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Pouvez-vous identifier ce nom d'espèce?

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J'ai trouvé cet animal à Thanjavur… C'est un mille-pattes… Mais je ne connais pas le nom de cette espèce…


Considérez ceci : Orthomorpha coarcata C'est le plus proche que j'ai obtenu, oui ce mille-pattes se trouve aussi ici à Odisha ! Mille-pattes noir et jaune


Pouvez-vous identifier ce nom d'espèce? - La biologie

Notion d'espèce biologique

Le concept d'espèce biologique définit une espèce comme des membres de populations qui se reproduisent réellement ou potentiellement dans la nature, et non en fonction de la similitude d'apparence. Bien que l'apparence soit utile pour identifier les espèces, elle ne définit pas les espèces.

L'apparence n'est pas tout
Les organismes peuvent sembler être semblables et être des espèces différentes. Par exemple, les alouettes de l'Ouest (Sturnelle négligée) et les alouettes de l'Est (Sturnella magna) semblent presque identiques les uns aux autres, mais ne se croisent pas les uns avec les autres — donc, ce sont des espèces distinctes selon cette définition.

L'alouette des champs (à gauche) et l'alouette des champs (à droite) semblent être identiques et leurs aires de répartition se chevauchent, mais leurs chants distincts empêchent les croisements.

Ajout au problème
Nous avons déjà signalé deux des difficultés du concept d'espèce biologique : que faites-vous des organismes asexués, et que faites-vous des organismes qui forment parfois des hybrides entre eux ? D'autres difficultés incluent :

    Qu'entend-on par « potentiellement des croisements ? » Si une population de grenouilles était divisée par une autoroute, comme illustré ci-dessous, qui empêchait les deux groupes de grenouilles de se croiser, devrions-nous les désigner comme des espèces distinctes ? Probablement pas —, mais à quelle distance doivent-ils être séparés avant de tracer la ligne ?

sont des espèces dont la répartition géographique forme un anneau et se chevauche aux extrémités. Les nombreuses sous-espèces de Ensatina les salamandres de Californie présentent de subtiles différences morphologiques et génétiques tout au long de leur aire de répartition. Ils se croisent tous avec leurs voisins immédiats à une exception près : là où les extrémités de l'aire de répartition se chevauchent dans le sud de la Californie, E. klaubéri et E. eschscholtzii ne pas se croiser. Alors, où marquons-nous le point de spéciation ?

Cette lignée de trilobites ci-dessous a évolué progressivement au fil du temps :

Devrions-nous considérer le trilobite A comme une espèce distincte du trilobite D, et si oui, où devrions-nous diviser la lignée en espèces distinctes ?


La biologie

La schistosomiase (bilharziose) est causée par certaines espèces de trématodes sanguins (douves) du genre Schistosome. Les trois principales espèces qui infectent les humains sont Schistosoma haematobium, S. japonicum, et S. mansoni. Trois autres espèces, plus localisées géographiquement, sont S. mekongi, S. intercalatum, et S. guineensis (auparavant considéré comme synonyme de S. intercalatum). Il y a également eu quelques rapports de schistosomes hybrides d'origine bovine (S. haematobium, X S. bovis, X S. curassoni, X S. mattheei) infectant les humains. Contrairement aux autres trématodes, qui sont hermaphrodites, Schistosome spp. sont dioïques (individus de sexes séparés).

De plus, d'autres espèces de schistosomes, qui parasitent les oiseaux et les mammifères, peuvent provoquer une dermatite cercarienne chez l'homme, mais ceci est cliniquement distinct de la schistosomiase.

Cycle de la vie

Schistosome les œufs sont éliminés avec les fèces ou l'urine, selon les espèces . Dans des conditions appropriées, les œufs éclosent et libèrent des miracidies , qui nagent et pénètrent dans des hôtes intermédiaires spécifiques des escargots . Les stades de l'escargot comprennent deux générations de sporocystes et la production de cercaires . Une fois libérées de l'escargot, les cercaires infectieuses nagent, pénètrent dans la peau de l'hôte humain , et perdent leurs queues fourchues, devenant des schistosomules . Les schistosomules migrent via la circulation veineuse vers les poumons, puis vers le cœur, puis se développent dans le foie, sortant du foie par la veine porte à maturité, . Les vers adultes mâles et femelles s'accouplent et résident dans les veinules mésentériques, dont l'emplacement varie selon les espèces (à quelques exceptions près) . Par exemple, S. japonicum se trouve plus fréquemment dans les veines mésentériques supérieures drainant l' intestin grêle , et S. mansoni survient plus souvent dans les veines mésentériques inférieures drainant le gros intestin. Cependant, les deux espèces peuvent occuper l'un ou l'autre emplacement et sont capables de se déplacer entre les sites. S. intercalatum et S. guineensis habitent également le plexus mésentérique inférieur mais plus bas dans l'intestin que S. mansoni. S. haematobium habite le plus souvent dans le plexus veineux vésiculaire et pelvien de la vessie, mais il peut également se trouver dans les veinules rectales. Les femelles (la taille varie de 7 à 28 mm, selon les espèces) déposent leurs œufs dans les petites veinules des systèmes porte et périvésical. Les œufs sont déplacés progressivement vers la lumière de l'intestin (S. mansoni,S. japonicum, S. mekongi, S. intercalatum/guineensis) et de la vessie et des uretères (S. haematobium) et sont éliminés avec les selles ou l'urine, respectivement .

Hôtes

Divers animaux tels que les bovins, les chiens, les chats, les rongeurs, les porcs, les chevaux et les chèvres, servent de réservoirs pour S. japonicum, et des chiens pour S. mekongi. S. mansoni est également fréquemment récupéré sur des primates sauvages dans les zones endémiques, mais est principalement considéré comme un parasite humain et non comme une zoonose.

Les hôtes intermédiaires sont des escargots du genre Biomphalaire, (S. mansoni), Oncomélanie (S. japonicum), Boulinus (S. haematobium, S. intercalatum, S. guineensis). Le seul hôte intermédiaire connu pour S. mekongi est Neotricula aperta.

Distribution géographique

Schistosoma mansoni se trouve principalement en Afrique subsaharienne et dans certains pays d'Amérique du Sud (Brésil, Venezuela, Suriname) et dans les Caraïbes, avec des rapports sporadiques dans la péninsule arabique.

S. haematobium se trouve en Afrique et dans des poches du Moyen-Orient.

S. japonicum se trouve en Chine, aux Philippines et à Sulawesi. Malgré son nom, il a longtemps été éliminé du Japon.

Les autres espèces moins communes qui infectent les humains ont des aires de répartition géographiques relativement restreintes. S. mekongi se produit de manière focale dans certaines parties du Cambodge et du Laos. S. intercalatum n'a été trouvé qu'en République démocratique du Congo S. guineensis se trouve en Afrique de l'Ouest. Instances d'infections avec hybride/introgressé Schistosome (S. haematobium X S. bovis, X S. curassoni, X S. mattheei) ont eu lieu en Corse, en France et dans certains pays d'Afrique de l'Ouest.

Présentation clinique

Les symptômes de la schistosomiase ne sont pas causés par les vers eux-mêmes mais par la réaction du corps aux œufs. De nombreuses infections sont asymptomatiques. Une réaction d'hypersensibilité cutanée locale après pénétration cutanée de cercaires peut survenir et se manifester par de petites lésions maculopapuleuses prurigineuses. La schistosomiase aiguë (fièvre de Katayama) est une réaction d'hypersensibilité systémique qui peut survenir des semaines après l'infection initiale, en particulier par S. mansoni et S. japonicum. Les manifestations comprennent des symptômes/signes systémiques, notamment fièvre, toux, douleurs abdominales, diarrhée, hépatosplénomégalie et éosinophilie.

Parfois, Schistosome les infections peuvent entraîner des lésions du système nerveux central. La granulomatose cérébrale peut être causée par une S. japonicum des œufs dans le cerveau et des lésions granulomateuses autour des œufs ectopiques dans la moelle épinière peuvent survenir chez S. mansoni et S. haematobium infections. Une infection continue peut provoquer des réactions granulomateuses et une fibrose dans les organes affectés (par exemple, le foie et la rate) avec des signes/symptômes associés.

Pathologie associée à S. mansoni et S. japonicum la schistosomiase comprend diverses complications hépatiques dues à l'inflammation et aux réactions granulomateuses, et des granulomes emboliques occasionnels des œufs dans le cerveau ou la moelle épinière. Pathologie de S. haematobium la schistosomiase comprend l'hématurie, la cicatrisation, la calcification, le carcinome épidermoïde et des granulomes d'œufs emboliques occasionnels dans le cerveau ou la moelle épinière.


Classification des espèces : Classification scientifique, Sous-espèces et Identification des espèces

Dans la classification traditionnelle, ou phylogénétique, l'espèce est la base taxonomique de la systématique, dont le rang est juste en dessous du type.

Classement scientifique

Dans la classification scientifique, une espèce vivante ou ayant vécu est désignée selon les règles de la nomenclature binomiale, établie par Carl von Linne au XVIIIe siècle. Selon cette classification, le nom d'une espèce consiste en un nom latin binomial qui combine le genre avec une ou deux épithètes spécifiques. Dans la mesure du possible, le nom est suivi de la citation du nom de l'auteur, abrégé (en botanique) ou complet (en zoologie), qui a le premier décrit l'espèce sous ce nom. Le nom de l'espèce est le binôme entier, pas seulement l'épithète spécifique.

Par exemple, les humains appartiennent au genre Homo et à l'espèce Homo sapiens.

Les noms scientifiques sont du latin "célèbre" et écrits en italique. Le genre est en majuscule, tandis que l'épithète spécifique d'origine est entièrement en minuscule. Lorsque le nom de l'auteur est cité en toutes lettres, il est en italique.

Lorsque le genre est connu mais que l'espèce n'est pas déterminée, il est d'usage d'utiliser comme épithète l'abréviation provisoire de l'espèce latine « sp. Après le nom du genre. Lorsque vous souhaitez désigner plusieurs espèces ou toutes les espèces d'un genre, l'abréviation « spp. (Pour le pluralisme des espèces) est ajouté. De même, « sous-espèce » est abrégé en « ssp. » (Pour les sous-espèces) et "sspp." Pluriel (pour le pluralisme des sous-espèces). Ces abréviations sont toujours écrites en caractères romains.

La nomenclature binomiale, et d'autres aspects formels de la nomenclature biologique, est le « système linnéen ». Ce système de nomenclature permet de définir un nom unique pour chaque espèce, valable dans le monde entier, contrairement à la classification vernaculaire.

Sous-espèce


Bergeronnette, Motacilla alba alba


Bergeronnette printanière, Motacilla alba yarrellii

Bergeronnette printanière Les deux mâles ont été décrits comme deux sous-espèces différentes au sein d'une même espèce : Motacilla alba.

Au sein d'une espèce donnée, une sous-espèce est un groupe d'individus qui sont isolés (pour des raisons géographiques, écologiques, anatomiques ou sensorielles) et se déplacent en dehors du gène actuel de l'espèce indicatrice.

Au bout d'un certain temps, ce groupe d'individus prend des caractéristiques spécifiques qui différencient l'espèce de référence. Ces caractères peuvent être nouveaux (apparition suite à une mutation par exemple) ou constituer une variable caractéristique de l'espèce indicatrice.

Les différentes sous-espèces sont souvent capables de les reproduire, car leurs différences ne sont pas (encore) suffisamment marquées pour constituer une barrière à la reproduction.

On peut s'interroger sur la validité de la définition d'une sous-espèce alors que connaître la définition d'espèce reste fluide et controversée. C'est ici aussi et tous les termes de la définition d'une espèce qui s'appliquent également à une sous-espèce.

Identification des espèces

Carl von Linne recensait au XVIIIe siècle environ 67 000 espèces différentes. Aujourd'hui, personne ne peut définir avec précision le nombre d'espèces sur la planète.

Alors qu'on estime qu'entre 5 et 30 millions d'espèces vivantes sur la planète, seules 1,5 à 1,8 million d'espèces ont été scientifiquement décrites (témoin des difficultés de la notion d'espèce, ce nombre en lui-même n'est pas clair). Les espèces marines ne représentent que 13% de toutes les espèces décrites, environ 275 000, dont 93 000 pour les seuls écosystèmes coralliens

La grande majorité des espèces non décrites sont des insectes (4 à 100 millions d'espèces selon les estimations, qui vivent principalement sur la canopée des forêts tropicales les Némathelminthes (ou vers ronds : 500 000 à 1 000 000' espèces), les procaryotes (Arche et Eukarya) et organismes unicellulaires eucaryotes : protozoaires ou Protophyta certains anciens champignons classés aujourd'hui comme Straménopiles ou Myxomycètes (désormais classés dans plusieurs groupes de protistes. ).

Selon la liste rouge de l'UICN en 2006 et les données les plus récentes, les espèces vivantes décrites peuvent être décomposées comme suit :

Espèces décrites et certains groupes vivants non décrits
312 655 usines, dont :
25 000 algues,
15 000 mousses,
13 025 fougères,
980 gymnospermes,
199 350 à feuilles larges,
59 300 monocotylédones
74 000-120 000 champignons, dont :
32 000 ascomycètes,
17 000 basidiomycètes
10 000 lichens
1 500 000 animaux :
30 000 Protozoaires,
1 440 000 invertébrés, dont :
1 100 000 arthropodes, 950 000 insectes 80 000 araignées 55 000 crustacés 13 000 myriapodes .
120 000 mollusques 100 000 gastéropodes 15 000 bivalves 850 céphalopodes .
80 000 vers ronds
20 000 vers plats (75% des parasites)
15 000 annélides
10 000 cnidaires
9 000 éponges
7 000 échinodermes
5 700 bryozoaires
2 500 tuniciers
60 516 vertébrés :
108 Agnatha (lamproies et myxines)
900 poissons cartilagineux (requins, raies et chimères)
30 000 poissons osseux
5 743 amphibiens
8 240 reptiles,
10 234 oiseaux,
5 416 mammifères.

Environ 16 000 nouvelles espèces sont décrites chaque année, dont 1 600 espèces marines Environ 10 espèces disparaissent naturellement (c'est-à-dire hors intervention de l'homme) chaque année mais c'est aussi en train de disparaître à cause de l'homme (voir Dodo, Diversité génétique.) : Edward O. Wilson estime le nombre à plusieurs milliers par an Selon l'Évaluation de l'écosystème du millénaire de 2005, le taux actuel d'extinction des espèces est au moins 1 000 fois le taux naturel, estimé sur les 10 derniers millions d'années.


National Science Foundation - Là où les découvertes commencent

Une conversation sur la conservation et la désignation des espèces


Plus de la moitié de toutes les espèces marines pourraient être au bord de l'extinction d'ici 2100, selon l'UNESCO.


4 janvier 2013

Il y a un peu plus de 39 ans, le 28 décembre 1973, la Loi sur les espèces en voie de disparition a été promulguée pour conserver les espèces menacées et en voie de disparition et leurs écosystèmes. Pour honorer cet anniversaire, Daphné Fautin de la National Science Foundation (NSF) a répondu aux questions sur la biodiversité.

En tant que biologiste marin, Fautin s'est littéralement rendu au bout du monde - des pôles aux tropiques - pour étudier la vie marine. Elle est actuellement gestionnaire de programme à la NSF, professeure d'écologie et de biologie évolutive à l'Université du Kansas et commissaire à la Commission internationale de nomenclature zoologique, qui établit des règles sur l'attribution de noms scientifiques aux animaux.

Qu'est-ce que la biodiversité ?

La biodiversité - abréviation de " diversité biologique " - est la variété et l'abondance des plantes, des animaux et d'autres êtres vivants sur Terre et dans des endroits particuliers. La biodiversité est absolument essentielle à la santé des écosystèmes. Et la survie humaine dépend de la santé de l'écosystème de notre planète.

Les forêts tropicales et les récifs coralliens sont connus pour leur biodiversité. Pourquoi tant de biodiversité est-elle concentrée dans ces types d'écosystèmes ?

Plus de 25 pour cent des espèces de poissons du monde et entre neuf et 12 pour cent de toutes les pêcheries du monde sont associés aux récifs coralliens. Plus de la moitié des espèces végétales et animales du monde vivent dans les forêts tropicales.

Nous ne savons pas avec certitude pourquoi les forêts tropicales et les récifs coralliens abritent tant de biodiversité. Une idée est que ces écosystèmes se produisent dans les climats tropicaux et qu'ils sont donc assez cohérents sur le plan climatique toute l'année.

Selon cette idée, les organismes tropicaux ont divergé parce qu'ils n'ont pas à faire face aux extrêmes climatiques comme le font les organismes à des latitudes (et des altitudes) plus élevées. Un lapin, par exemple, qui vit dans un endroit non tropical doit pouvoir manger certaines plantes en été et certaines autres plantes en hiver. Par conséquent, il doit rester un généraliste pour survivre.

En revanche, un lapin qui vit sous les tropiques peut se spécialiser dans la consommation de certaines plantes disponibles toute l'année en même temps, d'autres espèces de lapins (ou d'autres organismes) peuvent évoluer et se spécialiser dans la consommation d'autres plantes. Une telle spécialisation favorise la diversité.

Mais certaines preuves réfutent cette idée, comme le fait que tous les groupes de plantes et d'animaux ne présentent pas plus de diversité sous les tropiques qu'à des latitudes plus élevées. Ainsi, de nombreuses autres idées ont également été proposées pour expliquer l'extraordinaire biodiversité des tropiques.

Les insectes représentent une grande partie de la biodiversité sur Terre. Pourquoi?

De nombreuses statistiques confirment la biodiversité des insectes. Par exemple, plus de 850 000 espèces d'insectes ont été nommées. Et le poids total estimé des seules fourmis en Amazonie est quatre fois le poids estimé de tous les vertébrés terrestres de l'Amazonie, y compris tous les mammifères, oiseaux, reptiles et amphibiens !

Nous ne savons pas vraiment pourquoi les insectes représentent une si grande partie de la biodiversité de la Terre. C'est l'une des questions qui sont étudiées par les entomologistes—les gens qui font des recherches sur les insectes.

Une idée est que les insectes ont commencé à se diversifier lorsque les plantes à fleurs ont évolué sur Terre, et donc les insectes ont évolué avec les plantes à fleurs parce qu'elles sont si importantes dans la pollinisation des plantes.

Les insectes ont tendance à être petits et spécialisés : il peut y avoir un certain insecte qui aspire la sève cellulaire des tiges d'une plante particulière d'autres insectes qui mangent les feuilles de cette plante d'autres insectes qui se nourrissent du nectar de cette plante et d'autres insectes qui se nourrissent de cette plante pollen et polliniser la plante dans le processus. Ainsi, au fur et à mesure que les fleurs ont évolué, de nombreux insectes ont également évolué.

Cette idée des liens évolutifs entre les plantes à fleurs et les insectes est cohérente avec ce que nous voyons dans les océans : relativement peu d'espèces de plantes à fleurs et relativement peu d'espèces d'insectes vivent dans les océans.

(Soit dit en passant, la NSF a récemment publié un communiqué de presse qui a identifié quelques raisons intéressantes pour lesquelles les humains ont besoin d'insectes, même ceux qui sont embêtants.)

Combien d'espèces ont été décrites et nommées par les scientifiques jusqu'à présent ?

Selon certaines estimations fiables, il existe 1,9 million d'organismes eucaryotes connus. (Les organismes eucaryotes sont ceux qui sont constitués d'une ou plusieurs cellules avec un noyau de bactéries et les virus ne sont pas des organismes eucaryotes.)

Combien d'espèces existent sur Terre ?

Les estimations vont de 2 millions à 10 millions d'espèces.

Une estimation récente de 8,7 millions d'espèces a reçu beaucoup de presse, en partie, je suppose, à cause de sa prétendue précision et parce qu'elle correspond assez bien au chiffre souvent avancé selon lequel 80 pour cent de la biodiversité de la Terre n'a pas encore été découvert/nommé . Certains scientifiques estiment qu'il existe "au moins quatre fois" le nombre d'espèces connues sur Terre. S'il existe effectivement près de 2 millions d'organismes connus, cette estimation se traduirait par au moins 8 millions d'espèces.

Un article estimant le nombre d'espèces marines (auquel j'ai contribué) a été récemment publié. Selon cet article, 226 000 espèces qui vivent dans l'océan ont été nommées et décrites par des scientifiques, et 72 000 espèces supplémentaires sont dans des collections en attente d'être nommées et décrites.

Mais qui sait ce qui n'a pas encore été collecté ? Et bien sûr, comme je l'ai mentionné précédemment, les océans ont peu d'insectes, mais les insectes représentent l'essentiel de la biodiversité.

Comment les scientifiques peuvent-ils estimer le nombre total d'espèces sur Terre alors qu'il est évidemment impossible de compter ce qui n'a pas encore été compté ? En d'autres termes, comment pouvons-nous savoir ce que nous ne savons pas?

Les gens ont utilisé diverses méthodes créatives pour estimer le nombre total d'organismes sur Terre. Par exemple, une estimation très élevée a été faite il y a des années par un scientifique qui s'est rendu dans la jungle du Panama et a utilisé un insecticide pour pulvériser un arbre dans la jungle. Ensuite, beaucoup d'insectes sont morts et sont tombés de l'arbre au sol. Et le scientifique et ses collègues ont identifié et compté autant de ces insectes tombés que possible, et le reste a été compté comme inconnu. Ensuite, le scientifique a extrapolé à partir de la proportion d'espèces de cet arbre qui étaient connues par rapport aux inconnues pour produire une estimation globale des espèces connues par rapport aux espèces inconnues.

C'était un bon premier essai. Mais beaucoup de gens soulignent le fait que dans de nombreuses régions du monde, la proportion d'espèces connues par rapport aux espèces inconnues est plus élevée qu'au Panama. Ce fait suggère donc que l'estimation peut être excessive.

En 2011, un chercheur financé par la NSF a fourni la première preuve empirique de ce que l'on soupçonnait depuis longtemps : que la biodiversité favorise la qualité de l'eau. Quelles sont les autres raisons pour lesquelles nous avons besoin de biodiversité ?

Nous avons besoin de biodiversité pour manger. Nous devons préserver les espèces que nous utilisons comme nourriture, y compris les poissons de la mer. Nous devons également préserver les espèces qui servent de nourriture aux poissons que nous mangeons, afin que notre approvisionnement alimentaire persiste. Et nous devons également préserver toutes les espèces qui créent l'habitat qui permet à toutes ces espèces nécessaires de vivre, de frayer et d'élever leurs petits.

Donc, il y a toutes ces connexions dans le grand "web de la vie" que nous ne connaissons même pas encore. Et ces connexions soutiennent toutes les espèces sur Terre, y compris les espèces qui nous fournissent de la nourriture et des vêtements.

De plus, 50 pour cent de l'oxygène que nous respirons est produit par des plantes microscopiques qui vivent dans l'océan et les 50 pour cent restants sont produits par des plantes qui vivent sur terre.

(Si vous voulez en savoir plus sur la façon dont les différentes espèces de plantes aident les humains à survivre, regardez cette vidéo dynamique et optimiste produite par NSF.)

L'écosystème de la planète est parfois comparé à un avion. Vous pouvez perdre un rivet d'un avion et l'avion volera probablement. Vous pouvez perdre deux rivets pour un avion et l'avion volera probablement encore. Mais finalement, si vous perdez trop de rivets - et personne ne sait combien - l'avion s'écrasera.

Le même principe s'applique à l'écologie : vous pouvez perdre certaines espèces sans dommage majeur. Mais personne ne sait combien d'espèces peuvent être perdues avant que l'écosystème de la planète ne s'effondre.

Que signifie découvrir une nouvelle espèce ?

Une nouvelle espèce est une espèce qui n'a pas encore été formellement décrite et nommée selon des procédures scientifiques - et non une nouvellement évoluée.

Les gens dans la rue ou les gens dans la jungle peuvent avoir un nom pour cela. Mais si nous n'avons pas suivi les règles de nomenclature internationalement reconnues pour décrire et nommer une espèce, elle n'existe pas à certaines fins scientifiques.

Lorsque nous avons découvert une nouvelle espèce, cela signifie que nous avons enfin trouvé et suivi les procédures de la décrire formellement (la distinguer des autres espèces) et de lui donner un nom selon les règles de la nomenclature.

Combien de nouvelles espèces sont nommées chaque année ?

Entre 15 000 et 20 000 nouvelles espèces sont nommées chaque année.

Une espèce peut être découverte et collectée avant d'être décrite et nommée. Mais il n'est pas reconnu comme une nouvelle espèce distincte jusqu'à ce qu'il soit décrit et nommé.

Combien d'espèces disparaissent chaque année ?

Nous ne savons pas. Le site Web du Fonds mondial pour la nature indique que les experts ont calculé qu'entre 0,01 % et 0,10 % de toutes les espèces sur Terre s'éteignent chaque année.

Mais parce que nous ne savons pas combien d'espèces il y a, nous ne savons pas combien d'espèces ces pourcentages représentent réellement. Et donc, si la faible estimation du nombre d'espèces sur Terre est vraie - s'il y a environ 2 millions d'espèces sur notre planète - alors entre 200 et 2 000 extinctions se produisent chaque année.

Mais si, en fait, il y a vraiment 10 millions d'espèces sur Terre, alors entre 10 000 et 100 000 extinctions se produisent chaque année.

Que diriez-vous aux opposants qui soutiennent que les espèces nouvellement découvertes compensent les pertes d'espèces et qu'il n'y a donc pas vraiment de crise d'extinction ?

Les "nouvelles" espèces ne sont pas nouvellement évoluées. Ils ont évolué il y a longtemps. Ils sont simplement nouvellement découverts par la science. Ils peuvent être très bien connus des personnes vivant dans les régions où ils vivent. Donc, ils ne sont pas nouveaux dans ce sens, ils ne sont nouveaux que pour ceux d'entre nous qui les nomment.

En quoi consiste le processus de désignation d'une espèce ?

Cela peut être un processus long, prolongé et difficile qui peut prendre de nombreuses années. Tout d'abord, vous voulez être sûr que l'animal ou la plante n'a pas été nommé auparavant.

Cela peut être difficile pour diverses raisons. D'une part, de nombreuses descriptions qui ont été préparées au début étaient très vagues. Et généralement, seuls de petits groupes d'experts ont l'expertise spécialisée pour savoir ce qui a et n'a pas été décrit auparavant.

Et pour nommer une espèce, il faut aussi la décrire. Pour ce faire, vous devez savoir quels types de caractéristiques sont utilisés pour identifier les espèces et déterminer ce qui distingue les "nouvelles" espèces des espèces connues. C'est important, car au moins selon les règles de la nomenclature zoologique, lorsque vous publiez une description d'une nouvelle espèce, vous devez écrire ce qui la rend différente de tout ce qui est déjà connu - y compris les organismes qui ne sont pas étroitement liés à ça, mais ça y ressemble quand même.

Par exemple, supposons que vous ayez un organisme qui a une tache rouge, vous devez alors distinguer votre "nouvelle" espèce de tout ce qui est tacheté de rouge, même si ces autres espèces à taches rouges ne sont pas étroitement liées à votre espèce. De cette façon, lorsque quelqu'un rencontre votre espèce, il peut dire : « Aha ! Ceci est un autre de ces organismes à points rouges qui est couvert par ce nouveau nom, ce n'est pas une autre chose avec des points rouges."

D'autres règles des codes de nomenclature vous obligent à nommer les espèces en latin ou à les faire sonner comme du latin. Vous devez également vous assurer qu'un spécimen de votre espèce est déposé dans une collection d'histoire naturelle (généralement dans un musée ou un herbier). Si la "nouvelle" espèce est un animal, vous devrez peut-être également enregistrer le nom dans ZooBank (le registre officiel de la nomenclature zoologique).

Et puis vous devez publier votre description de l'espèce dans une revue scientifique, afin que d'autres scientifiques puissent la regarder et convenir qu'elle est correcte.

Il est intéressant de noter que les noms acceptés sont fréquemment plus tard " coulés " pour diverses raisons. Par exemple, lorsque les devoirs exhaustifs requis pour décrire et nommer une "nouvelle" espèce ne sont pas menés de manière complète et approfondie, il peut finalement s'avérer que la "nouvelle" espèce a déjà été décrite et nommée.

Alternativement, un nom pour une "nouvelle" espèce peut être coulé parce que la différence qui était censée la distinguer des autres ne tient pas. Par exemple, j'ai un collègue qui a décrit plusieurs poissons de récifs coralliens comme "nouveaux" - pour finalement découvrir que la "nouvelle" espèce appartenait à une espèce pour laquelle un seul sexe avait été identifié auparavant. Ainsi, la "nouvelle" espèce n'était en réalité qu'une femelle (ou un mâle) d'une espèce connue !

Faut-il être un taxonomiste professionnel pour identifier et nommer de nouvelles espèces?

Environ la moitié des espèces qui sont nommées chaque année sont nommées par des personnes qui ne sont pas employées comme taxonomistes - dont le travail n'est pas dans un musée ou une université. En fait, certaines des personnes ayant le plus d'expertise et de temps pour le faire ne sont pas des professionnels dans le domaine.

Par exemple, j'ai connu un dentiste qui est l'une des plus grandes autorités mondiales en matière de cicindèles. Il avait obtenu une maîtrise en entomologie. Et puis il s'est rendu compte que s'il s'était lancé dans l'entomologie universitaire, il passerait son temps à enseigner, à rédiger des demandes de subventions et à faire du travail administratif, mais il voulait attraper des cicindèles.

Il s'est donc tourné vers la dentisterie afin de gagner suffisamment d'argent pour s'absenter chaque année pour attraper des scarabées tigres. Il a probablement ainsi fini par passer plus de temps à chasser les cicindèles en tant que dentiste qu'il ne l'aurait fait s'il était devenu entomologiste professionnel.

Une nouvelle espèce de grenouille a récemment été identifiée par un chercheur financé par la NSF à New York. Est-ce courant que de nouvelles espèces soient découvertes dans des endroits aussi peuplés ?

Je pense qu'il est assez courant de trouver de nouvelles espèces dans les zones peuplées.

À l'été 2012, un chercheur financé par la NSF a nommé un nouveau crustacé des récifs coralliens du nom de Bob Marley, le chanteur. Est-ce inhabituel que des espèces portent le nom de célébrités ?

C'est peut-être moins courant qu'avant.

Il y a de nombreuses années, il était courant qu'un mécène finance les voyages d'un scientifique dans des endroits exotiques, puis les espèces trouvées au cours de ces voyages seraient nommées en l'honneur du mécène.

Parlez-moi d'un des gros problèmes qui réduit la biodiversité dans les océans ?

Nous avons épuisé les océans de bon nombre des gros poissons que nous mangeons.

Une partie de la raison pour laquelle nous sommes capables de surpêcher est due à la technologie. Nous avons des sondeurs, divers types d'appareils de localisation, y compris du matériel de sonar, et des avions qui sont utilisés pour aider à trouver des bancs de poissons. Et nous en savons maintenant suffisamment sur la biologie marine pour prédire où se trouveront les poissons et les crustacés dans des conditions particulières. La pêche, ce n'est plus qu'un pêcheur se contente de dire, je vais lâcher une ligne ici ou là. » La pêche est devenue très scientifique et méthodique.

Lorsque nous chalutons, nous traînons des filets au fond de l'océan. Et tout ce qui est balayé par ces filets en plus du poisson cible est appelé "prises accessoires".

Mais combien d'organismes peuvent réussir à survivre après avoir été pris dans un grand filet, remonté puis rejeté dans l'océan ? De plus, le chalutage détruit l'habitat une fois que le fond de l'océan a été chaluté, ce n'est peut-être plus un foyer approprié pour ce qui est rejeté.

La situation sur terre serait analogue si nous faisions voler un avion qui traînait un grand filet sur le sol pour attraper le bétail au pâturage. Et nous tirions le filet périodiquement - et gardions le bétail, mais rejetions les chiens, les arbres et tout ce que nous avions au filet en plus du bétail. C'est semblable à ce que nous faisons aux océans.

Beaucoup de gens pensent qu'il vaut mieux consommer du poisson et des crevettes d'élevage que du poisson et des crevettes sauvages. Mais de nombreuses pratiques d'élevage de poissons et de crevettes sont également nocives pour l'environnement. Ce n'est pas parce qu'il est d'élevage qu'il est écologiquement neutre ou préféré à la pêche sauvage.

Pouvez-vous citer des "bonnes nouvelles" en matière de biodiversité ?

J'ai lu l'autre jour que nous avions perdu 97 pour cent des tigres sauvages en un peu plus d'un siècle. Seuls environ 3 200 tigres restent actuellement à l'état sauvage. Nous pouvons en déduire que les populations de nombreuses petites espèces sont en chute libre, tout comme les populations de nombreuses grandes espèces sont en chute libre.

Mais je suis heureux de dire que quelques espèces ont sont retirés de la liste des espèces menacées, comme le loup et le pygargue à tête blanche, parce que des plans pour leur rétablissement ont été adoptés.

De plus, il y a des histoires de "bonnes nouvelles" dans l'histoire des baleines. Beaucoup d'entre eux ont été chassés au bord de l'extinction, puis ils ont été répertoriés comme en voie de disparition. Il est donc devenu juridiquement, socialement et économiquement difficile de récolter des baleines, et les populations de nombreuses espèces de baleines se sont heureusement rétablies.

Ce genre de succès montre que si nous arrêtons de récolter des espèces et si leur habitat est conservé, la vie est résiliente et les espèces menacées peuvent se rétablir.

Ressources additionnelles

Pour en savoir plus sur la biodiversité et contribuer à promouvoir la conservation :

  • Lisez à propos de la loi sur les espèces en voie de disparition sur les sites Web du U.S. Fish & Wildlife Service et de la National Oceanic and Atmospheric Administration.
  • Rejoignez des groupes de sciences citoyennes qui s'efforcent d'identifier et de suivre les espèces d'oiseaux, de papillons, de coccinelles, de plantes et d'autres créatures, de faire progresser notre compréhension de la nature et d'augmenter l'habitat de la faune.
  • Limitez vos achats de fruits de mer dans les restaurants et les magasins aux produits respectueux de l'océan. Les ressources fournies par le programme Seafood Watch de l'Aquarium de Monterey Bay peuvent vous aider à le faire.


Daphné Fautin recherche de nouveaux organismes tout en menant une enquête marine.
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Les enquêteurs
Daphné Fautin


Daphné Fautin recherche de nouveaux organismes tout en menant une enquête marine.
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Contenu

Le nom est composé de deux éléments de formation de mots : bi- (préfixe latin signifiant « deux ») et nomial (littéralement 'nom'). En latin médiéval, le mot apparenté binôme a été utilisé pour signifier un terme dans une expression binomiale en mathématiques. [4] Le mot nomen (pluriel nomina) signifie « nom » en latin.

Prior to the adoption of the modern binomial system of naming species, a scientific name consisted of a generic name combined with a specific name that was from one to several words long. Together they formed a system of polynomial nomenclature. [5] These names had two separate functions. First, to designate or label the species, and second, to be a diagnosis or description however these two goals were eventually found to be incompatible. [6] In a simple genus, containing only two species, it was easy to tell them apart with a one-word genus and a one-word specific name but as more species were discovered, the names necessarily became longer and unwieldy, for instance, Plantago foliis ovato-lanceolatus pubescentibus, spica cylindrica, scapo tereti ("plantain with pubescent ovate-lanceolate leaves, a cylindric spike and a terete scape"), which we know today as Plantago media.

Such "polynomial names" may sometimes look like binomials, but are significantly different. For example, Gerard's herbal (as amended by Johnson) describes various kinds of spiderwort: "The first is called Phalangium ramosum, Branched Spiderwort the second, Phalangium non ramosum, Unbranched Spiderwort. The other . is aptly termed Phalangium Ephemerum Virginianum, Soon-Fading Spiderwort of Virginia". [7] The Latin phrases are short descriptions, rather than identifying labels.

The Bauhins, in particular Caspar Bauhin (1560–1624), took some important steps towards the binomial system, by pruning the Latin descriptions, in many cases to two words. [8] The adoption by biologists of a system of strictly binomial nomenclature is due to Swedish botanist and physician Carl Linnaeus (1707–1778). It was in Linnaeus's 1753 Species Plantarum that he began consistently using a one-word "trivial name" (nomen triviale) after a generic name (genus name) in a system of binomial nomenclature. [9] Trivial names had already appeared in his Critica Botanica (1737) and Philosophia Botanica (1751). This trivial name is what is now known as a specific epithet (ICNafp) or specific name (ICZN). [9] The Bauhins' genus names were retained in many of these, but the descriptive part was reduced to a single word.

Linnaeus's trivial names introduced an important new idea, namely that the function of a name could simply be to give a species a unique label. This meant that the name no longer need be descriptive for example both parts could be derived from the names of people. Thus Gerard's Phalangium ephemerum virginianum devenu Tradescantia virginiana, where the genus name honoured John Tradescant the Younger, [note 1] an English botanist and gardener. [10] A bird in the parrot family was named Psittacus alexandri, meaning "Alexander's parrot", after Alexander the Great, whose armies introduced eastern parakeets to Greece. [11] Linnaeus's trivial names were much easier to remember and use than the parallel polynomial names and eventually replaced them. [2]

The value of the binomial nomenclature system derives primarily from its economy, its widespread use, and the uniqueness and stability of names that the Codes of Zoological and Botanical, Bacterial and Viral Nomenclature provide:

  • Economy. Compared to the polynomial system which it replaced, a binomial name is shorter and easier to remember. [2] It corresponds to the widespread system of family name plus given name(s) used to name people in many cultures. [8]
  • Widespread use. The binomial system of nomenclature is governed by international codes and is used by biologists worldwide. [12] A few binomials have also entered common speech, such as Homo sapiens, E. coli, Boa constrictor, et Tyrannosaure rex.
  • Uniqueness. Provided that taxonomists agree as to the limits of a species, it can have only one name that is correct under the appropriate nomenclature code, generally the earliest published if two or more names are accidentally assigned to a species. [13] However, establishing that two names actually refer to the same species and then determining which has priority can be difficult, particularly if the species was named by biologists from different countries. Therefore, a species may have more than one regularly used name all but one of these names are "synonyms". [14] Furthermore, within zoology or botany, each species name applies to only one species. If a name is used more than once, it is called a homonym.

Binomial nomenclature for species has the effect that when a species is moved from one genus to another, sometimes the specific name or epithet must be changed as well. This may happen because the specific name is already used in the new genus, or to agree in gender with the new genus if the specific epithet is an adjective modifying the genus name. Some biologists have argued for the combination of the genus name and specific epithet into a single unambiguous name, or for the use of uninomials (as used in nomenclature of ranks above species). [18] [19]

Because genus names are unique only within a nomenclature code, it is possible for two or more species to share the same genus name and even the same binomial if they occur in different kingdoms. At least 1,240 instances of genus name duplication occur (mainly between zoology and botany). [20] [21]

Nomenclature (including binomial nomenclature) is not the same as classification, although the two are related. Classification is the ordering of items into groups based on similarities or differences in biological classification, species are one of the kinds of item to be classified. [22] In principle, the names given to species could be completely independent of their classification. This is not the case for binomial names, since the first part of a binomial is the name of the genus into which the species is placed. Above the rank of genus, binomial nomenclature and classification are partly independent for example, a species retains its binomial name if it is moved from one family to another or from one order to another, unless it better fits a different genus in the same or different family, or it is split from its old genus and placed in a newly created genus. The independence is only partial since the names of families and other higher taxa are usually based on genera. [ citation requise ]

Taxonomy includes both nomenclature and classification. Its first stages (sometimes called "alpha taxonomy") are concerned with finding, describing and naming species of living or fossil organisms. [23] Binomial nomenclature is thus an important part of taxonomy as it is the system by which species are named. Taxonomists are also concerned with classification, including its principles, procedures and rules. [24]

A complete binomial name is always treated grammatically as if it were a phrase in the Latin language (hence the common use of the term "Latin name" for a binomial name). However, the two parts of a binomial name can each be derived from a number of sources, of which Latin is only one. Ceux-ci inclus:

  • Latin, either classical or medieval. Thus, both parts of the binomial name Homo sapiens are Latin words, meaning "wise" (sapiens) "human/man" (Homo). . Le genre Rhododendron was named by Linnaeus from the Greek word ῥοδόδενδρον , itself derived from rhodon, "rose", and dendron, "tree". [25][26] Greek words are often converted to a Latinized form. Thus coca (the plant from which cocaine is obtained) has the name Erythroxylum coca. Erythroxylum is derived from the Greek words erythros, red, and xylon, wood. [27] The Greek neuter ending - ον (-on) is often converted to the Latin neuter ending -um. [note 2]
  • Other languages. The second part of the name Erythroxylum coca is derived from kuka, the name of the plant in Aymara and Quechua. [28][29] Since many dinosaur fossils were found in Mongolia, their names often use Mongolian words, e.g. Tarchia de tarkhi, meaning "brain", or Saichania meaning "beautiful one".
  • Names of people (often naturalists or biologists). Le nom Magnolia campbellii commemorates two people: Pierre Magnol, a French botanist, and Archibald Campbell, a doctor in British India. [30]
  • Names of places. The lone star tick, Amblyomma americanum, is widespread in the United States. [31]
  • Other sources. Some binominal names have been constructed from taxonomic anagrams or other re-orderings of existing names. Thus the name of the genus Muilla is derived by reversing the name Allium. [32] Names may also be derived from jokes or puns. For example, Ratcliffe described a number of species of rhinoceros beetle, including Cyclocephala nodanotherwon. [33]

The first part of the name, which identifies the genus, must be a word which can be treated as a Latin singular noun in the nominative case. It must be unique within the purview of each nomenclatural code, but can be repeated between them. Ainsi Huia recurvata is an extinct species of plant, found as fossils in Yunnan, China, [34] whereas Huia masonii is a species of frog found in Java, Indonesia. [35]

The second part of the name, which identifies the species within the genus, is also treated grammatically as a Latin word. It can have one of a number of forms:

  • The second part of a binomial may be an adjective. The adjective must agree with the genus name in gender. Latin has three genders, masculine, feminine and neuter, shown by varying endings to nouns and adjectives. The house sparrow has the binomial name Passer domesticus. Ici domesticus ("domestic") simply means "associated with the house". The sacred bamboo is Nandina domesticune[36] rather than Nandina domesticnous, puisque Nandina is feminine whereas Passer is masculine. The tropical fruit langsat is a product of the plant Lansium parasiticum, puisque Lansium is neuter. Some common endings for Latin adjectives in the three genders (masculine, feminine, neuter) are -us, -une, -um (as in the previous example of domesticus) -is, -is, -e (e.g. tristis, meaning "sad") and -or, -or, -us (e.g. mineur, meaning "smaller"). For further information, see Latin declension: Adjectives.
  • The second part of a binomial may be a noun in the nominative case. An example is the binomial name of the lion, which is Panthera lion. Grammatically the noun is said to be in apposition to the genus name and the two nouns do not have to agree in gender in this case, Panthera is feminine and Leo is masculine.
  • The second part of a binomial may be a noun in the genitive (possessive) case. The genitive case is constructed in a number of ways in Latin, depending on the declension of the noun. Common endings for masculine and neuter nouns are -ii ou -i in the singular and -orum in the plural, and for feminine nouns -ae in the singular and -arum in the plural. The noun may be part of a person's name, often the surname, as in the Tibetan antelope (Pantholops hodgsonii), the shrub Magnolia hodgsonii, or the olive-backed pipit (Anthus hodgsoni). The meaning is "of the person named", so that Magnolia hodgsonii means "Hodgson's magnolia". Les -ii ou -i endings show that in each case Hodgson was a man (not the same one) had Hodgson been a woman, hodgsonae would have been used. The person commemorated in the binomial name is not usually (if ever) the person who created the name for example Anthus hodgsoni was named by Charles Wallace Richmond, in honour of Hodgson. Rather than a person, the noun may be related to a place, as with Latimeria chalumnae, meaning "of the Chalumna River". Another use of genitive nouns is in, for example, the name of the bacterium Escherichia coli, où coli means "of the colon". This formation is common in parasites, as in Xenos vesparum, où vesparum means "of the wasps", since Xenos vesparum is a parasite of wasps.

Whereas the first part of a binomial name must be unique within the purview of each nomenclatural code, the second part is quite commonly used in two or more genera (as is shown by examples of hodgsonii above). The full binomial name must be unique within each code.

From the early 19th century onwards it became ever more apparent that a body of rules was necessary to govern scientific names. In the course of time these became nomenclature codes. Les International Code of Zoological Nomenclature (ICZN) governs the naming of animals, [37] the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (ICNafp) that of plants (including cyanobacteria), and the International Code of Nomenclature of Bacteria (ICNB) that of bacteria (including Archaea). Virus names are governed by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), a taxonomic code, which determines taxa as well as names. These codes differ in certain ways, e.g.:

  • "Binomial nomenclature" is the correct term for botany, [38] although it is also used by zoologists. [39] Since 1953, "binomimal nomenclature" is the technically correct term in zoology. A binominal name is also called a binomen (plural binomina). [40]
  • Both codes consider the first part of the two-part name for a species to be the "generic name". In the zoological code (ICZN), the second part of the name is a "specific name". In the botanical code (ICNafp), it is a "specific epithet". Together, these two parts are referred to as a "species name" or "binomen" in the zoological code or "species name", "binomial", or "binary combination" in the botanical code. "Species name" is the only term common to the two codes.
  • Les ICNafp, the plant code, does not allow the two parts of a binomial name to be the same (such a name is called a tautonym), whereas the ICZN, the animal code, does. Thus the American bison has the binomial Bison bison a name of this kind would not be allowed for a plant.
  • The starting points, the time from which these codes are in effect (retroactively), vary from group to group. In botany the starting point will often be in 1753 (the year Carl Linnaeus first published Species Plantarum). In zoology the starting point is 1758 (1 January 1758 is considered the date of the publication of Linnaeus's Systema Naturae, 10th Edition, and also Clerck'sAranei Svecici). Bacteriology started anew, with a starting point on 1 January 1980. [41]

Unifying the different codes into a single code, the "BioCode", has been suggested, although implementation is not in sight. (There is also a published code for a different system of biotic nomenclature which does not use ranks above species, but instead names clades. This is called the PhyloCode.)

Differences in handling personal names Edit

As noted above, there are some differences between the codes in the way in which binomials can be formed for example the ICZN allows both parts to be the same, while the ICNafp ne fait pas. Another difference is in the way in which personal names are used in forming specific names or epithets. Les ICNafp sets out precise rules by which a personal name is to be converted to a specific epithet. In particular, names ending in a consonant (but not "er") are treated as first being converted into Latin by adding "-ius" (for a man) or "-ia" (for a woman), and then being made genitive (i.e. meaning "of that person or persons"). This produces specific epithets like lecardii for Lecard (male), wilsoniae for Wilson (female), and brauniarum for the Braun sisters. [42] By contrast the ICZN does not require the intermediate creation of a Latin form of a personal name, allowing the genitive ending to be added directly to the personal name. [43] This explains the difference between the names of the plant Magnolia hodgsonii and the bird Anthus hodgsoni. De plus, le ICNafp requires names not published in the form required by the code to be corrected to conform to it, [44] whereas the ICZN is more protective of the form used by the original author. [45]

By tradition, the binomial names of species are usually typeset in italics for example, Homo sapiens. [46] Generally, the binomial should be printed in a font style different from that used in the normal text for example, "Several more Homo sapiens fossils were discovered." When handwritten, a binomial name should be underlined for example, Homo sapiens. [47]

The first part of the binomial, the genus name, is always written with an initial capital letter. Older sources, particularly botanical works published before the 1950s, use a different convention. If the second part of the name is derived from a proper noun, e.g. the name of a person or place, a capital letter was used. Thus the modern form Berberis darwinii was written as Berberis Darwinii. A capital was also used when the name is formed by two nouns in apposition, e.g. Panthera Leo ou Centaurea Cyanus. [48] [note 3] In current usage, the second part is never written with an initial capital. [50] [51]

When used with a common name, the scientific name often follows in parentheses, although this varies with publication. [52] For example, "The house sparrow (Passer domesticus) is decreasing in Europe."

The binomial name should generally be written in full. The exception to this is when several species from the same genus are being listed or discussed in the same paper or report, or the same species is mentioned repeatedly in which case the genus is written in full when it is first used, but may then be abbreviated to an initial (and a period/full stop). [53] For example, a list of members of the genus Canis might be written as "Canis lupus, C. aureus, C. simensis". In rare cases, this abbreviated form has spread to more general use for example, the bacterium Escherichia coli is often referred to as just E. coli, et Tyrannosaure rex is perhaps even better known simply as T. rex, these two both often appearing in this form in popular writing even where the full genus name has not already been given.

The abbreviation "sp." is used when the actual specific name cannot or need not be specified. The abbreviation "spp." (plural) indicates "several species". These abbreviations are not italicised (or underlined). [54] For example: "Canis sp." means "an unspecified species of the genus Canis", while "Canis spp." means "two or more species of the genus Canis". (These abbreviations should not be confused with the abbreviations "ssp." (zoology) or "subsp." (botany), plurals "sspp." or "subspp.", referring to one or more subspecies. See trinomen (zoology) and infraspecific name.)

The abbreviation "cf." (i.e. confer in Latin) is used to compare individuals/taxa with known/described species. Conventions for use of the "cf." qualifier vary. [55] In paleontology, it is typically used when the identification is not confirmed. [56] For example, "Corvus cf. nasicus" was used to indicate "a fossil bird similar to the Cuban crow but not certainly identified as this species". [57] In molecular systematics papers, "cf." may be used to indicate one or more undescribed species assumed related to a described species. For example, in a paper describing the phylogeny of small benthic freshwater fish called darters, five undescribed putative species (Ozark, Sheltowee, Wildcat, Ihiyo, and Mamequit darters), notable for brightly colored nuptial males with distinctive color patterns, [58] were referred to as "Etheostoma cf. spectabile" because they had been viewed as related to, but distinct from, Etheostoma spectabile (orangethroat darter). [59] This view was supported in varying degrees by DNA analysis. The somewhat informal use of taxa names with qualifying abbreviations is referred to as open nomenclature and it is not subject to strict usage codes.

In some contexts the dagger symbol ("†") may be used before or after the binomial name to indicate that the species is extinct.

Authority Edit

In scholarly texts, at least the first or main use of the binomial name is usually followed by the "authority" – a way of designating the scientist(s) who first published the name. The authority is written in slightly different ways in zoology and botany. For names governed by the ICZN the surname is usually written in full together with the date (normally only the year) of publication. Les ICZN recommends that the "original author and date of a name should be cited at least once in each work dealing with the taxon denoted by that name." [60] For names governed by the ICNafp the name is generally reduced to a standard abbreviation and the date omitted. The International Plant Names Index maintains an approved list of botanical author abbreviations. Historically, abbreviations were used in zoology too.

When the original name is changed, e.g. the species is moved to a different genus, both codes use parentheses around the original authority the ICNafp also requires the person who made the change to be given. Dans le ICNafp, the original name is then called the basionym. Some examples:

  • (Plant) Amaranthus retroflexus L. – "L." is the standard abbreviation for "Linnaeus" the absence of parentheses shows that this is his original name.
  • (Plant) Hyacinthoides italica (L.) Rothm. – Linnaeus first named the Italian bluebell Scilla italica that is the basionym. Rothmaler later transferred it to the genus Hyacinthoides.
  • (Animal) Passer domesticus (Linnaeus, 1758) – the original name given by Linnaeus was Fringilla domestica unlike the ICNafp, les ICZN does not require the name of the person who changed the genus to be given.

Binomial nomenclature, as described here, is a system for naming species. Implicitly it includes a system for naming genera, since the first part of the name of the species is a genus name. In a classification system based on ranks there are also ways of naming ranks above the level of genus and below the level of species. Ranks above genus (e.g., family, order, class) receive one-part names, which are conventionally not written in italics. Thus the house sparrow, Passer domesticus, belongs to the family Passeridae. Family names are normally based on genus names, although the endings used differ between zoology and botany.

Ranks below species receive three-part names, conventionally written in italics like the names of species. There are significant differences between the ICZN et le ICNafp. In zoology, the only rank below species is subspecies and the name is written simply as three parts (a trinomen). Thus one of the subspecies of the olive-backed pipit is Anthus hodgsoni berezowskii. In botany, there are many ranks below species and although the name itself is written in three parts, a "connecting term" (not part of the name) is needed to show the rank. Thus the American black elder is Sambucus nigra subsp. canadensis the white-flowered form of the ivy-leaved cyclamen is Cyclamen hederifolium F. albiflorum.


Though all dichotomous keys function in the same way, there are several different ways of presenting them to the user:

Nested Style

In a nested display of a dichotomous key, the next question in a series appears “nested” under the answer leading to that question.

This is often achieved by using indentations, with each question following the first one being further indented to distinguish it from the rest.

Linked Style

In a linked style of dichotomous key, questions are laid-out in list form.

Each answer directs the user which question to ask next, and the user must find the correct question in order to properly identify the organism.

Branching Tree

In a “branching” or “tree” layout of a dichotomous key, each of an organism’s characteristics are laid out in a style similar to a flow chart or tree of life.

Each question or characteristic begins a new “branch” of the tree, with each subsequent question being a sub-branch.

Identification is reached at the end of the tree’s “branches.”

Computer Program

With handheld computers becoming more common, identification keys are increasingly being converted into computer program form.

This method allows the user to answer questions one at a time, and have the correct follow-up question automatically presented.

Much like popular online quizzes, in this way the user can reach the correct species identification after answering a series of either-or questions.


Part 1: A Simple Dichotomous Key

A dichotomous key is a tool used to determine the identity of species that have been previously described. You can think of it as a series of questions in which each question only has two possible answers.

In the table below, you have been given a list of creatures and their descriptions. The different characteristics, behaviors, and habitats of the creatures can be used in the dichotomous key to differentiate among them.

Creature La description
Jackelope Mean-spirited horned jack rabbit
Chupacabra Reptilian creature covered in scales with spines along the dorsal ridge likes to eat goats
Altamaha-ha Water monster with an alligator-like head and long neck lives in the marshes of Coastal Georgia
Sasquatch Stinky giant humanoid covered in brown fur found in the forests of North America
Yeti Giant mountain humanoid covered in white fur prefers the snow
Kraken Giant octopus-like creature takes down ships in the open ocean
Nessie Water monster with a snake-like head and long neck lives in Loch Ness, in the Scottish highlands

Below, you will find the dichotomous key used to identify a folkloric creature you may come across. On the left is the list of questions and on the right, the same list is represented as a flowchart. Both are useful representations of the same dichotomous key.

1. Does the creature live on land?

2. Does the creature resemble a human?

3. Does the creature have brown fur?

4. Does the creature have scales?

5. Does the creature have tentacles?

6. Does the creature have a large head, resembling an alligator?

  • une. Yes: Altamaha-ha!
  • b. No: Nessie!

Using the dichotomous key, identify the creature on the right.


Assessing Newly Described Bacteria

Since 1974, the number of genera in the family Enterobacteriaceae has increased from 12 to 28 and the number of species from 42 to more than 140, some of which have not yet been named. Similar explosions have occurred in other genera. In 1974, five species were listed in the genus Vibrio and four in Campylobacter the genus Legionella was unknown. Today, there are at least 25 species in Vibrio, 12 Campylobacter species, and more than 40 species in Legionella. The total numbers of genera and species continue to increase dramatically.

The clinical significance of the agent of legionnaire's disease was well known long before it was isolated, characterized, and classified as Legionella pneumophila. In most cases, little is known about the clinical significance of a new species at the time it is first described. Assessments of clinical significance begin after clinical laboratories adopt the procedures needed to detect and identify the species and accumulate a body of data.

In fact, the detection and even the identification of uncultivatable microbes from different environments are now possible using standard molecular methods. The agents of cat scratch disease (Bartonella henselae) and Whipple's disease (Tropheryma whippelii) were elucidated in this manner. Bartonella henselae has since been cultured from several body sites from numerous patients T. whippelii remains uncultivated.

New species will continue to be described. Many will be able to infect humans and cause disease, especially in those individuals who are immunocompromised, burned, postsurgical, geriatric, and suffering from acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). With today's severely immunocompromised patients, often the beneficiaries of advanced medical interventions, the concept of “pathogen” holds little meaning. Any organism is capable of causing disease in such patients under the appropriate conditions.


Taxonomie

The designation of species originates in taxonomy, where the species is the fundamental unit of classification recognized by the International Commission of Zoological Nomenclature. Every species is assigned a standard two-part name of genus and species. The genus is the generic name that includes closely related species the gray wolf, for example, is classified as Canis lupus and is a close relative of the coyote found in North America and designated as Canis latrans, their systematic relation indicated by their sharing the same genus name, Canis. Similarly, genera that have shared characters (or traits) are classified in the same taxonomic family related families are placed in the same order related orders are placed in the same class and related classes are placed in the same phylum. This classification system is a hierarchy applied to all animals and plants, as originally set forth by the Swedish naturalist Carolus Linnaeus in the 18th century.

Organisms are grouped into species partly according to their morphological, or external, similarities, but more important in classifying sexually reproducing organisms is the organisms’ ability to successfully interbreed. Individuals of a single species can mate and produce viable offspring with one another but almost never with members of other species. Separate species have been known to produce hybrid offspring (for example, the horse and the donkey producing the mule), but, because the offspring are almost always inviable or sterile, the interbreeding is not considered successful.

Interbreeding only within the species is of great importance for evolution in that individuals of one species share a common gene pool that members of other species do not. Within a single pool there is always a certain amount of variation among individuals, and those whose genetic variations leave them at a disadvantage in a particular environment tend to be eliminated in favour of those with advantageous variations. This process of natural selection results in the gene pool’s evolving in such a way that the advantageous variations become the norm. Because genetic variations originate in individuals of a species and because those individuals pass on their variations only within the species, then it is at the species level that evolution takes place. The evolution of one species into others is called speciation.


Voir la vidéo: Masse volumique pour identifier une espèce chimique. Seconde. Physique-Chimie (Décembre 2022).