits humains qui provoqueraient un changement génétique.


Polymorphisme mononucléotidique

En génétique, un polymorphisme mononucléotidique (SNP / s n p / pluriel / s n ɪ p s / ) est une substitution de lignée germinale d'un seul nucléotide à une position spécifique dans le génome. Bien que certaines définitions exigent que la substitution soit présente dans une fraction suffisamment importante de la population (par exemple 1% ou plus), [1] de nombreuses publications [2] [3] [4] n'appliquent pas un tel seuil de fréquence.

Par exemple, à une position de base spécifique dans le génome humain, le nucléotide G peut apparaître dans la plupart des individus, mais dans une minorité d'individus, la position est occupée par un A. Cela signifie qu'il y a un SNP à cette position spécifique, et les deux variations nucléotidiques possibles – G ou A – seraient les allèles de cette position spécifique.

Les SNP mettent en évidence les différences dans notre sensibilité à un large éventail de maladies (par exemple, la drépanocytose, la -thalassémie et la mucoviscidose). [5] [6] [7] La ​​gravité de la maladie et la façon dont le corps réagit aux traitements sont également des manifestations des variations génétiques causées par les SNP. Par exemple, une mutation d'une seule base dans le gène APOE (apolipoprotéine E) est associée à un risque plus faible de maladie d'Alzheimer. [8]

UNE variante mononucléotidique (SNV) est une variation d'un seul nucléotide. Les SNV diffèrent des SNP en ce qu'un SNV peut être somatique [9] et peut être causé par un cancer, [10] mais un SNP doit se séparer dans la population d'organismes d'une espèce. Les SNV apparaissent également couramment dans les diagnostics moléculaires tels que la conception d'amorces PCR pour détecter les virus, dans lesquels l'échantillon d'ARN ou d'ADN viral peut contenir des SNV.


Rejoignez le débat

/>Colin Macdonald dit:

Nous sommes tous implorés de suivre "The Science" par des hackers qui n'ont étudié aucun type de science depuis l'école. Je ne suis certainement pas d'accord avec tout ce que dit Ivor Cummins, mais au moins il essaie d'examiner les preuves, et il a le sens de l'ingénierie pour le faire.
J'aimerais vraiment que les journalistes d'ici et d'ailleurs aient un peu plus de capacité à distinguer les faits scientifiques concrets des probabilités scientifiques. Hier, un exemple de Radio 4 PM « des cas de covid-19 ont chuté au Royaume-Uni à cause du verrouillage et des vaccins », déclare notre éminent présentateur, qui n'a évidemment jamais appris que la corrélation n'équivaut pas à la causalité. Quoi qu'il en soit, cette proclamation fade est restée dans la tête de ce huard d'extrême droite, alors j'ai décidé de regarder les données et de voir ce qui s'était passé dans un pays qui n'avait pas l'air verrouillé et n'a pas vacciné (Suède 2020). Bien sûr, les décès en Suède ont chuté à peu près du même degré. Maintenant, évidemment, ce n'est pas la preuve que les blocages, les vaccins ne fonctionnent pas, mais ce serait bien si nos HSH étaient un peu moins certains et pouvaient reconnaître leurs propres limites et avoir un peu plus de doutes.

/>Jon Redman dit:

Je pense que Tom a identifié quelques morceaux imbriqués du puzzle, mais ne les a pas assemblés correctement.
C'est précisément parce que le travail de Darwin fournit une explication des résultats différents entre les hommes et les femmes, cette race et celle-là, etc., qu'il doit être purgé. L'hypothèse éveillée est que tout tourne autour du patriarcat et du racisme, et que les hommes, les femmes et les différentes races n'existent même pas objectivement. Cela rend les réalisations et la cohérence des racistes dans l'identification des races assez impressionnantes, mais je m'éloigne du sujet.
Il n'y a pas de place pour le compromis, donc Darwin doit annuler et réduire au silence pour sa pensée erronée.
Ce n'est même pas nouveau. Regardez ce qui s'est passé lorsque les gens ont eu le manque de tact pour signaler des erreurs dans la science du climat il y a 20 ans.

Joff Brown dit:

Surpris, il a fallu attendre l'avant-dernier paragraphe pour entrer dans l'inévitable coup sur Peterson.

/>Bertie B dit:

comment la science « ne peut pas être objective et apolitique »

Je suis fondamentalement en désaccord avec les universitaires (ou n'importe qui d'autre) qui croient cela. Et je suis content d'être allé dans une université moins prestigieuse si c'est le calibre de la pensée de certains des écholons supérieurs.
À titre d'exemple simple, l'exploration de la gravité de Newton ne dépendait en aucun cas de ses tendances politiques, peu importe s'il était un homme, une femme, un noir, un blanc, un homosexuel, un hétéro, un catholique, le plus éthique. La science est par définition objective et apolitique.

/>Gabriele dit:

La psychologie évolutionniste est, en son cœur, l'idée que le cerveau (et donc l'esprit, et le comportement humain et la psychologie en général) est le produit de l'évolution, comme tout autre organe animal.

Je ne suis pas un scientifique, mais d'après ce que je comprends, je ne pense pas que ce soit réellement vrai et le principal problème de la psychologie évolutionniste. La théorie moderne de l'évolution dit essentiellement que les caractéristiques des êtres vivants qui se transmettent à travers les générations successives sont sélectionnées par sélection naturelle. Ces caractéristiques ne sont pas choisies, les changements se produisent de manière aléatoire mais seuls les plus utiles survivent.
Le point crucial est que la sélection naturelle opère sur les gènes, c'est-à-dire des parties discrètes qui définissent clairement quelle est la caractéristique qui est sélectionnée. Il n'y a pas de gènes pour l'esprit. Alors, sur quelle unité exactement la psychologie évolutionniste travaillerait-elle ? Les vagues concepts de « caractéristiques mentales » ou de traits psychologiques ?
Il me semble que la psychologie évolutionniste vole la terminologie de la biologie évolutionniste sans avoir le fondement requis qui existe en biologie. C'est avec ça que j'ai un problème. Personne n'a de problème à dire que le cerveau est un produit de l'évolution, mais l'esprit est différent.
Il me semble non scientifique que la psychologie évolutionniste essaie d'étudier l'esprit avec un état d'esprit biologique qui ne s'applique pas à l'esprit. Quand ils font cela, ils corrompent le concept biologique bien défini de l'évolution en une idée vague de changement à travers le temps. Cela risque de nuire à la fois à la biologie et à la psychologie car ainsi l'évolution perd son sens scientifique précis.

/>Bertie B dit:

Je comprends ce que vous dites, mais l'"esprit" n'est pas séparé du "cerveau", il ne peut pas exister sans le cerveau, et son existence et son fonctionnement dépendent entièrement de la structure du cerveau.
Chiens, chats, moutons, cochons, tous ont un cerveau - la structure de leur cerveau est différente du nôtre et, par conséquent, ils ont un esprit complètement différent du nôtre.
L'« esprit » est très abstrait, mais il n'est capable de se comporter que d'une manière définie par la structure du cerveau.
Prenons l'exemple d'un chien : son système cérébral/fonctionnel est bien plus sensible aux odeurs que le nôtre. Je vois une tache humide sur le trottoir et je suppose qu'un chien a peut-être uriné là-bas il y a quelque temps. Mon chien le renifle et sait quand cela se produit, qui l'a fait et ce qu'il a mangé au petit-déjeuner le temps d'une manière complètement différente de la façon dont notre cerveau peut le traiter.

/>Sam Cel Romain dit:

ffs, les formes de vie évolutives réussies n'ont pas PLUS de progéniture que les autres, elles ont plus de progéniture qui SURVIE pour avoir plus de progéniture. Sinon, selon votre définition, une tortue a plus de succès qu'un chat.

/>Rasmus Fogh dit:

J'ai repensé Gabriele sous un angle légèrement différent :
L'esprit « et le cerveau » sont extrêmement complexes, flexibles et capables de changer. Notre comportement s'apprend, nos personnalités et nos motivations se forment, etc. à partir de l'interaction avec les gens qui nous entourent. Cet apprentissage se transmet aussi de génération en génération à travers les personnes qui nous sont proches. Il devient extraordinairement difficile de distinguer l'influence des gènes de l'influence de l'apprentissage social puisqu'ils sont transmis par les mêmes personnes (parents).

Bien sûr, la génétique et la biologie déterminent au moins la machinerie de base. Personnellement, je pense que par ex. Damore a raison, mais vous devez admettre que c'est presque impossible à prouver.

/>Terry M dit:

Non, cela mérite simplement des moqueries plus sophistiquées

/>Terry M dit:

“Dr Fauci est derrière tout ça.”
Oui, il a été intimement impliqué dans la demande (du gouvernement américain) d'une "exception" à l'interdiction d'étudier le virus pour les rendre transmissibles à l'homme. Et puis a financé le laboratoire de Wuhan. Qu'il puisse être considéré comme autre chose qu'un criminel est absurde.


Version 1 : Le virus a été conçu et s'est échappé.

Un excellent point d'entrée à l'affirmation selon laquelle le SARS-CoV-2 a été conçu puis relâché accidentellement dans la nature, provoquant ainsi la pandémie de COVID-19, est un reportage dans The Daily Mail que j'ai vu samedi, car il contient un quelques thèmes majeurs que j'ai trouvés utilisés par beaucoup pour plaider en faveur d'une origine de laboratoire pour le virus, ainsi que des arguments scientifiques douteux. L'article vante un article non encore publié du professeur britannique Angus Dalgleish et du scientifique norvégien Dr Birger Sørensen, décrit dans l'article comme étant "sur le point d'être publié dans la revue Quarterly Review of Biophysics Discovery". , le titre est essentiellement une théorie du complot :

La justification de l'article, à en juger par les extraits et les déclarations de Dalgleish et Sørensen, repose sur un appel à l'incrédulité, en particulier l'incrédulité que le SRAS-CoV-2 aurait pu provenir d'une source naturelle. De tels arguments sont peut-être les arguments les plus courants pour une "fuite de laboratoire" que j'ai vue, généralement accompagnés de raisons incorrectes pour lesquelles une telle origine est "impossible". Cet article n'est pas différent sous cette forme générale.

Quand j'ai lu l'article pour la première fois, je n'avais jamais entendu parler de ces scientifiques auparavant et je n'avais aucune idée de qui ils étaient, alors j'ai fait un peu de recherche sur Google. Malheureusement, beaucoup de ce qui est apparu en premier dans les résultats de recherche étaient des liens vers l'histoire du Daily Mail et d'autres réimprimant l'histoire, mais j'ai appris que le Dr Dalgleish est un oncologue à St. George’s, Université de Londres et a couru pour Parlement en tant que membre du UK Independence Party lors des élections générales britanniques de 2015, terminant quatrième. Il est également membre de l'Académie des sciences médicales, du Royal College of Physicians, du Royal College of Pathologists et du Royal Australasian College of Physicians. Il est célèbre pour avoir été le co-découvreur du récepteur CD4 en tant que principal récepteur cellulaire du VIH. Sørensen est le président d'une société pharmaceutique, Immunor, qui a développé un candidat vaccin contre le coronavirus appelé Biovacc-19.

Normalement, je ne blogue pas sur les articles non publiés, préférant attendre que l'article entier soit publié, mais le Daily Mail a non seulement publié le résumé, mais plusieurs tableaux et figures de l'article non publié. C'est vraiment, vraiment inhabituel. La plupart des journaux ne seraient pas du tout ravis de voir un journal faire cela. L'article indique que l'article a été "obtenu exclusivement par DailyMail.com et devrait être publié dans les prochains jours". Compte tenu de la participation apparemment enthousiaste de Dalgleish et Sørensen aux interviews pour le reportage, il est très difficile d'imaginer comment le Daily Mail aurait pu obtenir une copie de l'article de toute autre source que les auteurs, bien que l'un des trois auteurs du manuscrit, Andres Susrud, ait publié une version antérieure de l'article, qui n'a pas été acceptée :

Et ici, nous avons téléchargé une version antérieure de leur article : https://t.co/EHSgRkJmLq

&mdash Aksel Fridstrøm (@Akselfrids) 29 mai 2021

Il y a un autre énorme drapeau rouge à propos de cette étude et c'est la revue dans laquelle elle a été publiée, qui n'était pas dans une revue de biologie moléculaire, de biochimie ou de virologie, mais plutôt une revue de biophysique. Ce n'est pas le premier endroit où je choisis de publier un article de ce genre, bien que QRB Discovery se décrive comme publiant des "observations physiques pertinentes pour les systèmes biologiques, à la fois expérimentales et théoriques, qui peuvent indiquer une direction passionnante, plutôt que la présentation d'une étude approfondie traditionnelle”, ce qui pourrait expliquer pourquoi Dalgleish et Sørensen ont décidé d'y publier au lieu d'une revue plus appropriée. Ensuite, il y a cet extrait de l'histoire:

Ils ont dit qu'ils avaient essayé de publier leurs résultats mais qu'ils avaient été rejetés par les principales revues scientifiques qui étaient à l'époque résolues à dire que le virus passait naturellement des chauves-souris ou d'autres animaux aux humains.

Donc, en gros, les auteurs sont allés magasiner jusqu'à ce qu'ils trouvent un journal qui accepterait leur manuscrit. Il n'y a rien de mal en soi à cela. (Presque tous les scientifiques, moi y compris, ont soumis un manuscrit à une revue différente après avoir été rejeté par une autre revue, et beaucoup d'entre nous ont eu la désagréable expérience de devoir soumettre à trois revues ou plus avant de pouvoir publier un article.) Cependant, cela fait sourciller lorsqu'un article comme celui-ci se retrouve dans un journal qui ne semble pas approprié pour le matériel. Il suffit de regarder les types d'articles dans le dernier numéro. Ils sont tous assez fortement axés sur des études biophysiques de base assez dures, plutôt que sur des analyses de séquences. De plus, contrairement à la façon dont il est décrit, en tant qu'« étude », il s'agit en réalité davantage d'un article de synthèse, sans nouvelle recherche publiée, du moins pour autant que je sache.

Maintenant, regardons les sections Résumé et Conclusion, utilement fournies par le Daily Mail. Voici le résumé :

Je ne peux m'empêcher de noter la formulation plutôt étrange du résumé, à savoir que les auteurs affirment que leur analyse est si convaincante qu'elle renverse la charge de la preuve pour ceux qui considèrent une origine de laboratoire du virus hautement improbable et une origine naturelle beaucoup plus. Quoi qu'il en soit, avant de discuter de l'article et des chiffres, je dois signaler un autre drapeau rouge que j'ai découvert dans l'article du Daily Mail. C'était un si gros qu'il mérite littéralement un visage. Voici l'extrait de l'article :

Un signe révélateur d'une prétendue manipulation que les deux hommes ont mis en évidence était une rangée de quatre acides aminés qu'ils ont trouvées sur le pic SARS-Cov-2.

Dans une interview exclusive avec DailyMail.com, Sørensen a déclaré que les acides aminés ont tous une charge positive, ce qui fait que le virus s'accroche étroitement aux parties chargées négativement des cellules humaines comme un aimant, et devient ainsi plus infectieux.

Mais parce que, comme les aimants, les acides aminés chargés positivement se repoussent, il est rare d'en trouver même trois d'affilée dans des organismes naturels, alors que quatre d'affilée est "extrêmement improbable", a déclaré le scientifique.

« Les lois de la physique signifient que vous ne pouvez pas avoir quatre acides aminés chargés positivement d'affilée. La seule façon d'obtenir cela est de le fabriquer artificiellement », a déclaré Dalgleish à DailyMail.com.

Leur nouvel article indique que ces caractéristiques du SRAS-Cov-2 sont des « empreintes digitales uniques » qui « indiquent une manipulation intentionnelle » et que « la probabilité que cela soit le résultat de processus naturels est très faible ». 8217

Et voici le visage, bien mérité :

Lorsque Godzilla vous donne le visage, vous savez que l'échec est monstrueux.

Il n'y a vraiment qu'un seul mot pour décrire cette affirmation : Conneries. Je suis désolé si quelqu'un est offensé par un léger blasphème, mais c'est vraiment le seul mot pour décrire l'affirmation ci-dessus, et les scientifiques n'ont pas tardé à l'appeler ainsi sur les réseaux sociaux, avec des exemples :

Je suppose que quelqu'un devrait faire savoir à la nucléoplasmine qu'elle n'obéit pas aux lois de la physique (mais apparemment aux lois de la biochimie)https://t.co/uJstGPgtBZ

&mdash Jason Kindrachuk, PhD (@KindrachukJason) 30 mai 2021

Voici, d'ailleurs, le champion du génome humain :

NP_001171491.1 protéine BEAN1 isoforme 1
RHRHRHHRHHHHHHHHRRRRHR

&mdash Michael Eisen (@mbeisen) 30 mai 2021

Et la Synaptotagmine I humaine, également requise pour la libération des neurotransmetteurs.

Des considérations similaires s'appliquent. pic.twitter.com/WrGFZ1Y9vq

&mdash Alex Merz (@Merz) 29 mai 2021

Il y a 9 701 correspondances avec [RK][RK][RK][RK][RK] dans le protéome humain….

& mdash Michael Eisen (@mbeisen) 29 mai 2021

Le site de clivage de la furine CoV HKU1 est RRKRR. Cinq de suite !

&mdash Stephen Goldstein (@stgoldst) 29 mai 2021

Personnellement, voici mes deux réponses préférées :

Ainsi, le SRAS-CoV-2 (qui, selon le professeur Dalgleish et le Daily Mail * doit * être conçu car il contient 4 résidus + ve d'affilée) se lie à l'ACE2 humain – qui a également 4 résidus + ve d'affilée. (https://t.co/D3cJs2GL2B)

Par conséquent, selon cette logique, les humains sont conçus. pic.twitter.com/r12oFbHDhr

&mdash Dave Briggs (@xtaldave) 31 mai 2021

S'il violait les lois de la physique, vous ne seriez pas non plus en mesure de le fabriquer artificiellement.

&mdash Kevin Kehres (@kevin_kehres) 30 mai 2021

En effet. Si cela viole vraiment les lois de la physique d'avoir quatre acides aminés chargés positivement tous alignés les uns à côté des autres dans une protéine, alors il serait tout à fait impossible de concevoir une séquence nucléotidique qui pourrait coder une telle protéine, car la traduction échouerait ! Sérieusement, comment pourrait-il tout journal permet à un article de synthèse d'avancer un argument aussi absurde ? Il s'avère que quatre acides aminés chargés positivement d'affilée sont assez courants, un motif présent dans des milliers de protéines différentes. Il est tentant de rejeter le tout sur la base d'une telle ignorance épique, mais creusons un peu plus car Dalgleish et Sørensen font une autre affirmation qui est communément faite par ceux qui plaident pour une origine de laboratoire.

La principale affirmation de Dalgleish et Sørensen est la suivante :

Dalgleish et Sørensen affirment que les scientifiques travaillant sur des projets de gain de fonction ont pris un coronavirus naturel ‘backbone’ trouvé dans les chauves-souris des cavernes chinoises et y ont épissé un nouveau ‘spike’, le transformant en un SARS-Cov-Cov- mortel et hautement transmissible. 2.

Ils fondent leur argumentation sur, essentiellement, un argument de l'ignorance, avec un peu de théorie du complot ajoutée. Oui, il est possible de créer des séquences génétiques sans, par exemple, des sites d'enzymes de restriction typiques du genre qui étaient fréquemment utilisés pour insérer des séquences dans les génomes. Cependant, ce n'est pas aussi facile que Dalgleish et Sørensen le prétendent. Fondamentalement, pour eux, ces scientifiques chinois infâmes étaient censés être si intelligents qu'ils ont non seulement fait quelque chose qui n'est pas du tout insignifiant, mais l'ont fait sans laisser de signes révélateurs dans la séquence de manipulation génétique, autres que ceux que seuls Dalgleish et Sørenson « découvertes », telles que les six zones de la protéine que pratiquement tous les autres scientifiques n'ont pas trouvées suspectes. Ensuite, il y a l'argument selon lequel une pandémie de virus naturel devrait "muter progressivement" pour devenir plus infectieuse mais moins pathogène (c'est-à-dire mortelle). Certes, nous avons vu le premier avec l'émergence de variantes plus transmissibles du SRAS-CoV-2 dans le monde entier, mais nous n'avons pas vu le dernier.

Comme l'a souligné la virologue Angela Rasmussen :

Lol ce que le Dr Kindrachuk a dit. De plus, cela n'a aucun sens, et permettez-moi de répondre à la grande affirmation qui semble revenir de plus en plus : les virus n'évoluent pas automatiquement pour être plus transmissibles et moins pathogènes. L'évolution naturelle a de nombreux résultats possibles.

&mdash Dr Angela Rasmussen (@angie_rasmussen) 30 mai 2021

Le SRAS-CoV-2 n'est déjà pas si pathogène et n'est pas susceptible d'évoluer beaucoup dans les deux sens en ce qui concerne la pathogénicité. Il infecte la majorité des hôtes sans les tuer. Il devient plus transmissible parce qu'il a eu tant d'occasions d'acquérir des mutations adaptatives.

&mdash Dr Angela Rasmussen (@angie_rasmussen) 30 mai 2021

Encore une fois, cet argument est, tout simplement, incorrect, et nous ne nous attendrions pas nécessairement à ce que le SRAS-CoV-2 évolue pour devenir moins pathogène et moins mortel. Étant donné que le taux de mortalité par infection du SRAS-CoV-2 est déjà bien inférieur à 1% et qu'une fraction importante de ses infections sont asymptomatiques ou seulement légèrement symptomatiques, il n'y aura probablement pas autant de pression sélective pour les mutations qui le rendent moins mortel, en particulier lorsqu'il se propage toujours aussi largement et facilement.

Quant au reste de l'article, il fait beaucoup de gestes de la main et fait appel à l'ignorance et au complot. Encore une fois, ses deux points principaux (qu'un tronçon de quatre acides aminés de résidus positifs est si inhabituel) et que l'évolution conduirait inévitablement à une augmentation lente de la transmissibilité et à une diminution de la pathogénicité, sont clairement incorrects et ne peuvent expliquer l'origine du SRAS-CoV- 2. En effet, il existe maintenant plusieurs articles qui montrent comment le virus a probablement évolué à partir de coronavirus existants et comment il continue d'évoluer au fur et à mesure de sa propagation. (Voici un bon article de synthèse récent, et les voies évolutives potentielles qui auraient pu conduire au SRAS-CoV-2 étaient connues dès juillet 2020.)

Ensuite, il y a les articles prétendant avoir des preuves scientifiques irréfutables que le SRAS-CoV-2 n'aurait pas pu survenir naturellement. Parmi ceux-ci (au moins maintenant) se trouvent des articles de Li-Meng Yan affirmant que le génome publié du coronavirus de chauve-souris RaTG13, identifié dans une chauve-souris en fer à cheval (Rhinolophe affinis) et partageant 96% d'homologie de séquence avec le SRAS-CoV-2, était, par essence, "faux" et généré comme une dissimulation pour étayer la "théorie de l'origine naturelle". sans exagérer, Yan affirme même que toutes les données remettant en question la «théorie de l'origine naturelle» sont censurées par des revues scientifiques.) RaTG13 a été trouvé dans des spécimens de chauves-souris archivés stockés à l'Institut de virologie de Wuhan après avoir été collectés en 2013. qu'ils pourraient générer la séquence RaTG13 à partir des données de séquence brutes soumises aux bases de données publiques, concluant que le « génome RaTG13 publié est étayé par des données de séquence brutes de bonne qualité. » Sans coïncidence, Yan est également connu pour attaquer des scientifiques, tels que Angela Rasmussen, qui l'a noté dans un commentaire.

Un autre exemple de preuve supposée de « slam-dunk » est l'affirmation popularisée dans l'article de Wade (mentionné ci-dessus) selon laquelle un site appelé site de clivage de la furine est unique au SRAS-CoV-2 parmi les bêta-coronavirus du SRAS. Comme je l'ai mentionné dans l'article de la semaine dernière, la protéine de pointe dans le SRAS-CoV-2 se compose de deux sous-unités. Entre ces deux sous-unités, S1 et S2, se trouve un site où une protéine humaine appelée furine clive la protéine, pour produire les deux sous-unités fonctionnelles. Wade a affirmé :

Les virus ont toutes sortes d'astuces astucieuses, alors pourquoi le site de clivage de la furine se démarque-t-il ? En raison de tous les bêta-coronavirus connus liés au SRAS, seul le SRAS2 possède un site de clivage de la furine. Tous les autres virus ont leur unité S2 clivée à un site différent et par un mécanisme différent.

Comment alors le SRAS2 a-t-il acquis son site de clivage de la furine ? Soit le site a évolué naturellement, soit il a été inséré par des chercheurs à la jonction S1/S2 dans une expérience de gain de fonction.

Fondamentalement, l'argument de Wade semble être que parce qu'un site de clivage de la furine de ce type n'a pas été vu dans les bêta-coronavirus liés au SRAS avant qu'il n'ait dû être conçu. Le problème est que de tels sites de clivage de la furine sont courants dans une grande variété de virus, y compris les coronavirus, et que les scientifiques avaient déjà identifié des mécanismes plausibles par lesquels il aurait pu se retrouver là où il l'a fait dans le SRAS-CoV2 l'année dernière :

Encore une fois, cela était connu depuis des mois.

Mais le problème, ce sont les non-experts qui aiment dire que la fuite du laboratoire semble possible, n'en savent pas assez sur la biologie pour défier Wade à ce sujet.https://t.co/CqgXfDxcXphttps://t.co/ zrnitS3Ixehttps://t.co/Fc5Vvhx103https://t.co/Id3yKZpBx9 pic.twitter.com/RRPr7Cvb3H

&mdash Atomsk's Sanakan (@AtomsksSanakan) 7 mai 2021

Je pourrais continuer encore et encore avec ce genre de choses, mais fondamentalement, toutes les affirmations selon lesquelles le SRAS-CoV-2 n'aurait pas pu survenir naturellement ne montrent rien de la sorte et trahissent souvent l'ignorance de la biologie moléculaire réelle du virus et une méconnaissance encore plus grande du fonctionnement des modèles animaux. Une autre affirmation qui revient sans cesse est que le SRAS-CoV-2 est apparu "parfaitement adapté" aux humains en tant qu'hôte. (Wade y fait allusion.) Cette étude suggère une voie par laquelle la sélection naturelle chez les chauves-souris aurait pu créer un virus plus «généraliste» plutôt que spécifiquement adapté aux humains. En d'autres termes, le SRAS-CoV-2 n'est pas parfaitement adapté aux humains, juste assez bien adapté pour les infecter efficacement.


INGÉNIERIE GÉNÉTIQUE

Les progrès rapides de la technologie observés au cours des dernières décennies ont soulevé la possibilité d'une « amélioration radicale », définie par Nicholas Agar, « comme l'amélioration des attributs et des capacités humaines à des niveaux qui dépassent largement ce qui est actuellement possible pour les êtres humains » [24 ]. Le génie génétique offre la possibilité d'une telle amélioration en offrant aux humains un contrôle profond sur leur propre biologie. Parmi d'autres technologies, le génie génétique comprend l'édition du génome (également appelée édition du gène), un groupe de technologies ayant la capacité de modifier directement l'ADN d'un organisme grâce à une intervention ciblée dans le génome (par exemple, l'insertion, la suppression ou le remplacement de matériel génétique spécifique) [25 ]. On considère que l'édition du génome atteint une précision beaucoup plus grande que les formes préexistantes de génie génétique. Il a été avancé qu'il s'agissait d'un outil révolutionnaire en raison de son efficacité, de la réduction des coûts et du temps. Cette technologie est considérée comme ayant de nombreuses applications pour la santé humaine, à la fois dans la prévention et la lutte contre les maladies. Une grande partie du débat éthique associé à cette technologie concerne l'application possible de l'édition du génome dans la lignée germinale humaine, c'est-à-dire le génome qui peut être transmis aux générations suivantes, que ce soit à partir de gamètes, d'un œuf fécondé ou de divisions du premier embryon [26-28] . Le potentiel de la technologie à modifier le génome de la lignée germinale humaine pour nous fournir des traits considérés comme positifs ou utiles (par exemple la force musculaire, la mémoire et l'intelligence) dans les environnements actuels et futurs a suscité des inquiétudes et de l'enthousiasme.

Génie génétique : thérapie ou amélioration et prévisibilité des résultats

Pour explorer certaines des implications possibles des interventions héréditaires, nous prendrons comme exemple l'édition (plus précisément la « suppression » à l'aide de la technologie d'édition du génome CRISPR) de plusieurs paires de bases du gène CCR5. Une telle intervention a été pratiquée en 2018 chez deux jumelles non identiques nées en Chine. Il a déjà été démontré que les mutations de perte de fonction du CCR5 confèrent une résistance au VIH. Par conséquent, la délétion du gène devrait protéger les bébés filles jumelles du risque de transmission du VIH qui aurait pu provenir de leur père (séropositif). Cependant, le père avait maîtrisé l'infection et le titre du virus VIH était indétectable, ce qui signifie que le risque de transmission de l'infection VIH aux bébés était négligeable [29].

D'un point de vue éthique, basé sur les pratiques acceptables actuelles, ce cas a été largement critiqué par la communauté scientifique en plus d'être considéré par beaucoup comme un cas d'intervention d'amélioration humaine plutôt que de thérapie [29, 30]. L'une des questions que cet exemple permet d'illustrer est que la frontière éthique entre une thérapie qui « corrige » un trouble en rétablissant les performances à une portée « normale » et une intervention qui « améliore » les capacités humaines en dehors de la portée « normale » acceptée, est pas toujours facile à dessiner. Pour les besoins de l'argumentation, on pourrait supposer que la thérapie implique des tentatives pour restaurer un certain état de santé, de normalité ou de raison de l'état « naturel » d'un individu spécifique. Si nous adoptons cette approche, la question est de savoir comment la santé, la normalité et la raison, ainsi que le naturel en soi, sont définis, car le sens de ces concepts évolue au fil du temps pour s'adapter aux normes sociales et aux valeurs culturelles des sociétés modernes. On pourrait dire que la difficulté de développer une distinction conceptuelle entre thérapie et amélioration a toujours été présente. Cependant, l'importance potentielle d'une telle distinction n'est que maintenant, avec l'accélération et l'impact des développements technologiques, devenant plus évidents.

Au-delà des questions éthiques, un problème majeur de cette intervention est que l'on ne connaît pas (encore ?) exactement la totalité des effets que peut avoir la mutation artificielle du CCR5, tant au niveau génétique que phénotypique. C'est parce que nous savons maintenant que, contrairement à l'idée « un gène-un trait » acceptée il y a quelques décennies, un gène - ou son absence - peut affecter de nombreux traits, beaucoup d'entre eux étant apparemment sans rapport (un phénomène également connu sous le nom de pléiotropie ). That is, due to constrained developmental interactions, mechanisms and genetic networks, a change in a single gene can result in a cascade of multiple effects [ 31]. In the case of CCR5, we currently know that the mutation offers protection against HIV infection, and also seems to increase the risk of severe or fatal reactions to some infectious diseases, such as the influenza virus [ 32]. It has also been observed that among people with multiple sclerosis, the ones with CCR5 mutation are twice as likely to die early than are people without the mutation [ 33]. Some studies have also shown that defective CCR5 can have a positive effect in cognition to enhance learning and memory in mice [ 34]. However, it’s not clear if this effect would be translated into humans. The example serves to illustrate that, even if human enhancement with gene editing methods was considered ethically sound, assessing the totality of its implications on solid grounds may be difficult to achieve.

Genetic engineering and human evolution: large-scale impacts

Beyond providing the opportunity of enhancing human capabilities in specific individuals, intervening in the germline is likely to have an impact on the evolutionary processes of the human species raising questions on the scale and type of impacts. In fact, the use of large-scale genetic engineering might exponentially increase the force of ‘niche construction’ in human evolution, and therefore raise ethical and practical questions never faced by our species before. It has been argued that natural selection is a mechanism of lesser importance in the case of current human evolution, as compared to other organisms, because of advances in medicine and healthcare [ 35]. According to such a view, among many others advances, natural selection has been conditioned by our ‘niche-construction’ ability to improve healthcare and access to clean water and food, thus changing the landscape of pressures that humans have been facing for survival. An underlying assumption or position of the current debate is that, within our human species, the force of natural selection became minimized and that we are somehow at the ‘end-point’ of our evolution [ 36]. If this premise holds true, one could argue that evolution is no longer a force in human history and hence that any human enhancement would not be substituting itself to human evolution as a key driver for future changes.

However, it is useful to remember that, as defined by Darwin in his book ‘On the Origin of the Species’, natural selection is a process in which organisms that happen to be ‘better’ adapted to a certain environment tend to have higher survival and/or reproductive rates than other organisms [ 37]. When comparing human evolution to human genetic enhancement, an acceptable position could be to consider ethically sound those interventions that could be replicated naturally by evolution, as in the case of the CCR5 gene. Even if this approach was taken, however, it is important to bear in mind that human evolution acts on human traits sometimes increasing and sometimes decreasing our biological fitness, in a constant evolutionary trade-off and in a contingent and/or neutral—in the sense of not ‘progressive’—process. In other worlds, differently from genetic human enhancement, natural selection ne fait pasobjectif’ at improving human traits [ 38]. Human evolution and the so-called genetic human enhancement would seem therefore to involve different underlying processes, raising several questions regarding the implications and risks of the latter.

But using genetic engineering to treat humans has been proposed far beyond the therapeutic case or to introduce genetic modifications known to already occur in nature. In particular, when looking into the views expressed on the balance between human evolution and genetic engineering, some argue that it may be appropriate to use genetic interventions to go beyond what natural selection has contributed to our species when it comes to eradicate vulnerabilities [ 17]. Furthermore, when considering the environmental, ecological and social issues of contemporary times, some suggest that genetic technologies could be crucial tools to contribute to human survival and well-being [ 20–22]. The possible need to ‘engineer’ human traits to ensure our survival could include the ability to allow our species to adapt rapidly to the rate of environmental change caused by human activity, for which Darwinian evolution may be too slow [ 39]. Or, for instance, to support long-distance space travel by engineering resistance to radiation and osteoporosis, along with other conditions which would be highly advantageous in space [ 40].

When considering the ethical and societal merits of these propositions, it is useful to consider how proto-forms of enhancement has been approached by past human societies. In particular, it can be argued that humans have already employed—as part of our domestication/‘selective breeding’ of other animals—techniques of indirect manipulation of genomes on a relatively large scale over many millennia, albeit not on humans. The large-scale selective breeding of plants and animals over prehistoric and historic periods could be claimed to have already shaped some of our natural environment. Selective breeding has been used to obtain specific characteristics considered useful at a given time in plants and animals. Therefore, their evolutionary processes have been altered with the aim to produce lineages with advantageous traits, which contributed to the evolution of different domesticated species. However, differently from genetic engineering, domestication possesses inherent limitations in its ability to produce major transformations in the created lineages, in contrast with the many open possibilities provided by genetic engineering.

When considering the impact of genetic engineering on human evolution, one of questions to be considered concerns the effects, if any, that genetic technology could have on the genetic pool of the human population and any implication on its resilience to unforeseen circumstances. This underlines a relevant question associated with the difference between ‘health’ and biological fitness. For example, a certain group of animals can be more ‘healthy’—as domesticated dogs—but be less biologically ‘fit’ according to Darwin’s definition. Specifically, if such group of animals are less genetically diverse than their ancestors, they could be less ‘adaptable’ to environmental changes. Assuming that, the human germline modification is undertaken at a global scale, this could be expected to have an effect, on the distribution of genetically heritable traits on the human population over time. Considering that gene and trait distributions have been changing under the processes of evolution for billions of years, the impact on evolution will need to be assessed by analysing which genetic alterations have been eventually associated with specific changes within the recent evolutionary history of humans. On this front, a key study has analysed the implications of genetic engineering on the evolutionary biology of human populations, including the possibility of reducing human genetic diversity, for instance creating a ‘biological monoculture’ [ 41]. The study argued that genetic engineering will have an insignificant impact on human diversity, while it would likely safeguard the capacity of human populations to deal with disease and new environmental challenges and therefore, ensure the health and longevity of our species [ 41]. If the findings of this study were considered consistent with other knowledge and encompassing, the impact of human genetic enhancements on the human genetic pool and associated impacts could be considered secondary aspects. However, data available from studies on domestication strongly suggests that domestication of both animals and plans might lead to not only decreased genetic diversity per se, but even affect patterns of variation in gene expression throughout the genome and generally decreased gene expression diversity across species [ 42–44]. Given that, according to recent studies within the field of biological anthropology recent human evolution has been in fact a process of ‘self-domestication’ [ 45], one could argue that studies on domestication could contribute to understanding the impacts of genetic engineering.

Beyond such considerations, it is useful to reflect on the fact that human genetic enhancement could occur on different geographical scales, regardless of the specific environment and geological periods in which humans are living and much more rapidly than in the case of evolution, in which changes are very slow. If this was to occur routinely and on a large scale, the implications of the resulting radical and abrupt changes may be difficult to predict and its impacts difficult to manage. This is currently highlighted by results of epigenetics studies, and also of the microbiome and of the effects of pollutants in the environment and their cumulative effect on the development of human and non-human organisms alike. Increasingly new evidence indicates a greater interdependence between humans and their environments (including other microorganisms), indicating that modifying the environment can have direct and unpredictable consequences on humans as well. This highlight the need of a ‘systems level’ approach. An approach in which the ‘bounded body’ of the individual human as a basic unit of biological or social action would need to be questioned in favour of a more encompassing and holistic unit. In fact, within biology, there is a new field, Systems Biology, which stresses the need to understand the role that pleiotropy, and thus networks at multiple levels—e.g. genetic, cellular, among individuals and among different taxa—play within biological systems and their evolution [ 46]. Currently, much still needs to be understood about gene function, its role in human biological systems and the interaction between genes and external factors such as environment, diet and so on. In the future if we do choose to genetically enhance human traits to levels unlikely to be achieved by human evolution, it would be crucial to consider if and how our understanding of human evolution enable us to better understand the implications of genetic interventions.


Unnatural Selection: Birth Control Pills May Alter Choice Of Partners

There is no doubt that modern contraception has enabled women to have unprecedented control over their own fertility. However, is it possible that the use of oral contraceptives is interfering with a woman's ability to choose, compete for and retain her preferred mate? A new paper published in the October issue of the journal Tendances de l'écologie et de l'évolution reviews emerging evidence suggesting that contraceptive methods which alter a woman's natural hormonal cycles may have an underappreciated impact on choice of partners for both women and men and, possibly, reproductive success.

Human females are only fertile for a brief period during their menstrual cycle, just prior to ovulation. Many scientific studies have established that partner preferences of both women and men vary significantly according to predictable hormonal fluctuations associated with the natural menstrual cycle. Ovulation is associated with a profound shift in some female physical characteristics, behaviors and perceptions related to mate attraction.

Ovulating women exhibit a preference for more masculine male features, are particularly attracted to men showing dominance and male-male competitiveness and prefer partners that are genetically dissimilar to themselves. This is significant because there is evidence suggesting that genetic similarity between couples might be linked with infertility. Further, some studies have suggested that men detect women's fertility status, preferring ovulating women in situations where they can compare the attractiveness of different women.

The oral contraceptive pill alters the hormonal fluctuations associated with the menstrual cycle and essentially mimics the more steady hormonal conditions associated with pregnancy. "Although mate choice studies in humans have routinely recorded pill use during the last decade to control for its confounding effects, little effort has been invested in understanding the consequences of such effects of the pill," offers study author Dr. Alexandra Alvergne from the Department of Animal and Plant Sciences at the University of Sheffield.

Dr. Alverne and colleague Dr. Virpi Lumma reviewed and discussed new research supporting the conclusion that use of the pill by women disrupted their variation in mate preferences across their menstrual cycle. The authors also speculate that the use of oral contraceptives may influence a woman's ability to attract a mate by reducing attractiveness to men, thereby disrupting her ability to compete with normally cycling women for access to mate.

Of particular interest is the fact that women taking the pill do not exhibit the ovulation-specific attraction to genetically dissimilar partners. "The ultimate outstanding evolutionary question concerns whether the use of oral contraceptives when making mating decisions can have long-term consequences on the ability of couples to reproduce," suggests Dr. Lummaa.

Taken together, an increasing number of studies suggest that the pill is likely to have an impact on human mating decisions and subsequent reproduction. "If this is the case, pill use will have implications for both current and future generations, and we hope that our review will stimulate further research on this question," concludes Dr. Lummaa.

Source de l'histoire :

Matériel fourni par Presse cellulaire. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.


Overproduction of Offspring

The first of these factors that must be present in order for Natural Selection to occur is the ability of a population to overproduce offspring. You may have heard the phrase "reproduce like rabbits" which means to have a lot of offspring quickly, much like it seems rabbits do when they mate.

The idea of overproduction was first incorporated into the idea of Natural Selection when Charles Darwin read Thomas Malthus's essay on human population and the food supply. The food supply increases linearly while the human population increases exponentially. There would come a time when the population would pass up the amount of available food. At that point, some humans would have to die out. Darwin incorporated this idea into his Theory of Evolution through Natural Selection.

Overpopulation doesn't necessarily have to occur in order for Natural Selection to happen within a population, but it must be a possibility in order for the environment to put selective pressure on the population and some adaptations to become desirable over others.

Which leads to the next necessary factor.


Meaning and Causes of Stabilizing Selection

The stabilizing process is one that results statistically in an over-represented norm. In other words, this happens when the selection process—in which certain members of a species survive to reproduce while others do not—winnows out all the behavioral or physical choices down to a single set. In technical terms, stabilizing selection discards the extreme phenotypes and instead favors the majority of the population that is well adapted to their local environment. Stabilizing selection is often shown on a graph as a modified bell curve where the central portion is narrower and taller than the normal bell shape.

Diversity in a population is decreased due to stabilizing selection—genotypes which are not selected are reduced and can disappear. However, this does not mean that all individuals are exactly the same. Often, mutation rates in DNA within a stabilized population are actually a bit higher statistically than those in other types of populations. This and other kinds of microevolution keep the "stabilized" population from becoming too homogeneous and allow the population the ability to adapt to future environmental changes.

Stabilizing selection works mostly on traits that are polygenic. This means that more than one gene controls the phenotype and so there is a wide range of possible outcomes. Over time, some of the genes that control the characteristic can be turned off or masked by other genes, depending on where the favorable adaptations are coded. Since stabilizing selection favors the middle of the road, a blend of the genes is often what is seen.


Addressing the Problem: A Case Study

One new 80-bed community hospital in Wisconsin has been designed to improve patient safety through research-based design. Following the report of the Institute of Medicine (IOM), To Err Is Human: Designing a Safer Health System, 64 the management and medical staff at St. Joseph’s initially believed that adverse events applied to other institutions and not their own. When it became apparent that St. Joseph’s, too, had preventable adverse events, top management authorized the design of a facility with the equipment and technology to lower or eliminate preventable adverse events𠅊 design that could possibly be used as an example by other health care organizations that were building new facilities, remodeling, or expanding existing facilities.

The process began in April 2002, when leadership from SynergyHealth St. Joseph’s Hospital met with national leaders representing health care administration, health services research, hospital quality improvement and accreditation, hospital architecture, systems engineering, medicine, nursing, and pharmacy. 65 Using personal experience, human factors principles, health care research, and research from other industries, it was agreed that a National Learning Lab, would be used to develop recommendations for facility design, define and create a roadmap for safety by design, including safe design principles, make recommendations for changes in care processes, and enhance safety culture for hospitals through facility design focused on patient safety. The specific safety design principles, intended to specifically address both latent conditions and active failures, included the following:

These principles were substantiated by using failure mode and effects analysis throughout the design process, involving patients/families, and instituting an organizational culture of safety, these principles would enable designs that would support the anticipation, identification, and prevention of adverse events. 65

Designing for Nursing Care

The first step for the National Learning Lab was an educational program about human error and its causes associated with latent conditions and active failures. The goal of this education was to gain commitment to the need for nurses to be active in the design phase. Then representatives of nursing were elected to a facility design committee. Design teams of nurses were also formed to assure formal input into the design. Mock-ups were also an important feature and prompted more input from the nurses. Many rooms were mocked up, and the medical-surgical room was modified multiple times by the involvement of nurses reviewing every detail to assure a safe design. Nurses’ involvement in equipment and technology planning started immediately with the mock-ups. The interplay between the facility (with its equipment and technology) and nurses and patients creates safe or unsafe interactions, and the result is affected in large part by the facility design.

Once the National Learning Lab was over, St. Joseph’s Hospital began the important process of implementing the Lab’s recommendations. For St. Joseph’s to implement the National Learning Lab’s recommendations, senior leadership knew they needed to involve nurses in the facility design process because of nursing’s essential role in caring for patients, and because nurses interface with all the systems of a hospital at the “sharp end,” including equipment, technology, facilities, and patients—more so then any other care provider in a hospital. Not discounting the role of physicians, other clinicians, and health care staff, nurses provide care 24 hours a day, 7 days a week. As such, nurses providing care are most aware of the best way to design a patient room (for example) so the room design minimizes the potential for human error and harm to patients. St. Joseph’s organized the design process to maximize the involvement of nurses.

Single-Patient Room

In many instances, including the need for patient isolation measures, double or multiple-occupancy rooms were viewed as not being conducive to patient safety and quality care. The floor plan shown in Figure 1 illustrates how a series of standardized single-patient rooms were laid out on both sides of a hallway in St. Joseph’s Hospital. This perspective allows various features of the room to be seen in relation to each other. There are two entrances to the room, one from the hallway (along the lower edge of the picture), and one from the alcove on the right. In that alcove, also entered from the hallway, a desk, computer, and chair are provided for use by staff. The alcove also contains a standardized storage area, so staff can find everything they need for the care of the patient adjacent to the patient room.

Figure 1

Floor Layout of Single-Patient Rooms in St. Joseph’s Hospital

The interior of a single-patient room incorporates many of the recommendations relating to latent conditions and active failures in the design for safety (see Figure 2). The family area of the room is in the right corner of the room, by the window, and includes a couch/pull-out bed, chair, desk with Internet connection, and good natural lighting. The treatment area of the room is on the left side of the bed, with room all around the bed for patient care. It is intentional, also, that the patient is on the nurses’ and other caregivers’ right as that person enters the room from either door, so care can be more efficiently provided. Note that the bathroom is at the head of the patient’s bed, allowing the patient to get to and from the bathroom without impediments, holding onto a rail all the way if necessary. At the head of the bed is the headwall with connections for various gases such as oxygen on the wall to the left of the bed is a pull-down table the caregiver can use when it is needed. Although it is not shown in the illustration, there will also be a portable cart in each room, with a computer on it. Last but not least, in the lower right-hand corner of the room, between the two doorways, easily visible to the patient, there is a sink𠅊n ever-present and convenient reminder to nurses, all staff, and visitors to wash their hands.

Figure 2

Single-Patient Room in St. Joseph’s Hospital

Applying Knowledge of Active Failures and Latent Conditions to Room Design

The design process for St. Joseph’s Hospital focused on safety, employing broad participation, including nurses, physicians, board members, administration, National Learning Lab participants, expert consultants, other health systems, health care writers, and design teams. The patient room was selected as a good example of how the design plan for the hospital came together in one location. To show how the room design was reached, each of the applicable latent conditions and active failures will be discussed, to explain how they relate to the plan for a single-patient room.

Noise reduction

Noise interferes with communication, creates distractions, affects cognitive performance and concentration, and contributes to stress and fatigue. 66 Particularly sensitive are mental activities involving working memory. 67 Noise can also adversely impact healing, alter quality of sleep, and reduce overall perceived patient satisfaction, yet the evidence at present is equivocal. 68 Since a standardized patient room has a material effect on noise, the bed in each single room in St. Joseph’s is in the same location as the next room. In the traditional patient room style, called back-to-back, patient beds are on the same wall. Back-to-back plans create major transfer noise between rooms, and their use of the same oxygen, compressed room air, and suction intensifies the transfer noise and vibration. In a truly standardized room, this does not occur. In addition, the walls between rooms are separated and insulated with airspace, minimizing transfer noise. This was designed into the structure early in the building design. In addition, vibration noise between floors and within a floor was minimized through design. The mechanical, electrical, and plumbing systems were designed to use the optimum materials for minimizing noise. This included using vibration isolation/dampening devices wherever vibration could be a factor.

The flooring in the patient room is rubber, second to carpet in sound reduction qualities. The reason carpet was not chosen (it was mocked up and tested) is because spills and mishaps needed to be cleaned up immediately. Carpet requires housekeeping to bring a carpet cleaner, which could take time and also could be embarrassing for the patient. Carpet was chosen, however, for the alcoves and hallways, with a low-nap, special carpet for hospital application. Special ceiling tiles that absorb noise better than regular ceiling tiles were chosen. Triple glazed windows were specified to minimize outside noises. No overhead paging system is used (except for public emergencies such as a tornado warning), and nurse call systems use minimal tone with vibrating features. As specific equipment and technologies were needed, manufacturers of that piece of equipment or technology were contacted and asked how they reduced noise in their products. That became one important criterion for selecting which company’s equipment to use.

Scalability, adaptability, flexibility

Many design and construction concepts can be applied to achieve a scalable (e.g., the ability to expand or remodel easily) or adaptable (e.g., the ability to adapt space for different or evolving services) health care facility. At St. Joseph’s, all rooms have higher-than-normal ceilings to allow changes to be incorporated in the future. Space around the bed is sized so procedures (e.g., colonoscopies) could be performed in the room in the future.

Visibility of patients to staff

The importance of being able to see patients is inherent to nursing care, a concept that was recognized early by Florence Nightingale, who advocated the design of open, long hospital wards to see all patients. The design of units and patient rooms should allow caregivers to be in visual proximity to patients a pod structure can allow close proximity and enable quality care by improving efficiency and effectiveness. At St. Joseph’s, each alcove door has a glass window with a blind so nurses can work in the alcoves and see the patient or check on the patient. The nurse can also check on the patient in the evening without opening the door and waking the patient. Each room is wired for cameras for observation. All materials, such as medication, linens, IV poles, and a rough-in for icemakers, are delivered to the alcove to allow nurses to spend more time with the patient. The chart will initially be in the room, but shortly after the new hospital opens, it will be replaced by electronic medical records with a workspace so nurses and other caregivers can spend more time with the patient. Furthermore, visibility also means lighting to see the patient. Natural light is maximized by large windows in every patient room. Light sources after hours are as close to natural light as can be achieved cost effectively. Canned lights are located over the patient for assessment. A total of 15 lights are located in every room, including the bathroom and alcoves.

Involving patients in their care

The IOM 9 found that many patients have expressed frustration with their inability to participate in decisionmaking, to obtain information they need, to be heard, and to participate in systems of care that are responsive to their needs. The availability of information for patients increases their knowledge regarding their illness and treatment options, and being informed gives patients the opportunity to participate in shared decisionmaking with clinicians and may help patients better articulate their individual views and preferences. 69� This reflects several dimensions of patient-centered care, including respect for patients’ values, preferences, and expressed needs, as well as providing information, communication, and education. 72

At St. Joseph’s, the patient room is designed with a treatment section near the door and a family section near the window. A couch folds outs into a bed a desk with an Internet connection encourages family members or friends to stay with patients. This is intended to help patients to be more active with their care and better able to protect themselves from errors. A portable computer on a cart (same one used by staff) is located in each room so patients can have appropriate access to their chart.

Standardisation

Standardization has been documented as an important human factors-based design strategy 4 , 64 that can help lessen the number of errors. Standardization reduces reliance on short-term memory and allows those unfamiliar with a specific process or design to use it safely. 64 With a focus on improving the human-system interface by designing better processes and systems, standardization of patient rooms, treatment areas, equipment, and procedures can substantially reduce errors. 64

There were many design elements that incorporated standardization as a physical attribute. The patient rooms in St. Joseph’s may be the first patient rooms in the country to be standardized. The headwalls are standardized throughout the facility a seven-drawer configuration was designed into every patient room or alcove to provide consistency of supply locations and to simplify the restocking of those supplies. This provides staff with a known constant, regardless of where they may be caring for a patient throughout the facility due to floating, a patient resuscitation, or some other emergent situation. The electronic medical record, use of bar-coding, computerized provider order entry, and other technologies will be standardized eventually, assisting in the development of standardized protocols and order sets. The facility materials distribution and routine nurse functions can also be standardized to match the facility.

Equipment is not fully standardized yet, but that is the goal, since fully standardized equipment provides the highest level of safety. The complexity and variety in equipment vendors and models is immense, and this complexity creates more errors. This weakness—the lack of equipment standardization—was pointed out continually in using failure and effects mode analysis. So St. Joseph’s is evolving toward equipment standardization. The hospital was able to purchase limited new patient monitoring equipment, and took care to assure that new and existing equipment were from the same vendor to give the user a similar feel and functionality, regardless of which equipment they were using. The hospital will continue to utilize this process to guarantee long-term equipment standardization within the facility.

Automation where possible

The IOM identified health information technology solutions as a necessary component to improving patient safety. 9 As discussed in the chapter on health information technology, technologies such as electronic medical records can improve communication and information dissemination between providers.

At St. Joseph’s, electronic medical records, bar-coding, physician order entry, a pneumatic tube system, two computers in every room (one in the alcove and one on a cart in the room), a sophisticated nurse call system, new patient beds, and patients lifts for every room are examples of automation. These applications are intended to allow caregivers to give care more efficiently and rely less on short-term memory. Many design features and technology applications have affected multiple latent conditions. This was one of the important criteria used at the matrix exercise to determine which design features to include. Technology applications were deemed to be a critical part of allowing St. Joseph’s to design for safety.

Immediate accessibility of information, close to the point of service

In order to provide patients with the most accurate diagnosis and treatment possible, clinicians need to have complete, real-time information about the patient, care needs, and treatment options. Technologies such as the Internet, electronic medical records, and clinical decision-support systems can accomplish this. At St. Joseph’s, electronic medical records were seen as the most useful way of making information accessible quickly at the point of service. When the hospital opened, the patient chart was 100 percent paper based. In traditional hospital environments, the patient chart changes location without regard to patient activities. Early mornings, a physician may come around and take the chart to a quiet dictation area to write notes and orders. The chart is often left there until another care provider requires the chart. Or, the chart may be left with the unit secretary to input/transcribe orders.

A transitional plan was developed to meet this guiding principle: When the hospital opened, a mandate was incorporated into the physician and staff orientation that the chart on the medical/surgical unit never leaves the alcove unless the patient leaves. This was surprisingly effective and compliance was unusually high. When an order is written, the physician uses a wall-mounted button labeled “New Order” or “Stat Order” to alert the unit clerk. The unit clerk then transcribes the order and does any necessary computer order entry in the alcove. The chart never leaves the alcove. Anecdotally, the physicians find this process useful to them. They can make rounds more efficiently, since they never have to look for a chart to write their notes or orders. They never have to �tch” their rounding and then look for all of the charts to document. Verbal orders are also reduced. For obvious reasons, this process will cease to be relevant when the electronic medical record is implemented.

Minimizing fatigue

Fatigue has been identified as a contributing factor to human error. 73 , 74 While the effects of fatigue on patient safety is not known, fatigue has been found to have a negative impact on alertness, mood, and psychomotor and cognitive performance, which can have an impact on patient safety. 74� Some of the effects of long work hours and increasing workload can be mitigated by minimizing the distances staff must travel between patient rooms, and by using health information technology at the bedside to reduce reliance on short-term memory and thought processes. Other considerations in the design of St. Joseph’s to minimize fatigue are carpeting and rubber flooring, a chair in the alcove, single rooms, keeping all materials in the alcove so nurses have to take fewer steps, less reliance on short-term memory, less noise, natural light, and strong lighting sources.

Minimizing patient transfers/handoffs

Transferring patients from one unit, room, or floor to another puts both the patient and staff at risk of harm, and it is disruptive to both patients and clinicians. Often these transfers involve handoffs, which, as described in another chapter in this book, also place the patient and clinician at risk for errors. Minimizing patient transfers and handoffs has design implications. Private single rooms with appropriate space around the beds, lifts, and other safety mechanisms allow more procedures to be performed in the room. This is similar to the model in obstetrics with Labor Delivery Recovery Post-Partum (LDRP) rooms, where the mother delivers the child and the child can remain with the mother in the same room for the entire stay. Another example is the physical therapy gym located on the med-surg unit—the patient never leaves the unit to obtain therapy, and their nurse is always in close proximity should a change in patient condition occur. Electronic medical records are another important tool. Bar-coding helps with continually and accurately identifying the patient.

Addressing the Root Causes of Precarious Events

The approaches used by St. Joseph’s to address root causes for other types of at risk areas are described as follows:

Operative/postoperative complications and infections

Among the design features that will contribute to the reduction in operative/postoperative complications and infections are private rooms a sink at the entrance to the medical/surgical patient rooms, which you must pass going in either door (to encourage hand washing) internal window blinds (to reduce accumulation of dust) a housewide air filtration system that includes central HEPA filters ultraviolet lights in all clinical areas airflow systems in which clean air passes the patient and is recycled and filtered again and a radiant heat panel above or below every patient window to eliminate condensation. These are all features that minimize infection. Air supply and return grates that need cleaning have been upgraded to stainless steel so cleaning is more effective. However, the most important design element is the location of the sink, since lack of hand washing is the number one reason for hospital-acquired infections.

Inpatient suicides

Data from the Joint Commission indicate that out of the approximately 1,500 to 1,800 suicides that occur annually in hospitals, about 50 percent of those occur in medical/surgical units. The two most common methods are jumping and hanging. In a medical/surgical room, there are many things patients can use to hang themselves, such as bathroom curtain rods, showerheads, television brackets, or lights. Thus, St. Joseph’s decided to use breakaway shower curtain rods and minimize other hanging risks by choosing lights and brackets that met the design needs of the room but would be less likely to be used for a suicide attempt. To minimize jumping, windows cannot be opened, and they are triple-paned, making them much harder to break through. If a suicide-risk patient is identified, that patient is transferred to the mental health unit, but increased visibility in all patient rooms helps staff keep a closer watch, which helps minimize the risk of suicides.

Death of patients in restraints, patient falls

St. Joseph’s, like most hospitals, has minimized restraints. The new beds ordered for the hospital have eliminated many of the risks of deaths due to restraints. With less and less restraints, however, the risk of falls rises. Most patients fall at night or while walking with a nurse or other caregiver. Design elements that help reduce falls include fixed night lights in every room, beds that drop down to sixteen inches above the floor, locating the bathroom at the head of the bed with railings to the stool and shower, and utilizing bathroom lights that automatically turn on when anyone enters the bathroom. Besides the above-mentioned strategies, a bed-exit system is being explored using infrared technology. If a patient is identified as he is trying to get out of bed, then lights could turn on, an emergency call to the pager could occur, or a voice could ask the patient to wait for a caregiver. Such a system is in design at St. Joseph’s.

Correct tube𠅌orrect connector𠅌orrect hole placement events, oxygen cylinder hazards

All connectors are a different size for different gases and color-coded. Storage and identification of portable gases employ the same identification program. All gases are in standardized locations to further minimize the risk of a gas-connecting error.

Wrong-site surgery

Operating room suites were standardized, using proper lighting and cable access to digital images and photographs of the surgery site.

Medication and transfusion-related adverse events

Bar-coding, unit doses at point of service, electronic medical records, and physician order entry are critical elements for medication error reduction. Private rooms with alcoves that include medical records allow nurses to concentrate on one patient and document those efforts, before moving on to the next patient.

Bringing It All Together at St. Joseph’s Community Hospital

The use of failure mode and effects analysis, patient focus groups, mock-ups with employee evaluation, and checklist safety design principles (latent conditions and active failures) helped St. Joseph’s create the safest room they could envision. The patient room evolved over months of design. Over 27 different designs or refinements were made on the patient room. This room is not the only way a patient room can be designed for safety, but it is believed to be a good way, and it exhibits efficient, thoughtful features that meet National Learning Lab expectations.

The 2002 National Learning Lab had a powerful effect on St. Joseph’s and is beginning to influence hospital facility development nationally. St. Joseph’s Hospital implemented the recommendations of the Learning Lab, designing around latent conditions and active failures, and enhancing or creating a safety culture through facility design with its technology and equipment. The importance of nursing leadership in the whole process cannot be overstated. Without the commitment, knowledge, and perseverance of the nursing leadership, along with the chief executive officer, board, medical staff, architects, and the rest of the design teams, a safe design would not have occurred.

The effort of St. Joseph’s is just the tip of the iceberg of the potential for improving safety of patients in hospitals as a result of facility development. The impact of the National Learning Lab recommendations on processes also offers an immense opportunity to improve the safety of patients in hospitals. The work of St. Joseph’s should serve as a model for those health care leaders who share the vision that facilities, including equipment and technology, focused on safety will improve the health and well-being of the patients whom they serve.

The building of the new hospital was completed in 2005, and investigators are currently evaluating the impact of their designs on the frequency of adverse events and patient outcomes. Using innovative architectural and design features to enhance patient safety together with institutionalizing a nonpunitive safety culture can potentially have a greater impact than design features alone. Over the past few years, the National Learning Lab changed St. Joseph’s Hospital and has begun to influence hospitals and health care throughout the country.

Leaders and clinicians at St. Joseph’s found that the project, with its many safety enhancements, resulted in capital expenditures under budget𠅊n important consideration in the business case. The National Learning Lab’s process of identifying and addressing latent conditions was correlated with the Toyota Lean Principles. Standardization, visibility, continuous flow, value stream, minimizing handoffs/transfers will be created as a result of a safely designed facility. This should lead to less human error and potential harm and more efficient operations (process). Yet, one of the major difficulties of translating this efficiency and better outcomes into improved net income is the basic misalignment of financial incentives. Both the fee-for-service and the DRG (diagnosis-related group) introduce perverse incentives. Hospital revenues can actually be reduced as a result of improved safety, and savings can accrue to the insurance companies and not the institutions creating the improvements. Although there is some evidence of changes to improve these misaligned incentives, more dramatic changes are needed to encourage safe process redesign.


Why is social activity important?

Social activity is a natural buffer against depression. Il engendre un sentiment d'appartenance et un sentiment de sécurité, qui atténuent tous deux les sentiments de détresse, favorisent un sentiment de bien-être et affectent la physiologie pour freiner la production d'hormones de stress. Rester socialement actif contrecarre également les effets des symptômes de la dépression. Il vise directement la déconnexion tant de la sensation de dépression.

L'une des nombreuses conséquences de la dépression est une perception accrue et une réactivité au rejet social. Se sentir connecté aux autres, qu'il s'agisse d'individus ou de groupes, favorise la récupération chez les personnes présentant des symptômes dépressifs, apportant une dose particulièrement importante de satisfaction et d'encouragement.


Voir la vidéo: Le Grand bRain - Atelier #1 (Janvier 2022).