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1.2 : Introduction à la taxonomie - Biologie

1.2 : Introduction à la taxonomie - Biologie


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Objectifs d'apprentissage

  • Décrire le système scientifique de classification et de dénomination des plantes.

Une connaissance pratique de la taxonomie est utile pour classer, nommer et identifier les plantes inconnues. Théophraste (370-285 av. J.-C.), un philosophe grec, a d'abord utilisé la taxonomie pour décrire et regrouper les plantes en fonction de leur morphologie (forme), de leur croissance et de leurs traits de reproduction. Au XVIIIe siècle, un scientifique du nom de Carl Linnaeus appliqua des binômes (noms à deux termes) et classa les plantes connues dans un système de classification hiérarchique.

Classification et nommage

Les systèmes de classification les plus efficaces sont hiérarchiques et composés d'une série imbriquée de catégories ou de rangs. Une bonne analogie est un système de classement informatique. Certains types d'informations résident à chaque niveau (lecteur, bibliothèque, répertoire ou dossier, sous-répertoire, document, etc.), avec des noms de fichiers (ou étiquettes) qui signifient le type d'informations qui s'y trouvent. Chaque niveau de la hiérarchie est plus inclusif que celui situé en dessous et plus le système de classement examiné est important, plus les informations connexes sont découvertes.

De même, les catégories utilisées dans la classification des plantes fournissent un cadre organisationnel dans lequel les noms des plantes naturelles sont insérés. Dans ce cadre, les espèces de plantes les plus proches les unes des autres sont regroupées. Les groupes ou taxons (au pluriel) sont organisés dans une séquence hiérarchique de taxons (au singulier), du rang le moins inclusif en bas au rang le plus inclusif en haut, comme indiqué ci-dessous dans la hiérarchie de classification des plantes. En d'autres termes, la « famille » des taxons peut comprendre de nombreux genres végétaux, et au sein d'un genre (singulier de genre) il peut y avoir n'importe quel nombre d'espèces, alors qu'au sein d'une espèce donnée, une sous-espèce peut ne décrire que quelques populations ou individus.

Au sein des taxons – famille, genre, espèce, etc., il existe des caractéristiques identifiables communes à chaque groupe. Par exemple, les plantes de la famille des cyprès ont généralement des feuilles larges et aplaties, tandis que les plantes de la famille des pins présentent des feuilles en forme d'aiguille. Une fois organisé en un système sensible qui reconnaît les similitudes ou les relations, le groupement devient plus facile à comprendre et à mémoriser. Autrement dit, une fois que les caractéristiques d'un groupe donné sont connues, elles peuvent être utilisées pour faire correspondre des plantes inconnues avec des taxons connus.

Classification des plantes Hiérarchie des taxons

  • Famille
  • Genre – (pluriel = genres)
  • Espèce
  • Sous-espèce ou variété
  • Forma

Autres termes de classification

  • Hybride
  • Cultivar
  • Noms communs
  • Groupes de plantes

Revoir Identifier la hiérarchie des taxons végétaux.

Un élément interactif ou médiatique a été exclu de cette version du texte. Vous pouvez le consulter en ligne ici :
https://kpu.pressbooks.pub/plant-identification/?p=112


1.2 : Introduction à la taxonomie - Biologie

Figure 1. Notre planète, la Terre

Vue de l'espace, la Terre n'offre aucun indice sur la diversité des formes de vie qui y résident. On pense que les premières formes de vie sur Terre ont été des micro-organismes qui ont existé pendant des milliards d'années dans l'océan avant l'apparition des plantes et des animaux. Les mammifères, les oiseaux et les fleurs qui nous sont si familiers sont tous relativement récents, datant d'il y a 130 à 200 millions d'années. Les humains n'habitent cette planète que depuis 2,5 millions d'années, et ce n'est qu'au cours des 200 000 dernières années que les humains ont commencé à ressembler à nous aujourd'hui.

Face à la diversité remarquable du vivant, comment organiser les différents types d'organismes pour mieux les comprendre ? Alors que de nouveaux organismes sont découverts chaque jour, les biologistes continuent de chercher des réponses à ces questions et à d'autres. Dans ce résultat, nous discuterons taxonomie, qui à la fois démontre la grande diversité de la vie et essaie d'organiser ces organismes d'une manière que nous pouvons comprendre.


La diversité de la vie

Figure 2. La vie sur terre est incroyablement diversifiée.

La diversité biologique est la variété de la vie sur terre. Cela inclut toutes les différentes plantes, animaux et micro-organismes, les gènes qu'ils contiennent et les écosystèmes qu'ils forment sur terre et dans l'eau. La diversité biologique est en constante évolution. Elle est augmentée par une nouvelle variation génétique et réduite par l'extinction et la dégradation de l'habitat.

Qu'est-ce que la biodiversité?

La biodiversité fait référence à la variété de la vie et de ses processus, y compris la variété des organismes vivants, les différences génétiques entre eux, et les communautés et les écosystèmes dans lesquels ils se produisent. Les scientifiques ont identifié environ 1,9 million d'espèces vivantes aujourd'hui. Ils sont divisés en six règnes de la vie illustrés à la figure 3. Les scientifiques découvrent encore de nouvelles espèces. Ainsi, ils ne savent pas avec certitude combien d'espèces existent réellement aujourd'hui. La plupart des estimations vont de 5 à 30 millions d'espèces.

Figure 3. Cliquez pour une image plus grande. La vie connue sur terre

Pignons et roues

Sauver chaque rouage et chaque roue est la première précaution du bricolage intelligent.

—Aldo Léopold, Rivière Ronde : des Journaux d'Aldo Léopold, 1953

Léopold, souvent considéré comme le père de l'écologie moderne, aurait probablement trouvé le terme biodiversité une description appropriée de ses « roues et rouages », même si l'idée n'est devenue une composante vitale de la biologie que près de 40 ans après sa mort en 1948.

Littéralement, le mot biodiversité désigne les nombreux types différents (la diversité) de la vie (biographie-). Les biologistes, cependant, toujours attentifs aux niveaux d'organisation, ont identifié trois mesures uniques de la variation de la vie.

  • La mesure la plus précise et la plus spécifique de la biodiversité est variation au sein d'une espèce. Cette mesure de la diversité examine les différences entre les individus au sein d'une population, ou les différences entre différentes populations de la même espèce.
  • Le niveau juste plus large est la diversité des espèces, qui correspond le mieux à la traduction littérale de biodiversité: le nombre d'espèces différentes dans un écosystème particulier ou sur Terre. Ce type de diversité regarde simplement une zone et rapporte ce qu'on peut y trouver.
  • Enfin, au niveau le plus large, nous avons diversité des écosystèmes. Comme Léopold l'a clairement compris, les « roues et rouages » comprennent non seulement la vie, mais aussi la terre, la mer et l'air qui soutiennent la vie. Dans la diversité des écosystèmes, les biologistes examinent les nombreux types d'unités fonctionnelles formées par les communautés vivantes interagissant avec leurs environnements.

Bien que les trois niveaux de diversité soient importants, le terme biodiversité fait généralement référence à la diversité des espèces.

Critique de la vidéo

Regardez cette discussion sur la biodiversité :


La biodiversité nous fournit toute notre nourriture. Il fournit également de nombreux médicaments et produits industriels, et il a un grand potentiel pour développer des produits nouveaux et améliorés pour l'avenir. Peut-être plus important encore, la diversité biologique fournit et maintient un large éventail de « services écologiques ». La qualité et la pérennité de notre vie et de notre économie dépendent de ces “services.”

Diversité biologique de l'Australie

Figure 4. L'échidné à bec court est endémique d'Australie. Cet animal, avec l'ornithorynque et trois autres espèces d'échidnés, est l'une des cinq espèces survivantes de mammifères pondeurs d'œufs.

Le long isolement de l'Australie au cours des 50 derniers millions d'années et son déplacement vers le nord ont conduit à l'évolution d'un biote distinct. Les caractéristiques importantes de la diversité biologique de l'Australie comprennent :

  • Un pourcentage élevé d'espèces endémiques (c'est-à-dire qu'elles n'existent nulle part ailleurs) :
    • plus de 80% des plantes à fleurs
    • plus de 80% des mammifères terrestres
    • 88 % des reptiles
    • 45% des oiseaux
    • 92% des grenouilles

    Dénomination scientifique

    Vous vous demandez peut-être pourquoi nous devons donner un nom scientifique aux organismes. Jetons un coup d'œil à un exemple :

    Nous utilisons des noms scientifiques parce que c'est un manière organisée de communiquer sur le même organisme partout dans le monde, quelle que soit la région ou la langue.

    Qu'est-ce qu'un nom scientifique? C'est un nom latin à deux mots universellement accepté qui est donné à un organisme en fonction de ses taxons de genre et d'espèce. Ce système de deux mots est appelé nomenclature binominale (“nommage en deux mots”) et a été développé par Carl Linnaeus.

    • Les genre et espèce sont toujours écrits en italique ou c'est souligné .
    • Le nom du genre est en majuscule et le nom de l'espèce est sans majuscule.
    • Le nom de genre est un nom et l'espèce est une adjectif qui décrit le nom et un trait de l'organisme

    Il existe aujourd'hui 8 espèces d'ours. Ils ont tous des caractéristiques similaires et sont reconnaissables comme des ours, mais ils ne se croisent pas. Par conséquent, ils sont classés dans le même genre, mais en tant qu'espèces distinctes. Jetez un œil aux trois ours ci-dessous et notez leurs noms communs et scientifiques.


    Taxonomie : définition, objectifs et caractéristiques

    La taxonomie est la science qui traite de la classification. En biologie ou dans tout autre domaine, une classification systématique est nécessaire pour mettre de l'ordre dans le chaos apparent, afin que les différents types d'un assemblage hétérogène puissent être rangés en groupes ayant des propriétés communes.

    En biologie, la taxonomie vise à regrouper les organismes sur la base de similitudes mutuelles en unités appelées taxons (taxon singulier). L'unité taxonomique, le taxon, peut avoir différents niveaux selon l'étendue des similitudes entre les organismes qui la composent. Chaque niveau ou rang a une désignation différente et ces rangs forment un arrangement hiérarchique.

    Par exemple, les organismes ayant la similitude la plus élevée sont placés dans une unité taxonomique, appelée espèce. Un groupe de plusieurs espèces est ensuite assemblé dans l'unité supérieure suivante, appelée genre (pl. genres). Un groupe de genres est ensuite collecté pour former le taxon supérieur suivant, appelé famille. De même, un groupe de familles forme un ordre, plusieurs ordres forment une classe et plusieurs classes, un royaume. Ces derniers temps, en particulier dans la taxonomie bactérienne, un rang au-dessus du niveau du royaume a été créé, appelé domaine.

    L'unité taxonomique de base des organismes biologiques est une espèce. Dans le cas des bactéries, une espèce est définie comme un ensemble de souches qui se ressemblent par de nombreuses caractéristiques et diffèrent considérablement des autres collections de souches. Une souche est définie comme les descendants d'une seule colonie d'une culture pure.

    Une colonie est idéalement formée à partir d'une seule cellule ou spore poussant sur un milieu gélosé. Ainsi, une espèce bactérienne, selon la définition ci-dessus, comprend un certain nombre de souches qui sont étroitement similaires, différant par une ou quelques caractéristiques. Ainsi, le concept d'espèce bactérienne est différent du concept d'espèce applicable aux organismes supérieurs, comme les plantes et les animaux.

    Dans ce dernier cas, une espèce représente un groupe d'organismes distinctement identifiables qui sont sexuellement isolés des membres d'autres espèces. Cela signifie que l'échange de matériel génétique par le processus normal d'interaction sexuelle n'est possible qu'entre deux individus appartenant à la même espèce. Les échanges génétiques interspécifiques sont rares.

    Les bactéries n'ont généralement pas de mécanisme sexuel comme on en trouve dans les organismes supérieurs et, par conséquent, la définition d'une espèce bactérienne n'est pas si rigide, mais elle laisse plutôt une liberté considérable au taxonomiste pour créer de « nouvelles espèces » sur la base de même une ou quelques différences de caractéristiques. Les rangs taxonomiques supérieurs, comme genre, famille, ordre souffrent également des mêmes incertitudes en raison du laxisme inhérent à leurs définitions.

    Objectifs de la taxonomie:

    La taxonomie vise à remplir trois objectifs principaux :

    1. Premièrement, la taxonomie vise à classer les organismes en taxons sur la base de similitudes dans les caractéristiques phénotypiques (phénétiques), c'est-à-dire les caractéristiques qui sont exprimées dans un organisme et peuvent être examinées visuellement ou testées par d'autres moyens.

    Comme chaque caractéristique phénotypique est contrôlée par un ou un groupe de gènes, deux individus qui possèdent une caractéristique phénotypique similaire doivent avoir des gènes similaires. Un grand nombre de caractéristiques phénotypiques similaires révèle donc une proximité génétique entre les organismes.

    La proximité génétique est également souvent liée à la parenté phylogénétique, car les organismes ayant de nombreux gènes communs parmi eux doivent provenir d'un stock commun au cours de l'évolution. Par exemple, si deux organismes, A et B, sont phylogénétiquement plus proches qu'un autre organisme, C, cela signifie que A et B se sont ramifiés à partir d'un stock commun plus récemment que C qui s'est ramifié plus tôt. De toute évidence, A et B auront plus de gènes communs entre eux qu'ils n'en auront avec C.

    2. Le deuxième objectif de la taxonomie est d'attribuer un nom à chaque taxon. Cette dénomination d'un taxon est connue sous le nom de nomenclature. Attribuer un nom à un organisme est nécessaire pour l'identifier sans confusion dans le monde scientifique. Par conséquent, la nomenclature doit être établie selon certaines règles internationalement acceptées. La dénomination scientifique des bactéries est régie par le code international de nomenclature des bactéries (le code révisé de 1975). Une édition mise à jour du Code révisé a été publiée en 1992.

    Comme d'autres organismes, les noms bactériens comportent deux parties : un nom de genre et un nom d'espèce. Les deux noms doivent être sous forme latinisée. Ce type de dénomination d'organismes biologiques appelé nomenclature binomiale a été introduit pour la première fois par Carl Linnaeus en 1753. Le nom générique est un nom latinisé commençant par une majuscule et l'épithète spécifique est généralement un adjectif latinisé qualifiant le nom de genre.

    Le nom de l'espèce est écrit en petite main. En tant que convention internationale, les noms génériques et spécifiques sont en italique. Pour éviter toute confusion, le nom scientifique d'un organisme nécessite également la citation du nom de l'auteur qui a proposé le nom en premier. En attribuant un nom à une bactérie nouvellement découverte, le ou les auteurs doivent respecter scrupuleusement les règles édictées par le Code international.

    Une nouvelle espèce est indiquée par l'abréviation sp. nov. et un nouveau genre par gen. nov. Les auteurs décrivant une nouvelle bactérie sont également tenus de déposer une culture de l'organisme dans une collection de cultures autorisée où elle est conservée en tant que culture type de l'organisme particulier pour référence future. Chaque entrée est dotée d'un numéro d'index distinct par l'autorité de collecte.

    Outre les noms scientifiques, les bactéries sont souvent connues par leurs noms triviaux ou informels. Certains noms triviaux sont souvent largement utilisés. Par exemple, le bacille de Koch est le nom commun de Mycobacterium tuberculosis, des pneumocoques de Streptococcus pneumoniae, des méningocoques de Neisseria meningitidis, etc.

    3. Le troisième objectif de la taxonomie est de servir d'instrument pour l'identification des bactéries. Un organisme nouvellement isolé peut être associé à ses alliés les plus proches ou peut être identifié comme un nouveau taxon jusqu'alors inconnu. Cela fait de la taxonomie une branche dynamique de la biologie, car la découverte de nouveaux organismes exige constamment des changements dans la classification existante.

    Aussi, l'adoption de nouvelles techniques de classification des organismes nécessite souvent des changements, parfois des changements profonds dans le cadre existant. Par exemple, les développements des techniques de biologie moléculaire, comme l'hybridation de l'ADN, ont eu un grand impact sur la taxonomie des bactéries. En fait, une nouvelle branche de la taxonomie appelée taxonomie moléculaire a vu le jour. La détermination de l'homologie des ARN ribosomiques est un autre développement qui a révolutionné la taxonomie bactérienne.

    Caractéristiques de la taxonomie :

    (i) Taxonomie classique:

    La classification de tout groupe d'organismes utilise des caractéristiques stables sélectionnées qui varient selon les taxons. Ce sont des caractéristiques taxonomiques. Classiquement, les bactéries ont été classées sur la base de similitudes dans les caractéristiques phénotypiques, telles que les caractéristiques morphologiques, la réponse à la coloration de Gram, les caractéristiques culturelles, les propriétés biochimiques physiologiques, la pathogénicité, la sensibilité aux antibiotiques, les relations sérologiques, etc. les caractéristiques sont présentées dans les tableaux 3.1, 2 et 3 respectivement.

    (ii) Taxonomie moléculaire:

    L'approche de la taxonomie bactérienne a subi des changements drastiques depuis le développement de la biologie moléculaire dans la seconde moitié du XXe siècle. Le concept selon lequel les macromolécules, comme les protéines et les acides nucléiques, pourraient être utilisées comme indicateur de l'évolution des organismes vivants a été suggéré pour la première fois par Zuckerkandl et Pauling en 1965.

    Ils ont décrit ces macromolécules comme des « chronomètres moléculaires », car les séquences de monomères qu'elles contiennent ont changé lentement et de manière aléatoire et le nombre de changements dans une macromolécule particulière a augmenté de manière linéaire avec l'échelle des temps géologiques.

    Une comparaison de la séquence des monomères d'une macromolécule particulière de deux organismes devrait donc donner une mesure de leur relation phylogénétique. Si les séquences diffèrent considérablement, cela indique que les deux organismes sont phylogénétiquement distants.

    Cette nouvelle approche a donné naissance à la taxonomie moléculaire. Bien qu'initialement le séquençage des acides aminés des protéines ait été utilisé comme paramètre pour la détermination des relations phylogénétiques, les acides nucléiques ont rapidement remplacé les protéines. Parmi les caractéristiques des acides nucléiques, la composition des bases de l'ADN, l'homologie de l'ADN, le séquençage de l'ADN, l'analyse de la séquence de l'ARNr, etc. ont été utilisés pour résoudre des problèmes taxonomiques.

    Les principes de certaines méthodes sont brièvement décrits :

    (a) Composition en bases d'ADN :

    La première caractéristique qui a été appliquée pour résoudre les problèmes taxonomiques était la composition de base de l'ADN. Une caractéristique unique de l'ADN est que le rapport de (G + C) : (A + T) est plus ou moins constant pour une espèce biologique. Le rapport est classiquement exprimé en % molaire G + C. Les organismes qui sont étroitement liés, comme les souches d'une espèce donnée ont des valeurs proches de G + C mole %. Chez les bactéries, cette valeur varie d'environ 25 % à 80 %.

    Les valeurs de certains genres bactériens représentatifs sont présentées dans le tableau 3.4 :

    Plusieurs méthodes sont disponibles pour la détermination expérimentale du rapport des bases d'ADN. Parmi celles-ci, deux méthodes couramment utilisées sont celles par détermination de la température de fusion de l'ADN et de la densité de flottabilité. Les principes sont brièvement décrits.

    Une caractéristique de l'hélice d'ADN double brin est qu'à haute température, la structure hélicoïdale s'effondre en produisant deux brins simples en raison de la dissolution des liaisons H. C'est ce qu'on appelle la fusion et la température à laquelle la fusion se produit est un caractère d'une espèce particulière d'ADN.

    Parce qu'il y a trois liaisons H entre G et C, et deux entre A et T, une molécule d'ADN ayant plus de G + C fond à une température plus élevée. Une autre caractéristique importante de l'ADN est que l'ADN fondu ou dénaturé montre une augmentation de la densité optique à 260 nm, un phénomène connu sous le nom d'hyperchromicité.

    Cela signifie que lorsque l'ADN double brin est dissocié en un état simple brin, sa densité optique à 260 nm (DO260) augmente progressivement et atteint un maximum lorsque tout l'ADN présent dans un échantillon est dénaturé. Cela peut être mesuré dans un instrument appelé spectrophotomètre UV ayant un arrangement pour augmenter progressivement la température d'une solution d'ADN.

    En traçant le % d'augmentation de la DO26o en fonction de la température, une courbe est obtenue comme le montre la Fig. 3.4. La température à laquelle 50 % de l'augmentation maximale est atteinte est prise comme température de fusion (Tm) de cette espèce particulière d'ADN. A partir de la température de fusion, le % molaire G + C peut être calculé à partir de la relation, Tm = 69,3 + 0,41 (G + C) %.

    Bien que la teneur en G + C de l'ADN soit un caractère taxonomique utile, elle seule peut ne pas indiquer une relation étroite, car deux organismes tout à fait indépendants peuvent avoir par hasard une teneur en G + C proche. Mais pour deux organismes qui se ressemblent dans la plupart des autres caractères phénotypiques, une teneur proche en G + C de l'ADN peut être considérée comme une indication fiable de leur parenté phylogénétique.

    Par analyse de la teneur en G + C de l'ADN d'un grand nombre de bactéries, il a été constaté que les souches au sein d'une espèce ont des valeurs plus ou moins identiques et que sa variation dans différentes espèces au sein d'un genre ne dépasse généralement pas 10 %.

    Il faut se rappeler que la teneur en G + C ne donne que la composition globale de l'ADN et ne donne aucune information sur la séquence des bases dans la molécule d'ADN. C'est cette séquence dans un segment d'ADN qui constitue la spécificité d'un gène. Ainsi, la teneur en G + C de l'ADN ne donne aucune information concernant la similitude des gènes de deux organismes.

    Une autre technique de détermination du % molaire G + C d'ADN utilise une propriété différente de l'ADN double brin (ds-). La densité de flottabilité de l'ADN double brin augmente linéairement avec sa teneur en G + C. Dans un gradient de densité à l'équilibre, l'acide nucléique homogène s'accumule sous la forme d'une bande symétrique, dont la largeur est inversement proportionnelle à la racine carrée de son poids moléculaire.

    Les molécules plus petites ayant un poids moléculaire inférieur ont tendance à diffuser plus rapidement que les molécules plus grandes et, par conséquent, ont des bandes plus larges. De plus, les échantillons d'ADN différant par leur teneur en G + C forment des liaisons séparées, en raison de leur différence de densité.

    Dans une centrifugation en gradient de densité à l'équilibre utilisant du chlorure de césium (CsCl), les échantillons d'ADN, préalablement purifiés en éliminant les protéines et l'ARN, sont soigneusement mélangés avec une solution 6M de sel de césium dans un tube à centrifuger en PVC (polychlorure de vinyle) et le mélange est soumis à une ultracentrifugation à grande vitesse pendant un temps suffisamment long pour permettre la formation d'un gradient de densité.

    La densité la plus élevée se trouve au fond du tube et elle diminue progressivement vers le haut. Les différents composants de l'échantillon d'ADN se rassemblent en bandes distinctes à des niveaux où la densité d'un composant particulier est égale à celle du gradient.

    Les fractions peuvent être collectées en perçant le tube PVC au fond et leur densité déterminée. A partir de la densité de flottabilité des bandes d'ADN, leur % molaire G + C peut être calculé à partir de la relation p (densité de flottabilité) = 1,660 + 0,98 (G + C) %.

    (b) Hybridation d'acide nucléique:

    Une information plus fiable sur la similitude des génomes de deux organismes peut être obtenue par hybridation ADN-ADN, car la formation d'un hétéroduplex entre deux molécules d'ADN simple brin dérivées de deux organismes dépend du degré de complémentarité des deux brins simples.

    Un ADN double brin peut être dissocié en simple brin par application de chaleur. Une caractéristique intéressante de l'ADN simple brin est que lors du refroidissement, les brins ont tendance à se réassocier pour former automatiquement une structure en double hélice. Ce processus, connu sous le nom de recuit, se produit de manière optimale lorsque la température est amenée à environ 25°C en dessous de la température de fusion dans une solution à forte concentration ionique, telle que 0,3 M NaCl qui réduit la répulsion électrostatique entre les brins d'ADN.

    Diverses méthodes ont été développées pour la détermination quantitative de la formation d'hétéroduplex. L'une des techniques les plus couramment utilisées consiste à lier des molécules d'ADN relativement longues d'un organisme à un filtre de nitrocellulose et à permettre aux molécules d'ADN liées de s'hybrider avec des molécules d'ADN relativement courtes de l'autre organisme.

    Pour différencier les deux espèces d'ADN, l'une d'entre elles - généralement la seconde - est rendue radioactive par marquage au 32 P ou au 3 H. L'ADN radioactif est obtenu en faisant croître un organisme dans un milieu contenant un sel radioactif, par ex. Phosphate marqué au 32P. L'ADN est marqué et est ensuite isolé et purifié pour être utilisé dans l'hybridation.

    Pour l'hybridation ADN-ADN, les molécules d'ADN simple brin non radioactives les plus longues sont d'abord autorisées à se lier à un filtre de nitrocellulose, l'ADN non lié est éliminé par lavage et le filtre avec l'ADN lié est incubé avec l'ADN simple brin radioactif plus petit dans des conditions optimales de recuit.

    Pendant l'incubation, les molécules radioactives plus petites s'hybrident avec les molécules d'ADN plus longues en fonction de leur homologie dans les séquences de bases. Ensuite, le filtre est lavé pour éliminer les molécules d'ADN radioactives non liées et la radioactivité du filtre est mesurée.

    Evidemment, la radioactivité retenue est due à l'hybridation de l'ADN non radioactif avec l'ADN radioactif et elle donne une mesure quantitative du degré de complémentarité des deux espèces d'ADN c'est-à-dire l'homologie entre les deux ADN. La procédure est schématisée à la Fig. 3.5.

    Il a été déterminé expérimentalement que la formation d'hétéroduplex entre deux molécules d'ADN simple brin différentes est empêchée si leur non-complémentarité dépasse 10-20%. Du point de vue taxonomique, si les ADN de deux organismes ont au moins 70 % d'homologie et leur TmLes valeurs n'ont pas plus de 5% de différence, les deux organismes peuvent être considérés comme appartenant à la même espèce, sinon ils peuvent être considérés comme des espèces différentes.

    Des études d'homologie d'ADN ont été menées sur plus de 10 000 bactéries appartenant à environ 2 000 espèces et plusieurs centaines de genres. Il s'est avéré être un outil puissant pour résoudre de nombreux problèmes de taxonomie bactérienne, en particulier au niveau des espèces.

    Il convient de noter que pour déterminer les relations entre des organismes éloignés, l'hybridation ADN-ADN ne peut donner aucune information positive, car les ADN de ces organismes ne possèdent pas une complémentarité de paires de bases suffisante pour permettre la formation d'hétéroduplex. La seule information qui peut être obtenue est que les organismes concernés ne sont pas apparentés les uns aux autres. D'un point de vue taxonomique, de telles informations n'ont pas beaucoup de valeur.

    (c) Homologie de l'ARN ribosomique:

    Une découverte importante faite en 1965 a révélé que dans tous les organismes vivants, les segments d'ADN transcrivant l'ARN ribosomique (r-cistrons ou r-ADN) ont changé plus lentement au cours de l'évolution que le reste du génome. En d'autres termes, les r-cistrons sont plus conservés que les gènes codant pour les protéines.

    Cela a fourni un instrument pour comparer les relations phylogénétiques entre des organismes éloignés par la détermination des séquences de bases de r-ARN ou de r-ADN. Parmi les différents ARNr, l'ARNr 16S des organismes procaryotes et l'ARNr 18S analogue des eucaryotes se sont avérés les plus appropriés pour la comparaison de leurs séquences dans les études taxonomiques.

    La méthode utilisée au début pour déterminer l'homologie de l'ARNr était le catalogage des oligonucléotides. L'ARNr purifié a été clivé en oligonucléotides par des enzymes spécifiques, telles que la RNase du bactériophage T1, séparés par électrophorèse bidimensionnelle, hydrolysés en segments plus petits et soumis à une nouvelle électrophorèse pour déterminer leurs séquences nucléotidiques.

    La séquence d'un oligonucléotide unique de chaque organisme a été stockée dans un ordinateur. Des séquences de différents organismes ont été comparées pour déterminer leur similitude. L'ARN ribosomique de la plupart des principaux groupes taxonomiques s'est avéré posséder une ou plusieurs séquences uniques qui sont connues comme leur signature oligonucléotidique. De telles séquences de signature ont été déterminées pour la plupart des principaux groupes taxonomiques de bactéries.

    L'un des principaux impacts des études sur l'ARNr sur la taxonomie est la reconnaissance de trois domaines majeurs - les archées, les eucaryotes, y compris tous les eucaryotes, et les bactéries. Il a été affirmé par Woese, Kandler et Wheelis (1990) que les trois lignes évolutives majeures divergeaient d'une forme ancestrale commune.

    Les progrès des techniques de biologie moléculaire ont maintenant permis de déterminer des séquences nucléotidiques d'ADN-r pour préparer des arbres phylogénétiques à l'aide d'ordinateurs. De tels arbres sont construits en comparant les séquences de deux molécules par alignement. Le nombre de mésappariements dans la séquence est compté et utilisé pour calculer la distance évolutive. La similitude entre les deux molécules est exprimée en coefficient de similitude.

    Un groupe d'organismes étroitement liés, par ex. espèces du même genre, auront généralement une gamme étroite de coefficients de similarité. Inversement, une gamme plus large de coefficients de similitude indique que les organismes se sont éloignés les uns des autres dans un passé plus lointain.

    Sur cette base, un dendrogramme ou un arbre phylogénétique peut être préparé (Fig. 3.6) :

    La détermination de l'homologie r-ARN/r-ADN a été faite avec des milliers d'organismes bactériens pour la révélation de leurs relations taxonomiques. De telles études ont été menées jusqu'en 1997-1998 avec des cultures pures de bactéries, mais depuis lors, des techniques ont été développées pour récupérer les gènes r-ARN directement dans les habitats naturels et ont éliminé la nécessité d'amener les bactéries en culture pure en laboratoire.

    Ceci est devenu connu sous le nom d'analyse communautaire de l'ARNr 16S de la communauté microbienne naturelle. L'une des découvertes surprenantes de ces études est que le nombre de micro-organismes qui ne sont pas encore mis en culture dépasse de loin le nombre de ceux qui ont été cultivés jusqu'à présent. Cela signifie que la diversité du monde microbien est bien plus étendue qu'on ne le connaît jusqu'à présent.


    Introduction à la taxonomie

    Pratique : Quelle branche de la biologie s'occupe de nommer et de classer les organismes ?

    Concept #2 : 3 domaines de la vie

    Exemple n° 1 : D'après le diagramme, « A » est _____________ « B » est ______________.

    Concept #3 : Royaumes du domaine Eukarya

    Exemple n°2 : Lequel des royaumes suivants ne fait PAS partie du domaine eucaryote ?

    Pratique : La proposition selon laquelle un type d'organisme peut se transformer en un autre type sur une longue période est connue sous le nom de :

    Concept n°4 : catégoriser la vie en fonction de l'acquisition d'énergie

    Exemple #3 : Les autotrophes sont aussi appelés :

    Pratique : Les biologistes peuvent diviser les organismes vivants en deux groupes : les autotrophes et les hétérotrophes, qui diffèrent par _________.

    Le progrès
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    Taxonomie

    La taxonomie est la pratique consistant à identifier différents organismes, à les classer en catégories et à les nommer. Tous les organismes, vivants et éteints, sont classés en groupes distincts avec d'autres organismes similaires et reçoivent un nom scientifique.

    La classification des organismes comporte diverses catégories hiérarchiques. Les catégories passent progressivement d'un caractère très large et comprenant de nombreux organismes différents à une espèce très spécifique et identifiant une seule.

    Catégories taxonomiques

    Il existe huit catégories taxonomiques distinctes. Ce sont : Domaine, Royaume, Embranchement, Classe, Ordre, Famille, Genre et Espèce.

    À chaque étape de la classification, les organismes sont divisés en groupes de plus en plus spécifiques.

    Par exemple, tous les animaux du Royaume Animalia sont divisés en plusieurs phylums (pluriel de phylum). Tous les animaux du phylum Chordata sont divisés en plusieurs classes telles que les mammifères, les reptiles et les amphibiens.

    La catégorie la plus large divise tous les organismes en trois groupes appelés ‘Domains’. Les trois domaines de la vie sont les bactéries, les archées et les eucaryotes.

    Royaume

    Pendant longtemps, toute vie a été séparée en cinq ou six royaumes. Ceux-ci comprenaient des royaumes tels que les animaux, les plantes, les champignons, les protistes, les archées et les bactéries.

    Avec de nouvelles données génétiques, nous savons maintenant que certains protistes sont plus étroitement liés aux animaux, aux plantes et aux champignons qu'ils ne le sont à d'autres protistes. Cela suggère que le royaume protiste pourrait être séparé en plusieurs royaumes. Les pensées sont similaires pour les royaumes des bactéries et des archées.

    Phylum

    Un phylum (pluriel phyla) est encore une classification très large mais il divise les royaumes en plusieurs groupes. Un exemple de phyla du règne animal est Arthropoda qui comprend tous les insectes, araignées, crustacés, etc. Tous les animaux vertébrés appartiennent à un phylum appelé ‘Chordata’. Les invertébrés sont séparés en plusieurs phylums différents.

    Classer

    Une classe est le niveau suivant. Comme mentionné précédemment, certaines classes du phylum Chordata comprennent les mammifères, les reptiles et les amphibiens. Les classes d'arthropodes comprennent les insectes et les arachnides (araignées, acariens et scorpions).

    Ordre et famille

    A partir de la classe, les organismes sont placés dans un Ordre puis une Famille. Prenant comme exemple les graminées du règne végétal, elles appartiennent à l'ordre des Poales et à la famille des Poacées.

    Genre et espèce

    The final two categories are genus and species. The genus and species that an organism belongs to are how an organism receives its scientific name. This naming system is called ‘binomial nomenclature’ and was invented by a brilliant biologist named Carl Linnaeus.

    An identified species is placed into a specific group in each of these categories. For example, the taxonomic classification of humans is:

    Domain: Eukaryota
    Royaume : Animalia
    Embranchement : Chordata
    Classe : Mammalia
    Order: Primates
    Family: Hominidae
    Genre: Homo
    Espèce: Homo sapiens

    To remember the order of the taxonomic hierarchy from domain to species, people often use mnemonics to make it easier. The phrase that I was taught and still use to help me remember is ‘King Phillip Came Over From Germany Swimming’. There are many different phrases people have come up with. If you’re not keen on the sentence I use and want another one, take a look at these taxonomy mnemonics .

    Carl Linnaeus

    Carl Linnaeus was a Swedish naturalist from the 18th century and is considered the father of taxonomy. It was Linnaeus who first began to separate organisms into hierarchical categories. He also developed the system that we use to name new species called ‘binomial nomenclature’. Linnaeus is credited with identifying over 10,000 different plant and animal species in his lifetime, more than any other biologist.

    Systema Naturae

    When Linnaeus developed his system of hierarchical categories, he called it ‘Systema Naturae’. It contained three kingdoms, classes, orders, genera, and species. We have since added two more categories – domains and phyla.

    Linnaeus’s original classification had three kingdoms – animals, plants, and minerals (natural, non-living elements). We now only use this system for classifying organisms and we have since separated all of life into more than two kingdoms.

    Nomenclature binominale

    Binomial nomenclature is the method that we use to uniquely name every different organism on Earth, living or extinct. All organisms have a scientific name that includes two Latin words.

    The two words are made from the names of the genus the species belongs to and a second word to separate each of the species within the same genus. The second word is known as the ‘specific epithet’. Hence, the scientific names of all organisms are made from the name of their genus and a specific epithet.

    For example, the scientific name given to humans includes their genus Homo and the specific epithet sapiens. The overall name is Homo sapiens .

    Scientific names are also written in either italique ou souligné.

    Taxonomy is not a perfect science and, as you will find out, there is a lot of disagreement and uncertainty about the structure of taxonomic classifications. In general, however, taxonomy is a great way to quickly learn about how an organism slots into the tree of life.

    Last edited: 30 August 2020

    Vous voulez en savoir plus ?

    Long before Carl Linnaeus, humans were naming and categorizing the life on Earth. This celebrated book from long-time New York Times science writer Carol Kaesuk Yoon takes us on a journey through the history of naming nature, both through science and alternative methods.

    Our brilliantly simple book will take you through the fundamentals of biology in a way that is easy to follow and avoids difficult science jargon. Easy and enjoyable to read, the book introduces topics such as genetics, cells, evolution, basic biochemistry, the broad categories of organisms, plants, animals, and taxonomy.


    Taxonomy: Need, Aspects and Phases (With Diagram)

    With the huge variety of plants surrounding us, it is extremely essential to pinpoint a particular plant of our interest by noting the similarities or differences with other plants. A biologist studying a particular plant needs to know his field of study.

    Thus it becomes extremely necessary that the plant is first identified, given a proper name so that he can communicate his ideas about it, and also know the group to which the plant belongs.

    These three activities are, in fact, the main functions of taxonomy. Thus taxonomy, which is probably the oldest of sciences, is the science of classification, including its bases, principles, rules and procedures.

    Its general purpose is to arrange plants in such a way as to provide an information retrieval system, i.e. the name and rank or position in an ordered hierarchy, which tells us something about the plant. It comes from two Greek words, taxis meaning arrangement and nomous meaning law or rule.

    Thus, taxonomy means classification following certain rules or, principles. But it is very important to note that a plant’s name is the key to its literature, and grouping can only be possible when its identity is revealed and are named for the sake of convenience and communication of ideas about it.

    The term taxonomy was first introduced to the plant science in 1813 by A. P. de Candolle, which meant the theory of plant classification. But later this term became more inclusive and at present it includes identification of plants, their nomenclature and classification. Traditionally taxonomy was based largely on gross morphological features of a plant.

    However now virtually all other scientific information is used from branches like anatomy, genetics, cytology, chemistry, reproductive biology, ecology, physiology, molecular biology, etc. (Fig. 1.1). Hence taxonomy is a very dynamic and synthetic science and is the basic to all other sciences.

    At the same time it is dependent upon them, i.e. the information used by taxonomists is gathered using information from other disciplines such as genetics, ecology, morphology, anatomy, physiology, etc.

    Different Aspects of Taxonomy:

    The three functions of taxonomy include, identification, nomenclature and classification (Fig.1.2). Its main aim is to provide a convenient method of identification and communication about a taxa and provide a classification which is based on natural affinities of plants as far as possible.

    Le mot ‘taxon’ (taxa) was first used by a German Biologist Adolf Meyer in 1926 for animal groups. It was later proposed for the plant system in 1948 by Herman J. Lam. It is a taxonomic group of any rank, e.g. family, genus, species, subspecies, etc.

    (a) Identification:

    Identification of a taxon is a prerequisite for any study based on it. It is the determination of a taxon based on overall similarities and differences with other taxa. Identification is generally done by comparing representative specimen of a given taxon with the help of key descriptions, illustrations, etc.

    Sometimes, the specimen may not agree or compare with the existing predetermined specimen. In such a case it is taken to be new to science. Identification is thus assignment of additional unidentified plants to a correct rank once a classification has been established. It is the determination of a name for a specimen. This also implies its rank.

    (b) Nomenclature:

    Once the taxon has been identified, it becomes necessary to give it a scientific name. Thus, nomenclature is the naming of a taxon correctly. It is a precise and universal system of rules used by all botanists of the world for naming newly discovered plants.

    Often constant study of plants results in differences of opinion concerning past work. This often results in splitting, uniting, changing ranks etc., all of which may affect the plants name. Thus, universal rules are needed to determine the correct name for a plant and the rules for naming the plants are governed by the International Code of Botanical Nomenclature (ICBN). A new name is given to a new taxon.

    (c) Classification:

    Keeping in view, the enormously high number of plant species, it is impossible for any one to study all plants individually. To overcome this problem, the plants can be placed into small or large groups based on their similarities and differences, and then arranged in a sequential manner into categories according to their levels, and each category given a name following the rules of nomenclature.

    For example, similar plants may be grouped under a “espèce“, similar species under a “genus“, and so on.

    Classification is thus, the arrangement of groups of plants with particular characteristics by rank or position according to certain criteria, and placing them within the taxonomic hierarchy. It includes the determination of position or rank for new taxa as well as old taxa, which have been remodelled, divided, united, transferred or altered in rank.

    There are basically three kinds of classification: artificial, natural and phylogenetic :

    It is the classification that is based on one or a few easily observable characters such as habit, colour, form, etc., often irrespective of their affinity.

    It is the classification that is based on overall similarity, mostly on gross morphology.

    These classification however, are not mutually exclusive but often overlap in practice. It is the classification based on common evolutionary descent.

    (ré) Systematics:

    It is the part of classification that involves the arrangement of plants into related groups. It is the scientific study of the kinds and diversity of plants and the relationships among them if any, and includes not only the traditional activities of taxonomy but also the investigation of such things as evolution, speciation, natural variation, reproductive biology, and a variety of biological phenomena.

    According to Radford (1986) systematics is the study of phonetic, genetic and phylogenetic relationship among taxa.

    (e) Molecular Systematics :

    Molecular systematics is that part of systematics, which utilizes data from nuclear, chloroplast or mitochondrial DNA, to elucidate phylogenetic relationships between plants. Gene sequences obtained from protein-coding genes, ribosomal RNA or non-coding spacer regions are often used in molecular systematic studies.

    Other DNA-based methods such as Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) and Random Amplified DNA Polymorphisms (RAPD) “fingerprinting” are used to study problems or issues on genetic diversity (which has implications for conservation and management), the detection of hybrids, and taxonomic delimitation at the level of species.

    Phases of Taxonomy:

    Classification of a taxon, is generally achieved in four successive phases, as formulated by Davis and Heywood (1963):

    (a) The Pioneer (or Exploratory) Phase:

    This is the discovery and collection phase and different members of a taxon are collected from different parts of the world (exploration) and identified, at least provisionally.

    (b) The Consolidation Phase:

    This is the synthesis phase mostly based on morphology. This phase deals with the study of the plant material in the field as well as in the herbarium. All the new groups, if invented, are described. Thus a compilation of a flora or a monograph is done in this phase.

    (c) The Experimental or Bio-Systematic Phase:

    This deals with a wide variety of things and a more thorough knowledge of a taxon based on analysis of a wide variety of things such as the geographical variation, chemical studies, cytogenetic studies, physiological features, fertility relationships, evolutionary patterns and other population studies.

    (d) The Encyclopaedic or Holotaxonomic Phase:

    This is a coordination of the three phases mentioned above and involves the analysis and synthesis of all information and types of data to develop classification systems based on phylogenetic relationships. The first two phases corresponding to the “alpha” classification are mainly descriptive and based on gross morphological features.

    The last two phases correspond to the “oméga” (to) classification. The data for these phases are accumulated from researches in the field, laboratory, garden, herbarium and library, and may be analysed with the help of computers.


    Contenu

    Examples of Linnaean Taxonomy Edit

    The usual taxonomic classifications of five species follow: the fruit fly, so familiar in genetics laboratories (Drosophila melanogaster), humans (Homo sapiens), the peas used by Gregor Mendel in his discovery of genetics (Pisum sativum), the "fly agaric" mushroom Amanite muscaria, and the bacterium Escherichia coli. The eight major ranks are given in bold a selection of minor ranks are given as well.

    Rang Mouche des fruits Humain Pea Amanite mouche E. coli
    Domain Eucarya Eucarya Eucarya Eucarya Bactéries
    Royaume Animalia Animalia Plantae Champignons
    Phylum ou Division Arthropodes Accords Magnoliophyta Basidiomycota Protéobactéries
    Subphylum or subdivision Hexapoda Vertébrés Magnoliophytina Hymenomycotina
    Classer Insecta Mammifères Magnoliopsida Homobasidiomycetae Gammaprotéobactéries
    Sous-classe Pterygota Théria Magnoliidae Hymenomycetes
    Commander Diptera Primates Fabales Agaricales Enterobacterales
    Sous-ordre Brachycera Haplorrhini Fabineae Agaricineae
    Famille Drosophilidae Hominidés Fabaceae Amanitaceae Enterobacteriaceae
    Sous-famille Drosophilinae Homininae Faboideae Amanitoideae
    Genre Drosophile Homo Pisum Amanite Escherichia
    Espèce Drosophila melanogaster Homo sapiens Pisum sativum Amanite muscaria Escherichia coli

    • The ranks of higher taxa, especially intermediate ranks, are prone to revision as new information about relationships is discovered. For example, the traditional classification of primates (class Mammalia — subclass Theria — infraclass Eutheria — order Primates) has been modified by new classifications such as McKenna and Bell [1] (class Mammalia — subclass Theriformes — infraclass Holotheria) with Theria and Eutheria assigned lower ranks between infraclass and the order Primates. See mammal classification [2] for a discussion. These differences arise mainly because there are only a small number of ranks available and a large number of branching points in the fossil record.
    • Within species further units may be recognised. Animals may be classified into subspecies (for example, Homo sapiens sapiens, modern humans) or morphs (for example Corvus corax varius morpha leucophaeus, the Pied Raven). Plants may be classified into subspecies (for example, Pisum sativum subsp. sativum, the garden pea) or varieties (for example, Pisum sativum var. macrocarpon, snow pea), with cultivated plants getting a cultivar name (for example, Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'). Bacteria may be classified by strains (for example Escherichia coli, a strain that can cause food poisoning).
    • A mnemonic for remembering the order of the taxa is:Keep Pot Clean Otherwise Family Gets Sick. Other mnemonics are available at mnemonic-device.eu Mnemonic Device and thefreedictionary.com Acronyms.

    Terminations of names (suffixes) Edit

    Taxon above the genus level are often given names based on the type genus, with a standard termination. The terminations used in forming these names depend on the kingdom, and sometimes the phylum and class, as set out in the table below.

    Rang Les plantes Algues Champignons Animaux Bacteria [3]
    Division/Phylum -phyta -mycota
    Subdivision/Subphylum -phytina -mycotina
    Classer -opsida -phyceae -mycetes -ia
    Sous-classe -idae -phycidae -mycetidae -idae
    Superorder -anae
    Commander -ales -ales
    Sous-ordre -ineae -ineae
    Infra-commande -aria
    Superfamily -acea -oidea
    Epifamily -oidae
    Famille -aceae -idae -aceae
    Sous-famille -oideae -inae -oideae
    Infrafamily -odd
    Tribe -eae -ini -eae
    Subtribe -inae -ina -inae
    Infratribe -ad

    • In botany and mycology names at the rank of family and below are based on the name of a genus, sometimes called the type genus of that taxon, with a standard ending. For example, the rose family Rosaceae is named after the genus Rosa, with the standard ending "-aceae" for a family. Names above the rank of family are formed from a family name, or are descriptive (like Gymnospermae or Fungi).
    • For animals, there are standard suffixes for taxa only up to the rank of superfamily. [4]
    • The taxonomic system is based on the rules of Latin, so forming a name based on a generic name may be not straightforward. For example, the Latin "homo" has the genitive "hominis", thus the genus "Homo" (human) is in the Hominidae, not "Homidae".
    • The ranks of epifamily, infrafamily and infratribe (in animals) are used where the complexities of phyletic branching require finer-than-usual distinctions. Although they fall below the rank of superfamily, they are not regulated under the International Code of Zoological Nomenclature and hence do not have formal standard endings. The suffixes listed here are regular, but informal. [5]

    Below is a sample taxonomy provided to show how various taxonomic ranks are used. It is used here for illustrative purposes only and may not be current or complete.

    • Phylum Protozoa
    • Subphylum Plasmodroma
    • Classer Mastigophora
    • Sous-classe Phytomastigina
    • Commander Chloromonadina
    • Commander Cryptomonadina
    • Commander Dinoflagellata
    • Commander Euglenoidina
    • Commander Phytomonadina
    • Sous-classe Zoomastigina
    • Commander Hypermastigina
    • Commander Polymastigina
    • Commander Protomonadina
    • Commander Rhizomastigina
    • Classer Sporozoa
    • Sous-classe Cnidosporidia
    • Commander Actinomyxidia
    • Commander Helicosporidia
    • Commander Microsporidia
    • Commander Myxosporidia
    • Sous-classe Haplosporidia
    • Sous-classe Sarcosporidia
    • Sous-classe Telosporidia
    • Commander Coccidia
    • Commander Gregarinida
    • Commander Haemosporidia
    • Classer Sarcodina
    • Commander Amoebina
    • Commander Foraminifera
    • Commander Heliozoa
    • Commander Mycetozoa
    • Commander Proteomyxa
    • Commander Radiolaria
    • Commander Testacea
    • Subphylum Ciliophora
    • Classer Ciliata
    • Sous-classe Protociliata
    • Sous-classe Euciliata
    • Commander Chonotricha
    • Commander Holotricha
    • Sous-ordre Apostomea
    • Sous-ordre Astomata
    • Sous-ordre Gymnostomata
    • Sous-ordre Hymenostomata
    • Sous-ordre Thigmostomata
    • Commander Peritricha
    • Sous-ordre Sessilia
    • Sous-ordre Mobilia
    • Commander Spirotricha
    • Sous-ordre Ctenostomata
    • Sous-ordre Heterotricha
    • Sous-ordre Hypotricha
    • Sous-ordre Oligotricha
    • Classer Suctoria
    • Phylum Porifera
    • Classer Calcarea
    • Commander Homocoela
    • Commander Heterocoela
    • Classer Hexactinellida
    • Commander Hexasterophora
    • Commander Amphidicophora
    • Classer Démospongies
    • Sous-classe Tetractinellida
    • Sous-classe Monaxonida
    • Sous-classe Keratosa
    • Phylum Coelenterata
    • Classer Hydrozoa
    • Commander Hydroida
    • Sous-ordre Anthomedusae
    • Sous-ordre Leptomedusae
    • Sous-ordre Limnomedusae
    • Commander Hydrocorallina
    • Sous-ordre Milleporina
    • Sous-ordreStylasterina
    • Commander Trachylina
    • Sous-ordre Trachymedusae
    • Sous-ordre Narcomedusae
    • Sous-ordre Pteromedusae
    • Commander Siphonophora
    • Classer Scyphozoa
    • Commander Stauromedusae
    • Commander Cubomedusae
    • Commander Coronatae
    • Commander Discomedusae
    • Sous-ordre Semaeostomae
    • Sous-ordre Rhizostomae
    • Classer Anthozoa
    • Sous-classe Alcyonaria
    • Commander Alcyonacea
    • Commander Coenothecalia
    • Commander Gorgonacea
    • Commander Pennatulacea
    • Commander Stolonifera
    • Commander Telestacea
    • Sous-classe Zoantharia
    • Commander Actiniaire
    • Sous-ordre Actinaria
    • Sous-ordre Ptychodactiaria
    • Sous-ordre Corallimorpharia
    • Commander Madreporaria
    • Commander Zonanthidea
    • Commander Antipatharia
    • Commander Ceriantharia
    1. ↑ McKenna, Malcolm C., and Bell, Susan K. 1997. Classification of Mammals Above the Species Level. Columbia University Press, New York, 631 pp. ISBN0-231-11013-8
    2. ↑Mammal classification at Wikipedia
    3. ↑ SP Lapage, PHA Sneath, EF Lessel, VBD Skerman, HPR Seeliger, and WA Clark (editors). 1992. International Code of Nomenclature of Bacteria (Bacteriological Code, 1990 Revision). Washington (DC): ASM Press. ISBN-10: 1-55581-039-X Bacteriologocal Code (1990 Revision)
    4. ↑ ICZN article 27.2
    5. ↑ As supplied by Eugene S. Gaffney & Peter A. Meylan (1988), "A phylogeny of turtles", in M.J. Benton (ed.), The Phylogeny and Classification of the Tetrapods, Volume 1: Amphibians, Reptiles, Birds 157-219 (Oxford: Clarendon Press).

    The three Codes listed below are the governing documents on how the taxonomic ranks are used and scientific names are applied. They're rather technical documents, but if you're really interested in the rules of taxonomy and nomenclature there is no more authoritative source.


    Voir la vidéo: et Les espèces et la taxonomie (Février 2023).