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Notation de délétion chromosomique dans les cancers

Notation de délétion chromosomique dans les cancers


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La littérature sur le cancer fait souvent référence à la suppression de certaines sections d'un chromosome (par exemple "17p del" ou "Del(17p)" pour la suppression du bras p du chromosome 17.)

Cela signifie-t-il que les deux allèles du chromosome ont été supprimés pour la cytobande spécifiée (c'est-à-dire que l'analyse du nombre de copies indiquerait zéro dans ce cas) ? Ou cela signifie-t-il que l'un des allèles a été supprimé et qu'il en reste donc un (l'analyse du nombre de copies montrerait un numéro de copie de 1 dans ce cas) ?

Merci


9q22.3 microdélétion

La microdélétion 9q22.3 est une modification chromosomique dans laquelle un petit morceau du chromosome 9 est supprimé dans chaque cellule. La délétion se produit sur le bras long (q) du chromosome dans une région désignée q22.3. Ce changement chromosomique est associé à un retard de développement, à une déficience intellectuelle, à certaines anomalies physiques et aux caractéristiques d'une maladie génétique appelée syndrome de Gorlin.

De nombreuses personnes présentant une microdélétion 9q22.3 ont un retard de développement, affectant particulièrement le développement des habiletés motrices telles que la position assise, debout et la marche. Chez certaines personnes, les retards sont temporaires et s'améliorent dans l'enfance. Les personnes les plus gravement touchées ont des troubles du développement permanents ainsi qu'une déficience intellectuelle et des problèmes d'apprentissage. Rarement, des convulsions ont été signalées chez des personnes présentant une microdélétion 9q22.3.

Environ 20 pour cent des personnes atteintes d'une microdélétion 9q22.3 subissent une prolifération (macrosomie), ce qui entraîne une augmentation de la taille et du poids par rapport aux pairs non affectés. La macrosomie commence souvent avant la naissance et se poursuit pendant l'enfance. D'autres changements physiques qui sont parfois associés à une microdélétion 9q22.3 incluent la fusion prématurée de certains os du crâne (craniosynostose métopique) et une accumulation de liquide dans le cerveau (hydrocéphalie). Les personnes affectées peuvent également avoir des caractéristiques faciales distinctives telles qu'un front proéminent avec des plis cutanés verticaux, des yeux inclinés vers le haut ou vers le bas, un nez court et un long espace entre le nez et la lèvre supérieure (philtrum).

Les microdélétions 9q22.3 provoquent également les caractéristiques du syndrome de Gorlin (également connu sous le nom de syndrome de carcinome basocellulaire névoid). Cette maladie génétique affecte de nombreuses régions du corps et augmente le risque de développer diverses tumeurs cancéreuses et non cancéreuses. Chez les personnes atteintes du syndrome de Gorlin, le type de cancer diagnostiqué le plus souvent est le carcinome basocellulaire, qui est la forme la plus courante de cancer de la peau. La plupart des personnes atteintes de cette maladie développent également des tumeurs non cancéreuses (bénignes) de la mâchoire, appelées tumeurs odontogènes kératokystiques, qui peuvent provoquer un gonflement du visage et un déplacement des dents. D'autres types de tumeurs qui surviennent chez certaines personnes atteintes du syndrome de Gorlin comprennent une forme de cancer du cerveau infantile appelé médulloblastome et un type de tumeur bénigne appelée fibrome qui se produit dans le cœur ou dans les ovaires d'une femme. Les autres caractéristiques du syndrome de Gorlin comprennent de petites dépressions (fosses) dans la peau des paumes des mains et de la plante des pieds, une taille de tête inhabituellement grande (macrocéphalie) avec un front proéminent et des anomalies squelettiques impliquant la colonne vertébrale, les côtes ou le crâne.


Localisation cytogénétique

Les généticiens utilisent une méthode normalisée pour décrire l'emplacement cytogénétique d'un gène. Dans la plupart des cas, l'emplacement décrit la position d'une bande particulière sur un chromosome coloré :

Il peut également être écrit sous la forme d'une plage de bandes, si l'on en sait moins sur l'emplacement exact :

La combinaison de chiffres et de lettres fournit l'« adresse » d'un gène sur un chromosome. Cette adresse est composée de plusieurs parties :

Le chromosome sur lequel le gène peut être trouvé. Le premier chiffre ou lettre utilisé pour décrire l'emplacement d'un gène représente le chromosome. Les chromosomes 1 à 22 (les autosomes) sont désignés par leur numéro de chromosome. Les chromosomes sexuels sont désignés par X ou Y.

Le bras du chromosome. Chaque chromosome est divisé en deux sections (bras) en fonction de l'emplacement d'un rétrécissement (constriction) appelé centromère. Par convention, le bras le plus court est appelé p et le bras le plus long est appelé q. Le bras chromosomique est la deuxième partie de l'adresse du gène. Par exemple, 5q est le bras long du chromosome 5 et Xp est le bras court du chromosome X.

La position du gène sur le bras p ou q. La position d'un gène est basée sur un motif distinctif de bandes claires et sombres qui apparaissent lorsque le chromosome est coloré d'une certaine manière. La position est généralement désignée par deux chiffres (représentant une région et une bande), qui sont parfois suivis d'un point décimal et d'un ou plusieurs chiffres supplémentaires (représentant des sous-bandes dans une zone claire ou sombre). Le nombre indiquant la position du gène augmente avec la distance du centromère. Par exemple : 14q21 représente la position 21 sur le bras long du chromosome 14. 14q21 est plus proche du centromère que 14q22.

Parfois, les abréviations « cen » ou « ter » sont également utilisées pour décrire l'emplacement cytogénétique d'un gène. « Cen » indique que le gène est très proche du centromère. Par exemple, 16pcen fait référence au bras court du chromosome 16 près du centromère. « Ter » signifie terminus, ce qui indique que le gène est très proche de l'extrémité du bras p ou q. Par exemple, 14qter fait référence à l'extrémité du bras long, ou à la toute fin, du chromosome 14.

Les CFTR est situé sur le bras long du chromosome 7 en position 7q31.2.


Carte des chromosomes

Notre information génétique est stockée dans 23 paires de chromosomes dont la taille et la forme varient considérablement. Le chromosome 1 est le plus gros et plus de trois fois plus gros que le chromosome 22. La 23e paire de chromosomes est constituée de deux chromosomes spéciaux, X et Y, qui déterminent notre sexe. Les femmes ont une paire de chromosomes X (46, XX), tandis que les hommes ont un chromosome X et un Y (46, XY). Les chromosomes sont constitués d'ADN et les gènes sont des unités spéciales d'ADN chromosomique. Chaque chromosome est une très longue molécule, il doit donc être étroitement enroulé autour des protéines pour un emballage efficace.

Près du centre de chaque chromosome se trouve son centromère, une région étroite qui divise le chromosome en un bras long (q) et un bras court (p). Nous pouvons diviser davantage les chromosomes en utilisant des colorations spéciales qui produisent des rayures connues sous le nom de motif de bandes. Chaque chromosome a un motif de bandes distinct et chaque bande est numérotée pour aider à identifier une région particulière d'un chromosome. Cette méthode de cartographie d'un gène à une bande particulière du chromosome est appelée cartographie cytogénétique. Par exemple, le gène bêta de l'hémoglobine (HBB) se trouve sur le chromosome 11p15.4. Cela signifie que le HBB Le gène se trouve sur le bras court (p) du chromosome 11 et se trouve dans la bande étiquetée 15.4.

Avec l'avènement de nouvelles techniques d'analyse de l'ADN, nous sommes en mesure d'examiner le chromosome de manière beaucoup plus détaillée. Alors que la cartographie cytogénétique donne une vue d'ensemble du chromosome, des méthodes plus modernes montrent l'ADN à une résolution beaucoup plus élevée. Le projet du génome humain vise à identifier et séquencer les


Notation de délétion chromosomique dans les cancers - Biologie

La source: image à gauche de l'illustration GeneMap'99 du Chromosome 18. Image à droite de la page Web du CCAP sur "Recurrent Aberration Data".

Chaque bras chromosomique est divisé en régions, ou bandes cytogénétiques, visible à l'aide d'un microscope et de colorants spéciaux. Les bandes cytogénétiques sont étiquetées p1, p2, p3, q1, q2, q3, etc., en partant du centromère vers les télomères. À des résolutions plus élevées, des sous-bandes peuvent être vues à l'intérieur des bandes. Les sous-bandes sont également numérotées du centromère vers le télomère.

Par exemple, l'emplacement de la carte cytogénétique du gène CFTR est 7q31.2, ce qui indique qu'il se trouve sur le chromosome 7, le bras q, la bande 3, la sous-bande 1 et la sous-sous-bande 2.

Les extrémités des chromosomes sont étiquetées ptel et qtel. Par exemple, la notation 7qtel fait référence à l'extrémité du bras long du chromosome 7.

Strachan, T. et Read, A.P. 1999. Génétique moléculaire humaine, 2e édition. New York : John Wiley & Fils.

GeneMap'99 (cliquez sur un numéro de chromosome).

La page Web du CCAP sur les « données d'aberration récurrente » (cliquez sur un numéro de chromosome), basée sur une carte à l'échelle du génome des points de rupture chromosomiques dans le cancer humain par les Drs. Mitelman, Mertens et Johansson.


Codage de la séquence de référence de l'ADN

Problèmes d'expression familière CFTR la nomenclature des mutations réside principalement dans la numérotation des positions des nucléotides. Bien que les notations familières de CFTR les mutations sont également basées sur la séquence de référence de l'ADNc GenBank <"type":"entrez-nucleotide","attrs":<"text":"NM_000492.3","term_id":"90421312","term_text":"NM_000492 .3">> NM_000492.3, les notations familières utilisent la numérotation des nucléotides avec le A du codon d'initiation ATG au nucléotide numéro 133. On peut récupérer la séquence d'ADN codante (�S”) pour CFTR simplement en cliquant sur le lien CDS dans GenBank <"type":"entrez-nucleotide","attrs":<"text":"NM_000492.3","term_id":"90421312","term_text":"NM_000492. 3">> NM_000492.3 cela ouvre une fenêtre dans laquelle la numérotation des nucléotides commence par ʱ au A du codon d'initiation ATG, éliminant ainsi 132 nucléotides de la 5′-UTR. Il n'y a qu'une seule séquence de référence d'ADN codante pour un numéro d'accession GenBank donné, de sorte que l'on peut décrire les positions des nucléotides sans équivoque.


Signification biologique de la délétion 5q dans l'hématopoïèse et la fonction de la moelle osseuse

Les SMD sont des troubles clonaux des cellules souches hématopoïétiques caractérisés cliniquement par une hématopoïèse inefficace en raison d'anomalies de la prolifération, de la différenciation et de l'apoptose des précurseurs hématopoïétiques et de leur descendance. Ces troubles sont généralement plus fréquents chez les personnes âgées avec un âge médian au moment du diagnostic entre 60 et 80 ans (3, 20-22). Dans l'ensemble, le tableau clinique comprend des cytopénies périphériques dans le cadre d'une moelle osseuse normocellulaire ou hypercellulaire et un risque accru de transformation en LAM. La moelle osseuse hypocellulaire est moins fréquente dans le SMD. Un résumé des caractéristiques cliniques et hématologiques spécifiques au sous-type de syndrome 5q− de SMD est présenté sur la figure 1 (11, 13, 15, 22). Les caractéristiques de la moelle osseuse associées au syndrome 5q− comprennent des mégacaryocytes hypolobulés, une hypoplasie érythroïde et des blastes <5%.

Caractéristiques cliniques et pathologiques du syndrome 5q−.

Rôle des gènes suppresseurs de tumeurs dans la pathogenèse du SMD. Le chromosome 5q contient de nombreux gènes impliqués dans la régulation de l'hématopoïèse, notamment des cytokines et leurs récepteurs, des régulateurs du cycle cellulaire, des facteurs de transcription et des médiateurs de signalisation. Le regroupement des gènes hématologiques entre 5q13 et 5q33 suggère une corrélation entre l'anomalie génétique et les caractéristiques cliniques du syndrome 5q− et d'autres sous-types de SMD del(5q) (19, 23).

La prévalence des délétions 5q chez les patients atteints de SMD soulève la possibilité d'un gène suppresseur de tumeur sur le bras long du chromosome 5, dont la perte est l'événement de base conduisant à la progression de la maladie. Les efforts pour localiser un tel gène ont abouti à l'identification de régions critiques minimalement supprimées (24-26). Dans le syndrome 5q−, la région critique de la perte de gènes a été définie comme une région de 1,5 Mb à 5q31-q32 flanquée de D5S413 et le GLRA1 gène (25, 26). De nombreux gènes ont été cartographiés dans cette région, comme en témoigne un examen de la base de données Online Mendelian Inheritance in Man du National Center for Biotechnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/getmap.cgi? ). Le tableau 1 montre une sélection de gènes localisés sur le segment communément supprimé du chromosome 5 dans le syndrome 5q−. Cette région est distincte et distale d'une région de 1,5 Mb en 5q31.1 flanquée par les gènes IL-9 et EGR-1 et supprimé dans la LMA et d'autres formes de MDS impliquant des suppressions 5q (24, 27). La spécification de deux intervalles génomiques distincts sur le chromosome 5q implique qu'un gène ou un groupe de gènes différent contribue à la pathogenèse de ces différents troubles myéloïdes. Ces résultats sont cohérents avec la catégorisation du syndrome 5q− comme un sous-type distinct de MDS avec une pathogenèse différente de celle des autres formes de MDS impliquant des délétions 5q (28).

Gènes sélectionnés localisés dans le chromosome 5 (q31-q33)

À ce jour, aucun gène suppresseur de tumeur responsable du SMD sur le chromosome 5q n'a été identifié. Bien qu'il existe un certain nombre de candidats intéressants (par exemple, MEGF1 et G3BP), aucun ne s'est encore avéré critique pour la progression de la maladie (19, 28). Compte tenu de la grande taille des délétions 5q qui se produisent souvent dans le MDS et de l'absence d'un gène candidat clair, il est possible que l'un de plusieurs gènes puisse entraîner le MDS. Une autre possibilité est un effet de dosage génique causé par la suppression de plusieurs gènes contenus dans la région 5q, qui sont fonctionnellement liés à l'hématopoïèse.

Base clonale de la maladie dans le syndrome 5q−. La fréquence des délétions 5q, ainsi que d'autres anomalies chromosomiques dans le SMD, indique que ces anomalies ne sont pas des événements aléatoires mais reflètent plutôt l'évolution clonale et la pathogenèse en plusieurs étapes du SMD (21, 29). Selon un modèle en plusieurs étapes, des lésions génétiques initiatrices ou « primaires », qui peuvent être acquises ou causées par une mutation spontanée, au sein d'une cellule souche hématopoïétique favorisent l'acquisition d'événements génétiques « secondaires », caractérisés par des pertes et/ou des gains progressifs d'éléments chromosomiques spécifiques. régions (par exemple, 5q-, -7 ou +8 réf. 29). Ces altérations génétiques secondaires peuvent affecter le contrôle du cycle cellulaire, la transcription et/ou l'activité de suppression de tumeur, fournissant au clone MDS un avantage de croissance, entraînant une expansion du clone et un potentiel de transformation leucémique.

Pour identifier la cellule d'origine du syndrome 5q−, Nilsson et al. (30) cellules souches hématopoïétiques pluripotentes purifiées (CD34 + CD38 − ) de patients atteints de SMD avec une délétion 5q entre les bandes 5q13 et 5q33. Ceux-ci comprenaient des patients atteints du syndrome 5q−. Pratiquement toutes (>90%) les cellules CD34 + CD38 − appartenaient au clone délété 5q−, indiquant qu'une cellule souche hématopoïétique lymphomyéloïde est la cible principale des délétions 5q dans le MDS et que les délétions 5q représentent un événement précoce dans la pathogenèse du MDS (30). Notamment, bien qu'une cellule souche hématopoïétique pluripotente soit la cible principale des délétions 5q, les lymphocytes matures ne semblent pas être impliqués dans le clone 5q−, suggérant que la cellule souche pluripotente transformée n'a pas la capacité de se différencier vers les lymphocytes (30).

Distribution cellulaire de la délétion 5q31 dans la moelle osseuse dans le syndrome 5q−. Dans les frottis de moelle osseuse de patients atteints du syndrome 5q−, la délétion 5q31 est retrouvée dans les trois principales lignées hématopoïétiques (érythroblastes, précurseurs de granulocytes et mégacaryocytes réfs. 30, 31). Ceci est cohérent avec la transformation d'une cellule souche pluripotente, décrite ci-dessus, conservant la capacité de procéder le long de voies de différenciation multiples (30, 31). Bigoni et al. (31) ont constaté que malgré le fait que tous les érythrocytes dans les frottis de moelle osseuse de patients atteints du syndrome 5q− étaient systématiquement macrocytaires, la délétion 5q31 n'était observée que dans 35 à 50 % des érythroblastes. La présence de la délétion 5q31 dans seulement une partie des érythroblastes indique un mosaïcisme de cellules cytogénétiquement altérées et normales dans la moelle osseuse. Ce mosaïcisme a été trouvé dans les trois lignées dans le syndrome 5q− et semble être un phénomène général dans le MDS (31).

Effet de la délétion 5q sur le dysfonctionnement de la moelle osseuse. L'hématopoïèse inefficace dans le SMD est principalement due à une apoptose excessive des progéniteurs hématopoïétiques et de leur descendance dans la moelle osseuse (7, 32). Des taux accrus d'apoptose dans le SMD peuvent être déclenchés par des mécanismes cellulaires intrinsèques ou par un déséquilibre cytokine/facteur de croissance dans l'environnement local. Dans le syndrome 5q− et d'autres formes de MDS avec délétion 5q, l'anomalie génétique sous-jacente elle-même peut donner lieu à une production aberrante de cytokines et à une signalisation inappropriée due à la délétion d'un ou plusieurs des gènes correspondants (7). Le déséquilibre des cytokines dans la moelle osseuse peut avoir de larges effets sur l'hématopoïèse en altérant le développement et la fonction cellulaires, que des cellules spécifiques hébergent ou non la délétion 5q. En effet, des caractéristiques dysplasiques peuvent être trouvées dans les trois lignées principales chez les patients présentant des délétions 5q (18, 31).

Cependant, le dysfonctionnement de la moelle osseuse chez les patients atteints de SMD avec des délétions 5q peut être moins prononcé que dans d'autres formes de SMD. Washington et al. (33), par exemple, ont trouvé des taux d'apoptose significativement plus faibles dans les cellules de moelle osseuse isolées de patients atteints du syndrome 5q− par rapport aux patients atteints d'autres anémies réfractaires. Ils ont émis l'hypothèse qu'une apoptose plus faible dans le syndrome 5q− pourrait expliquer l'évolution clinique plus légère de la maladie et distinguer le syndrome 5q− des autres SMD. De plus, Lopez-Holgado et al. (34) ont trouvé une proportion plus élevée de progéniteurs myéloïdes engagés chez les patients présentant des délétions 5q par rapport aux patients atteints de SMD avec une trisomie 8 ou un caryotype normal. De plus, ces progéniteurs myéloïdes de patients présentant des délétions 5q étaient moins altérés, comme l'indiquent les efficacités de placage plus élevées dans les cultures de moelle osseuse à long terme par rapport aux progéniteurs de patients présentant un caryotype normal ou une monosomie 7. Ensemble, ces observations suggèrent un moindre degré de fonctionnement fonctionnel. atteinte en ce qui concerne l'hématopoïèse chez les patients atteints de SMD avec des délétions 5q par rapport à d'autres anomalies chromosomiques.


Organisations Organisations

Les groupes de soutien et de défense des droits peuvent vous aider à entrer en contact avec d'autres patients et familles, et ils peuvent fournir des services précieux. Beaucoup développent des informations centrées sur le patient et sont la force motrice de la recherche de meilleurs traitements et de remèdes possibles. Ils peuvent vous diriger vers des recherches, des ressources et des services. De nombreuses organisations ont également des experts qui servent de conseillers médicaux ou fournissent des listes de médecins/cliniques. Visitez le site Web du groupe ou contactez-les pour connaître les services qu'ils offrent. L'inclusion sur cette liste n'est pas une approbation par GARD.


Fond

Le cancer se forme par l'acquisition progressive d'altérations génétiques somatiques, y compris des mutations ponctuelles, des changements de nombre de copies et des événements de fusion, qui affectent la fonction de gènes critiques régulant la croissance et la survie cellulaires [1]. L'identification des oncogènes et des gènes suppresseurs de tumeurs ciblés par ces altérations a considérablement accéléré les progrès tant dans la compréhension de la pathogenèse du cancer que dans l'identification de nouvelles vulnérabilités thérapeutiques [2]. Les gènes ciblés par les altérations somatiques du nombre de copies (SCNA), en particulier, jouent un rôle central dans l'oncogenèse et le traitement du cancer [3]. Des améliorations spectaculaires à la fois des puces et des plates-formes de séquençage ont permis une caractérisation de plus en plus haute résolution des SCNA présents dans des milliers de génomes cancéreux [4-6].

Cependant, la découverte de nouveaux gènes du cancer ciblés par les SCNA est compliquée par deux défis fondamentaux. Premièrement, des altérations somatiques sont acquises de manière aléatoire au cours de chaque division cellulaire, dont seules certaines (altérations « pilotes ») favorisent le développement du cancer [7]. Des altérations sélectivement neutres ou faiblement délétères du « passager » peuvent néanmoins se fixer chaque fois qu'un sous-clone portant de telles altérations acquiert des mutations sélectivement bénéfiques qui favorisent la dominance clonale [8]. Deuxièmement, les SCNA peuvent affecter simultanément jusqu'à des milliers de gènes, mais les avantages sélectifs des altérations des conducteurs sont susceptibles d'être médiés par un ou quelques-uns de ces gènes. Pour ces raisons, des analyses et des expérimentations supplémentaires sont nécessaires pour distinguer les conducteurs des passagers et pour identifier les gènes qu'ils sont susceptibles de cibler.

Une approche courante pour identifier les conducteurs consiste à étudier de grandes collections d'échantillons de cancer, sur la notion que les régions contenant des événements de conducteur devraient être modifiées à des fréquences plus élevées que les régions contenant uniquement des passagers [4, 6, 7, 9-14]. Par exemple, nous avons développé un algorithme, GISTIC (Identification génomique de cibles significatives dans le cancer) [15], qui identifie les SCNA conducteurs probables en évaluant la fréquence et l'amplitude des événements observés. GISTIC a été appliqué à plusieurs types de cancer, y compris le glioblastome [10, 15], l'adénocarcinome pulmonaire [16], le mélanome [17], le carcinome colorectal [18], le carcinome hépatocellulaire [19], le carcinome ovarien [20], le médulloblastome [21] , et le carcinome épidermoïde du poumon et de l'œsophage [22], et a permis d'identifier plusieurs nouvelles cibles d'amplification (dont NKX2-1 [16], CDK8 [18], VEGFA [19], SOX2 [22], et MCL1 et BCL2L1 [4]) et les suppressions (EHMT1 [21]). Plusieurs algorithmes supplémentaires pour identifier les SCNA pilotes probables ont également été décrits [23–25] (examinés dans [26]).

Pourtant, plusieurs défis critiques n'ont pas encore été traités de manière adéquate par l'un des outils d'analyse du nombre de copies existants. Par exemple, nous et d'autres avons montré que l'abondance des SCNA dans les cancers humains varie en fonction de leur taille, les SCNA de longueur de bras chromosomique se produisant beaucoup plus fréquemment que les SCNA de taille légèrement plus grande ou plus petite [4, 27]. Par conséquent, les méthodes d'analyse doivent modéliser des génomes cancéreux complexes qui contiennent un mélange de types de SCNA se produisant à des taux de fond distincts. Les méthodes existantes de nombre de copies ont également utilisé ad hoc des heuristiques pour définir les régions génomiques susceptibles d'abriter de véritables cibles géniques cancéreuses. L'incapacité de ces méthodes à fournir a priori la confiance statistique a été une limitation majeure dans l'interprétation des analyses du nombre de copies, un problème important car les utilisateurs finaux utilisent généralement ces résultats pour hiérarchiser les gènes candidats pour des expériences de validation chronophages.

Nous décrivons ici plusieurs améliorations méthodologiques pour relever ces défis et validons les performances des algorithmes révisés dans des ensembles de données réels et simulés. Nous avons intégré ces changements dans un pipeline GISTIC révisé, appelé GISTIC 2.0.


FAQ sur les troubles chromosomiques

Que sont les chromosomes ?
Les chromosomes sont des paquets organisés d'ADN trouvés à l'intérieur des cellules de votre corps.[1] Votre ADN contient des gènes qui indiquent à votre corps comment se développer et fonctionner. Les humains ont 23 paires de chromosomes (46 au total). Vous héritez d'une paire de chromosomes de votre mère et l'autre de votre père. Les chromosomes varient en taille. Chaque chromosome a un centromère, qui divise le chromosome en deux sections inégales. La section la plus courte est appelée le bras p, et la section la plus longue est appelée le bras q.[1][2] MedlinePlus Genetics a une image utile d'un chromosome.


Existe-t-il différents types de chromosomes ?
Oui, il existe deux types différents de chromosomes, les chromosomes sexuels et les chromosomes autosomiques. Les chromosomes sexuels sont les chromosomes X et Y. Ils déterminent votre sexe (masculin ou féminin). Les femelles ont deux chromosomes X, XX, un X de leur père et un X de leur mère. Les hommes ont un chromosome X de leur mère et un chromosome Y de leur père, XY. Les mères apportent toujours un chromosome X (à leur fils ou à leur fille). Les pères peuvent contribuer un X ou un Y, qui détermine le sexe de l'enfant. Les chromosomes restants (paires 1 à 22) sont appelés chromosomes autosomiques. Ils contiennent le reste de votre information génétique.[1][2][3][4]


Quels sont les différents types de troubles chromosomiques ?
Les troubles chromosomiques peuvent être classés en deux principaux types numériques et structurels. Les troubles numériques surviennent lorsqu'il y a un changement dans le nombre de chromosomes (plus ou moins de 46). Des exemples de troubles numériques comprennent la trisomie, la monosomie et la triploïdie. L'un des troubles numériques les plus connus est probablement le syndrome de Down (trisomie 21).[1][2] D'autres types courants de troubles numériques comprennent la trisomie 13, la trisomie 18, le syndrome de Klinefelter et le syndrome de Turner.

Les troubles chromosomiques structurels résultent de cassures à l'intérieur d'un chromosome. Dans ces types de troubles, il peut y avoir plus ou moins de deux copies d'un gène. Cette différence de nombre de copies de gènes peut conduire à des différences cliniques chez les individus affectés. Les types de troubles structurels sont les suivants : [1][2] (cliquez sur chaque type pour afficher une illustration)

    , parfois appelées monosomies partielles, se produisent lorsqu'un morceau ou une section de matériel chromosomique est manquant. Les délétions peuvent se produire dans n'importe quelle partie de n'importe quel chromosome. Lorsqu'il n'y a qu'une seule cassure dans le chromosome, la délétion est appelée suppression de terminal parce que la fin (ou terminus) du chromosome est manquante. Lorsqu'il y a deux cassures dans le chromosome, la délétion est appelée une suppression interstitielle parce qu'un morceau de matériel chromosomique est perdu à l'intérieur du chromosome. Les suppressions trop petites pour être détectées au microscope sont appelées microdélétions.[1][2][5] Une personne avec une délétion n'a qu'une seule copie d'un segment chromosomique particulier au lieu des deux copies habituelles. Quelques exemples de syndromes de délétion chromosomique plus courants incluent le syndrome de cri-du-chat et le syndrome de délétion 22q11.2.
    , parfois appelées trisomies partielles, surviennent lorsqu'il y a une copie supplémentaire d'un segment d'un chromosome. Une personne avec une duplication a trois copies d'un segment chromosomique particulier au lieu des deux copies habituelles. Comme les délétions, les duplications peuvent se produire n'importe où le long du chromosome.[1][2][5] Quelques exemples de syndromes de duplication comprennent le syndrome de duplication 22q11.2 et le syndrome de duplication MECP2.
    se produisent lorsqu'un segment de chromosome est déplacé d'un chromosome à un autre. Dans les translocations équilibrées, il n'y a pas de gain ou de perte net détectable d'ADN.[1][2][5]
    se produisent lorsqu'un segment de chromosome est déplacé d'un chromosome à un autre. Dans les translocations déséquilibrées, la quantité globale d'ADN a été modifiée (une partie du matériel génétique a été acquise ou perdue).[1][2][5]
    se produisent lorsqu'un chromosome se brise à deux endroits et que le morceau d'ADN résultant est inversé et réinséré dans le chromosome. Les inversions qui impliquent le centromère sont appelées inversions péricentriques les inversions qui n'impliquent pas le centromère sont appelées inversions paracentriques.[1][2][5]
    sont des chromosomes anormaux avec des bras identiques - soit deux bras courts (p) ou deux bras longs (q). Les deux bras sont du même côté du centromère, sont de longueur égale et possèdent des gènes identiques. Le syndrome de Pallister-Killian est un exemple d'affection résultant de la présence d'un isochromosome.[2][5]
    résulter de la fusion anormale de deux morceaux de chromosomes, dont chacun comprend un centromère.[5]
    se forment lorsque les extrémités des deux bras du même chromosome sont supprimées, ce qui rend les extrémités cassées restantes du chromosome "collantes". Ces extrémités collantes se rejoignent ensuite pour former un anneau. La délétion à l'extrémité des deux bras du chromosome entraîne l'absence d'ADN, ce qui peut provoquer une anomalie chromosomique. MedlinePlus Genetics fournit un diagramme des étapes impliquées dans la formation d'un chromosome en anneau.[1][2][5] Un exemple d'affection en anneau est le syndrome du chromosome 14 en anneau.

Quelles sont les causes des troubles chromosomiques?
La cause exacte est inconnue, mais nous savons que des anomalies chromosomiques surviennent généralement lorsqu'une cellule se divise en deux (un processus normal par lequel une cellule passe). Parfois, des anomalies chromosomiques surviennent pendant le développement d'un ovule ou d'un spermatozoïde (appelé lignée germinale), et d'autres fois elles surviennent après la conception (appelée somatique). Au cours du processus de division cellulaire, le nombre correct de chromosomes est censé se retrouver dans les cellules résultantes. Cependant, des erreurs dans la division cellulaire, appelées non-disjonction, peuvent entraîner des cellules avec trop peu ou trop de copies d'un chromosome entier ou d'un morceau de chromosome,[1][6] Certains facteurs, comme lorsqu'une mère est de stade maternel avancé. l'âge (plus de 35 ans), peut augmenter le risque d'anomalies chromosomiques pendant une grossesse.[1]


Qu'est-ce que le mosaïcisme ?
Le mosaïcisme se produit lorsqu'une personne présente une anomalie chromosomique dans certaines cellules, mais pas toutes. Il est souvent difficile de prédire les effets du mosaïcisme car les signes et les symptômes dépendent des cellules du corps qui présentent l'anomalie chromosomique.[2][7] MedlinePlus Genetics fournit un diagramme du mosaïcisme.


Comment les troubles chromosomiques sont-ils diagnostiqués ?
Des troubles chromosomiques peuvent être suspectés chez les personnes présentant des retards de développement, des déficiences intellectuelles et/ou des anomalies physiques. Plusieurs types de tests génétiques peuvent identifier des troubles chromosomiques :

Quels signes et symptômes sont associés aux troubles chromosomiques rares?
En général, les effets des troubles chromosomiques rares varient. Avec une perte ou un gain de matériel chromosomique, les symptômes peuvent inclure une combinaison de problèmes physiques, de problèmes de santé, de difficultés d'apprentissage et de comportements difficiles. Les symptômes dépendent des parties dont les chromosomes sont impliqués. La perte d'un segment d'un chromosome est généralement plus grave que d'avoir une copie supplémentaire du même segment. En effet, lorsque vous perdez un segment d'un chromosome, vous risquez de perdre une copie d'un gène important dont votre corps a besoin pour fonctionner.[2]

Il existe des caractéristiques générales de troubles chromosomiques rares qui surviennent à des degrés divers chez la plupart des personnes touchées. Par exemple, un certain degré de trouble d'apprentissage et/ou de retard de développement se produira chez la plupart des personnes avec une perte ou un gain de matériel provenant des chromosomes 1 à 22. En effet, de nombreux gènes situés sur tous ces chromosomes fournissent des instructions pour un développement normal. et la fonction du cerveau.[2] Les prestataires de santé peuvent examiner le chromosome pour voir où il y a une cassure (un point de cassure). Ensuite, ils peuvent examiner quels gènes peuvent être impliqués sur le site de la rupture. Connaître le ou les gènes impliqués peut parfois, mais pas toujours, aider à prédire les signes et les symptômes.


Les troubles chromosomiques peuvent-ils être héréditaires ?
Bien qu'il soit possible d'hériter de certains types de troubles chromosomiques, de nombreux troubles chromosomiques ne sont pas transmis d'une génération à l'autre. Les troubles chromosomiques non héréditaires sont appelés de novo , ce qui signifie "nouveau".[6] Vous devrez parler à un professionnel de la génétique pour savoir comment (et si) un trouble chromosomique spécifique pourrait être hérité dans votre famille.

Comment puis-je trouver des individus avec le même trouble chromosomique ?
Chromosome Disorder Outreach (CDO) fournit des informations sur les conditions chromosomiques et l'appariement des familles. Contactez CDO pour plus d'informations sur la façon de communiquer avec d'autres familles.

Sensibilisation aux troubles chromosomiques
Case postale 724
Boca Raton, Floride 33429
Ligne d'assistance aux familles : 561-395-4252
Courriel : [email protected]
Site Internet : http://www.chromodisorder.org

Unique est une source d'information et de soutien pour les familles et les personnes touchées par des troubles chromosomiques rares. Cette organisation est basée au Royaume-Uni, mais accueille des membres dans le monde entier. Unique a également une liste de troubles chromosomiques enregistrés.

Unique - Groupe de soutien pour les troubles chromosomiques rares
Royaume-Uni
Téléphone : 440 1883 330766
Courriel : [email protected]
Site Internet : http://www.rarechromo.org


Comment puis-je trouver des études de recherche pour les personnes atteintes de troubles chromosomiques ?
Le dépôt de cellules génétiques humaines de l'Institut national des sciences médicales générales (NIGMS) a été créé en 1972 pour fournir une ressource centralisée et facilement accessible pour le matériel génétique d'individus présentant des anomalies héréditaires du métabolisme, des anomalies chromosomiques et d'autres troubles génétiques. Cette biobanque crée des lignées cellulaires, de l'ADN et d'autres matériaux à partir d'échantillons de sang ou de tissus et met ces ressources importantes à la disposition des scientifiques du monde entier pour faciliter la recherche sur le diagnostic, le traitement et la prévention des maladies rares. They are interested in collecting samples from individuals with chromosome disorders, including but not limited to: rare trisomies, ring chromosomes, micro deletion/duplication syndromes, and balanced and unbalanced translocations or inversions. Click on the link to learn more about this service.

The Developmental Genome Anatomy Project (DGAP) is a research effort to identify apparently chromosomal rearrangements in patients with multiple congenital anomalies and then to use these chromosomal rearrangements to map and identify genes that are disrupted or dysregulated in critical stages of human development. Click on the link to learn more about this study.

Chromosome Disorder Outreach provides information about latest research articles for chromosome disorders.


When might it be appropriate to speak with a genetics professional?
Individuals or families who are concerned about an inherited condition may benefit from a genetics consultation. The MedlinePlus Genetics Web site provides a list of reasons why a person or family might be referred to a genetics professional.

For more information on a specific chromosome abnormality, we encourage you to speak with a genetics professional. Genetics clinics are a source of information for individuals and families regarding genetic conditions, treatment, inheritance, and genetic risks to other family members.